高灵敏度。高转换率。低起始量

Twist cfDNA 文库制备试剂盒(配合使用 TrueAmp 聚合酶预混液),可从循环游离 DNA 中制备高质量测序文库。

Twist cfDNA 文库制备试剂盒提供了品质出众的文库制备解决方案,不仅能够在样本起始量较低的情况下实现稳健性能,而且其转化率也高。

 

优势

最大限度地检测罕见变异

  • 高转换率能够可靠地检测出罕见变异(≤0.1% VAF)
  • 与 Twist UMI 接头系统支持的双工测序工作流程兼容的高覆盖度文库

简化珍贵样本的工作流程

  • 性能稳定,即使样本起始量较低(< 1ng)也是如此
  • 2 小时内即可制成可进行测序的文库

无偏倚扩增

  • 在 GC 含量 5%-95% 的范围内均能实现稳定覆盖度,确保对复杂基因组区域及难捕获靶标的有效检出。
  • 即使在 DNA 起始量低至 100 pg 甚至更少的复杂文库中,仍能实现稳定高产。
  • 通过提高保真度和减少均聚物滑移,确保更可靠的变异识别。

为可靠、可扩展的 cfDNA 工作流程提供经过工程化改造的性能保障。

cfDNA 工作流程利用工程化改造的 GC 平衡和高保真扩增技术。此设计可在实现高扩增产量的同时,最大程度减少 PCR 引入的错误,这些错误可能影响低频变异的检测。

其结果是能在快速(2 小时)的工作流程中获得均一、高质量的文库。基于适配体的热启动控制技术为自动化操作提供了室温稳定性,而单管 2× 混合母液简化了 WGS 和靶向富集工作流程。

*仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序

Twist TrueAmp 聚合酶预混液

专为 NGS 工作流程设计的低偏倚、高保真扩增

客户评价

“我们一直在对实体器官中积累的基因突变进行基因组分析,并正在构建一种能够可靠检测体细胞突变低频变异的检测系统。By using the Twist cfDNA Library preparation kit, we not only obtain a library yield comparable to the conventional method from a small amount (1.5 ng) of fragmented DNA even if we reduce one less PCR cycle, but also increase the average coverage of the existing target capture sequence by 30% after constructing error-corrected reads using unique molecular indices. Twist's ligation process is simple and quick for library preparation and is expected to expand the application of molecular barcoding in trace systems." - Dr. Nobuyuki Kakiuchi   

日本京都大学医学研究生院病理学与肿瘤生物学系 Hakubi 项目副教授
 

结果只针对获得结果的机构,可能无法反映其他机构可取得的结果。

使用 PCR 进行高保真度扩增

具备媲美“无 PCR 扩增”错误率的高保真扩增:使用 Twist TrueAmp 聚合酶制备的 cfDNA 文库,在所有检测的碱基变化中,其碱基替换错误率与无 PCR 处理的 cfDNA 文库基本相当。该扩增工作流程保持了与无 PCR 制备方法相同的低错误水平。

图 1: 使用与不使用 TrueAmp 扩增的碱基置换错误率比较。 通过采用 Twist cfDNA 泛癌种参照标准品 v2 作为起始量样本,并使用 Twist cfDNA 文库制备试剂盒成功构建了测序文库。在无 PCR 处理组的连接步骤中,使用了全长双端唯一标签 (UDI) 接头;而在 PCR 处理组的连接步骤中,则使用了 Twist 通用接头。PCR 处理组使用 Twist TrueAmp 聚合酶预混液和 UDI 引物进行 6 个循环的扩增。对文库进行合并、测序和分析。结果显示无 PCR 文库与 TrueAmp 扩增文库的错误率相当。

更高的转换率 = 更高的收益率

Twist cfDNA 文库制备试剂盒可提供更高的 cfDNA 文库产量。

文库生成后,用 20μL 水洗脱样本,然后用 QubitTM dsDNA 宽范围试剂盒对 1μL 所得液体进行定量。

更高的灵敏度,更高的精度

Twist cfDNA 文库制备和 Hyb 混合试剂盒可在 0.25% VAF 的条件下灵敏、准确地检测变异。

用定制的 50kb 肿瘤学组合(靶向泛癌种标准品中的 217 个 SNP 变异位点)捕获单重文库。变异体遗失的计算方法是将变异体家族少于 1 个的位点总和除以可检测到的变异体位点总数。

改进的双工功能 = 更高的复杂性

Twist cfDNA 文库制备和 Hyb 混合试剂盒可在使用或不使用 UMI 重复数据删除技术的情况下均可提供更高的复杂性。

利用定制的 50 kb 肿瘤检测组合,以 cfDNA 标准材料中的变异体位点为目标,结合现有或更新的 TE 建议,对文库进行单倍捕获。

使用原生 cfDNA 验证低起始量

Twist cfDNA 文库制备试剂盒能利用原生 cfDNA 样本获得更高的 cfDNA 文库产量。

文库生成后,用 20 μL 的水对样本进行洗脱,然后用 QubitTM dsDNA 宽检测范围试剂盒对 1 μL 所得液体进行定量。

通过 Twist cfDNA LP 试剂盒进行靶向捕获,可以灵敏地检测游离 DNA 中的突变
利用循环肿瘤 DNA 预测葡萄膜黑色素瘤的预后

Twist cfDNA 文库制备试剂盒(配合使用 TrueAmp 聚合酶预混液)产品说明书

Twist 提供的 T4 DNA 连接酶

优化文库制备试剂盒和工作流程,提高 cfDNA 测序灵敏度

cfDNA 文库制备试剂盒数据表

Twist Bioscience cfDNA 文库制备试剂盒的亮点
Twist 致力于研究癌症早期检测和监测解决方案

利用 Twist UMI 接头系统进行 Twist cfDNA 文库制备
Twist cfDNA 文库制备(配合使用TrueAmp聚合酶预混液)靶向富集标准杂交方案
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