Twist TrueAmp 文库制备方案为 NGS 靶向富集流程提供稳定、高质量的文库,尤其擅长应对具有挑战性的低起始量样本。该流程采用 Twist TrueAmp 聚合酶驱动,并针对酶切片段化进行优化,可实现高转化效率、低 GC 偏倚及均衡的覆盖度,从而支持在复杂基因组区域实现精准的变异鉴定。
TrueAmp 文库制备方案能在低起始量、降解的 FFPE DNA 样本中,提供更高的捕获前产出、更稳定的文库片段大小和更强的平均靶标覆盖度,有效保持文库复杂性,并通过具有挑战性的样品增加可靠的测序结果。
Twist TrueAmp 文库制备方案实现了更优的覆盖均一性,并减少了零覆盖区域。更低的靶标脱落率,确保关键区域能被稳定测序,提升结果可信度。
Twist TrueAmp 聚合酶预混液可在高 GC 和低 GC 区域提供更均一的覆盖,即使在增加 PCR 循环数时也能保持稳定性能。
Twist TrueAmp 文库制备试剂盒可在广泛的样本起始量范围内,产生稳定的 DNA 文库片段大小,支持混合起始量工作流程,同时确保大规模应用下覆盖均一、结果可重复。
Twist TrueAmp 文库制备试剂盒可在广泛的样本起始量范围内,产生稳定、重复性高的 DNA 文库片段大小,确保测序结果与下游分析的可信度。
图 1. 通过对低起始量、已降解 FFPE 样本(DIN 值<2.2)的富集文库进行性能比较,TrueAmp 文库制备试剂盒相较于竞品 K 试剂盒,在挑战性样本应用中展现出卓越表现。(A) Twist TrueAmp 文库制备试剂盒可产生卓越的捕获前文库产量,体现了优异的文库构建与扩增效率。(B) The Twist TrueAmp Library Preparation Kit shows higher library complexity when compared with the competitor's kits. 这意味着文库中具有更多可供测序的独特 DNA 分子,从而有效降低测序成本。(C) 实现更高的覆盖率。
图 2. 通过对低起始量、已降解 FFPE 样本(DIN 值<2.2)的富集文库进行性能比较,TrueAmp 文库制备试剂盒相较于竞品 K 试剂盒,在挑战性样本应用中展现出卓越表现。(A) 提供出色的覆盖均一性,通过较低的基于第 80 百分位数的碱基罚分来衡量。(B) 无覆盖的区域减少,以零覆盖目标区域百分比衡量。
图 3. 归一化 GC 偏差曲线显示 Twist TrueAmp 聚合酶的覆盖范围提升。使用 Twist TrueAmp 文库制备试剂盒制备文库,并采用不同聚合酶及循环数进行扩增。
上检测组合图: 比较不同聚合酶在 3 个 PCR 循环下,针对 GC 窗口的归一化覆盖度。
下检测组合图: 比较不同聚合酶在 16 个 PCR 循环下,针对 GC 窗口的归一化覆盖度。
图 4. Twist TrueAmp 文库制备试剂盒在不同超低起始量下仍保持稳定的文库片段大小。
将 500 ng、100 ng、50 ng、10 ng 及 1 ng (gDNA) 样本于 32℃ 分别进行片段化处理,并分别采用 3、5、6、8、10 和 14 个 PCR 循环进行扩增。所有样本均设置双重复实验。
A:Twist TrueAmp 文库制备试剂盒生成的 NGS 文库电泳图。
B:不同起始量的 DNA 扩增后的文库浓度。
Figure 5. Twist TrueAmp 文库制备试剂盒的可调性。
A: 使用不同片段化时间生成的五个 NGS 文库电泳图。50 ng 高质量 gDNA 在 32℃ 下进行不同时长的片段化,并使用 6 个 PCR 循环进行扩增。
B: 插入片段中位大小与时间关系。在 32℃ 下将 50 ng 高质量 gDNA 进行不同时长的片段化。使用 6 个 PCR 循环进行扩增。使用 Twist 外显子组 2.0 检测组合捕获样本。
TrueAmp 文库制备方案能在低起始量、降解的 FFPE DNA 样本中,提供更高的捕获前产出、更稳定的文库片段大小和更强的平均靶标覆盖度,有效保持文库复杂性,并通过具有挑战性的样品增加可靠的测序结果。
图 1. 通过对低起始量、已降解 FFPE 样本(DIN 值<2.2)的富集文库进行性能比较,TrueAmp 文库制备试剂盒相较于竞品 K 试剂盒,在挑战性样本应用中展现出卓越表现。(A) Twist TrueAmp 文库制备试剂盒可产生卓越的捕获前文库产量,体现了优异的文库构建与扩增效率。(B) The Twist TrueAmp Library Preparation Kit shows higher library complexity when compared with the competitor's kits. 这意味着文库中具有更多可供测序的独特 DNA 分子,从而有效降低测序成本。(C) 实现更高的覆盖率。
Twist TrueAmp 文库制备方案实现了更优的覆盖均一性,并减少了零覆盖区域。更低的靶标脱落率,确保关键区域能被稳定测序,提升结果可信度。
图 2. 通过对低起始量、已降解 FFPE 样本(DIN 值<2.2)的富集文库进行性能比较,TrueAmp 文库制备试剂盒相较于竞品 K 试剂盒,在挑战性样本应用中展现出卓越表现。(A) 提供出色的覆盖均一性,通过较低的基于第 80 百分位数的碱基罚分来衡量。(B) 无覆盖的区域减少,以零覆盖目标区域百分比衡量。
Twist TrueAmp 聚合酶预混液可在高 GC 和低 GC 区域提供更均一的覆盖,即使在增加 PCR 循环数时也能保持稳定性能。
图 3. 归一化 GC 偏差曲线显示 Twist TrueAmp 聚合酶的覆盖范围提升。使用 Twist TrueAmp 文库制备试剂盒制备文库,并采用不同聚合酶及循环数进行扩增。
上检测组合图: 比较不同聚合酶在 3 个 PCR 循环下,针对 GC 窗口的归一化覆盖度。
下检测组合图: 比较不同聚合酶在 16 个 PCR 循环下,针对 GC 窗口的归一化覆盖度。
Twist TrueAmp 文库制备试剂盒可在广泛的样本起始量范围内,产生稳定的 DNA 文库片段大小,支持混合起始量工作流程,同时确保大规模应用下覆盖均一、结果可重复。
图 4. Twist TrueAmp 文库制备试剂盒在不同超低起始量下仍保持稳定的文库片段大小。
将 500 ng、100 ng、50 ng、10 ng 及 1 ng (gDNA) 样本于 32℃ 分别进行片段化处理,并分别采用 3、5、6、8、10 和 14 个 PCR 循环进行扩增。所有样本均设置双重复实验。
A:Twist TrueAmp 文库制备试剂盒生成的 NGS 文库电泳图。
B:不同起始量的 DNA 扩增后的文库浓度。
Twist TrueAmp 文库制备试剂盒可在广泛的样本起始量范围内,产生稳定、重复性高的 DNA 文库片段大小,确保测序结果与下游分析的可信度。
Figure 5. Twist TrueAmp 文库制备试剂盒的可调性。
A: 使用不同片段化时间生成的五个 NGS 文库电泳图。50 ng 高质量 gDNA 在 32℃ 下进行不同时长的片段化,并使用 6 个 PCR 循环进行扩增。
B: 插入片段中位大小与时间关系。在 32℃ 下将 50 ng 高质量 gDNA 进行不同时长的片段化。使用 6 个 PCR 循环进行扩增。使用 Twist 外显子组 2.0 检测组合捕获样本。
活动内容
提取的样品 DNA 被精确片段化,产生稳定的、可调的插入片段大小。
优化的 Twist 连接酶可最大限度地提高转化效率,并最大限度地减少连接偏倚。
高保真扩增支持挑战性区域的高产量,并提高变异检测能力。
Twist 文库制备试剂盒通过将关键制备步骤整合为单一高效反应,可简化用于新一代测序的高质量 DNA 文库构建流程。
Twist DNA CGP 检测组合能够全面检测 SNV、插入缺失、拷贝数变异和基因重排,实现单次检测即可覆盖广泛的突变类型。
Twist Bioscience MRD Rapid 500 检测组合是一款可扩展的靶向富集解决方案,适用于微小残留病灶检测,其检测组合涵盖 50 至 500 个探针,能够实现广泛的基因组覆盖。
