cfDNA 文库制备试剂盒(配合使用 TrueAmp 聚合酶预混液)

为可靠、可扩展的 cfDNA 工作流程提供经过工程化改造的性能保障。

通过简化的工作流程从具有挑战性的 cfDNA 起始量生成高质量的文库,为罕见变异检测提供高转化率和灵敏度。Twist cfDNA 文库制备试剂盒专为低起始量和片段化样本而设计,可帮助您可靠、高效地获取关键见解。

产品数据

使用 PCR 进行高保真度扩增

具备媲美“无 PCR 扩增”错误率的高保真扩增:使用 Twist TrueAmp 聚合酶制备的 cfDNA 文库,在所有检测的碱基变化中,其碱基替换错误率与无 PCR 处理的 cfDNA 文库基本相当。

更高的转换率 = 更高的收益率

Twist cfDNA 文库制备试剂盒可提供更高的 cfDNA 文库产量。文库生成后,用 20μL 水洗脱样本,然后用 QubitTM dsDNA 宽范围试剂盒对 1μL 所得液体进行定量。

更高的灵敏度,更高的精度

Twist cfDNA 文库制备和 Hyb 混合试剂盒可在低至 0.25% VAF 的条件下灵敏、准确地进行检测。利用 50 kb 肿瘤学组合进行的单重捕获可靶向 217 个 SNP。遗失变异体是指在可检测到的位点总数中,变异体家族 <1 的位点。

改进的双工功能 = 更高的复杂性

Twist cfDNA 文库制备和 Hyb 混合试剂盒可在使用或不使用 UMI 重复数据删除技术的情况下均可提供更高的文库复杂性。利用优化的 TE 工作流程,使用 50 kb 肿瘤学组合进行的单重捕获可靶向 cfDNA 标准材料中的变异体位点。

使用原生 cfDNA 验证低起始量

Twist cfDNA 文库制备试剂盒能利用原生 cfDNA 样本获得更高的 cfDNA 文库产量。文库生成后,用 20 μL 的水对样本进行洗脱,然后用 QubitTM dsDNA 宽检测范围试剂盒对 1 μL 所得液体进行定量。

图 1. 使用与不使用 TrueAmp 扩增的碱基置换错误率比较。通过采用 Twist cfDNA 泛癌种参照标准品 v2 作为起始量样本,并使用 Twist cfDNA 文库制备试剂盒成功构建了测序文库。在无 PCR 处理组的连接步骤中,使用了全长双端唯一标签 (UDI) 接头;而在 PCR 处理组的连接步骤中,则使用了 Twist 通用接头。PCR 处理组使用 Twist TrueAmp 聚合酶预混液和 UDI 引物进行 6 个循环的扩增。对文库进行合并、测序和分析。结果显示无 PCR 文库与 TrueAmp 扩增文库的错误率相当。

图 2. Twist cfDNA 文库制备试剂盒可提供更高的 cfDNA 文库产量。文库生成后,用 20 μL 的水对样本进行洗脱,然后用 Qubit™ dsDNA 宽检测范围试剂盒对 1 μL 所得液体进行定量。

图 3. Twist cfDNA 文库制备和 Hyb 混合试剂盒可在 0.25% VAF 的条件下灵敏、准确地检测变异。用定制的 50kb 肿瘤学组合(靶向泛癌种标准品中的 217 个 SNP 变异位点)捕获单重文库。变异体遗失的计算方法是将变异体家族少于 1 个的位点总和除以可检测到的变异体位点总数。

图 4. Twist cfDNA 文库制备和 Hyb 混合试剂盒可在使用或不使用 UMI 重复数据删除技术的情况下均可提供更高的复杂性。

Figure 5. Twist cfDNA 文库制备试剂盒能利用原生 cfDNA 样本获得更高的 cfDNA 文库产量。文库生成后,用 20 μL 的水对样本进行洗脱,然后用 Qubit™ dsDNA 宽检测范围试剂盒对 1 μL 所得液体进行定量。

cfDNA 文库制备试剂盒(配合使用 TrueAmp 聚合酶预混液)工作流程

cfDNA 工作流程利用工程化改造的 GC 平衡和高保真扩增技术。此设计可在实现高扩增产量的同时,最大程度减少 PCR 引入的错误,这些错误可能影响低频变异的检测。

 

其结果是能在快速(2 小时)的工作流程中获得均一、高质量的文库。基于适配体的热启动控制技术为自动化操作提供了室温稳定性,而单管 2× 混合母液简化了 WGS 和靶向富集工作流程。

cfDNA Workflow Kit
Powered by Translations.com GlobalLink Web Software