是否有需要遵循的基因序列限制/设计指南?

重复结构、极端 GC 含量和均聚物是合成问题的主要影响因素。我们使用机器学习方法来确定成功概率。因此,在大多数情况下,序列排斥的原因并非单一。相反,复杂性或排斥源于多种特征的结合,这些特征共同导致了序列的复杂性。唯一的硬性规定如下:

  • 避免均聚物 >= 14 bp

  • 请勿包括 CcdB(II 型毒素-抗毒素系统)

如果遇到问题,我们建议删除或减少重复、极端 GC 含量的区域和均聚物。如果您的序列复杂、无法构建或包含与我们的内部流程相冲突的序列,我们将强调需要关注的区域。


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如何将氨基酸序列转化为核酸序列?

我们的网站将接受氨基酸序列,并将其转化为 DNA 序列之后进行合成。请在“上传序列”页面中选择“氨基酸序列”选项。

 

请确保您输入的仅包含氨基酸单字母字符。我们仅支持标准的 20 个单字母代码字符。

氨基酸序列末尾的“*”表示终止密码子(我们不会自动添加终止密码子)

将根据您选择的密码子使用频率表,选择最常用的密码子。

如果您未找到所需的特定生物体,请联系 customersupport@twistbioscience.com 获得帮助。

克隆基因注意事项:并非所有的 Twist 表达载体在插入点上游都含有标准表达机制。我们建议您在选择需要的载体后,点击“下载序列”,再次检查最终质粒构建体的序列。

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基因评分结果有什么含义?

在我们的网站上提交您的基因序列后,将自动对基因序列进行组装可行性评分:

标准: 未发现错误。基因序列的总体复杂程度(如长度、GC 含量、同源性等)为“标准”。

复杂: 未发现错误。存在一些序列复杂性(如长度、GC 含量、同源性等),但我们预计在合成您的基因时不会出现任何问题。在极少数情况下,序列可能会有周转时间增加或制造失败的风险。

错误:基因序列存在错误。请单击序列,详细了解如何解决存在的错误。

不可接受: 该序列包含的元素会导致我们无法合成。请参阅错误信息提供的详细说明,或参考设计指南。

关于评分系统

我们的评分系统利用机器学习模型分析并结合多个序列参数(即总 GC 百分比、最大均聚物长度、最大重复长度、序列长度、重复密度等)。该模型使用我们的历史制造数据进行打磨,它可以更精确地估计基因和抗体产品的生产成功率

关于 ISSUE 信息

警告:经机器学习模型预测,与失败的风险相关。警告次数越多,越有可能导致“不可接受”得分。

错误: 与基因复杂性无关,可以通过改正基因设计来进行修复


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Twist 目前提供哪些长度的合成 DNA 用于合成?

客户可以选择订购寡核苷酸池、基因片段和克隆基因。

寡核苷酸池中的寡核苷酸(线性单链 DNA)大小范围为 20 - 300 bp。

基因片段为线性双链 DNA,其大小范围为 300 - 5,000 bp。

克隆基因为双链 DNA,已经被克隆到 Twist 的载体或客户提供的定制载体中。克隆基因大小范围为 300 - 5,000 bp。


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