为可靠、可扩展的 cfDNA 工作流程提供经过工程化改造的性能保障。
cfDNA 工作流程利用工程化改造的 GC 平衡和高保真扩增技术。此设计可在实现高扩增产量的同时,最大程度减少 PCR 引入的错误,这些错误可能影响低频变异的检测。
Twist cfDNA 文库制备试剂盒(配合使用 TrueAmp 聚合酶预混液),可从循环游离 DNA 中制备高质量测序文库。
Twist cfDNA 文库制备试剂盒提供了品质出众的文库制备解决方案,不仅能够在样本起始量较低的情况下实现稳健性能,而且其转化率也高。
为可靠、可扩展的 cfDNA 工作流程提供经过工程化改造的性能保障。
cfDNA 工作流程利用工程化改造的 GC 平衡和高保真扩增技术。此设计可在实现高扩增产量的同时,最大程度减少 PCR 引入的错误,这些错误可能影响低频变异的检测。
其结果是能在快速(2 小时)的工作流程中获得均一、高质量的文库。基于适配体的热启动控制技术为自动化操作提供了室温稳定性,而单管 2× 混合母液简化了 WGS 和靶向富集工作流程。
*仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序
客户评价
“我们一直在对实体器官中积累的基因突变进行基因组分析,并正在构建一种能够可靠检测体细胞突变低频变异的检测系统。By using the Twist cfDNA Library preparation kit, we not only obtain a library yield comparable to the conventional method from a small amount (1.5 ng) of fragmented DNA even if we reduce one less PCR cycle, but also increase the average coverage of the existing target capture sequence by 30% after constructing error-corrected reads using unique molecular indices. Twist's ligation process is simple and quick for library preparation and is expected to expand the application of molecular barcoding in trace systems." - Dr. Nobuyuki Kakiuchi
日本京都大学医学研究生院病理学与肿瘤生物学系 Hakubi 项目副教授
结果只针对获得结果的机构,可能无法反映其他机构可取得的结果。
使用 PCR 进行高保真度扩增
具备媲美“无 PCR 扩增”错误率的高保真扩增:使用 Twist TrueAmp 聚合酶制备的 cfDNA 文库,在所有检测的碱基变化中,其碱基替换错误率与无 PCR 处理的 cfDNA 文库基本相当。该扩增工作流程保持了与无 PCR 制备方法相同的低错误水平。
图 1: 使用与不使用 TrueAmp 扩增的碱基置换错误率比较。 通过采用 Twist cfDNA 泛癌种参照标准品 v2 作为起始量样本,并使用 Twist cfDNA 文库制备试剂盒成功构建了测序文库。在无 PCR 处理组的连接步骤中,使用了全长双端唯一标签 (UDI) 接头;而在 PCR 处理组的连接步骤中,则使用了 Twist 通用接头。PCR 处理组使用 Twist TrueAmp 聚合酶预混液和 UDI 引物进行 6 个循环的扩增。对文库进行合并、测序和分析。结果显示无 PCR 文库与 TrueAmp 扩增文库的错误率相当。
更高的转换率 = 更高的收益率
文库生成后,用 20μL 水洗脱样本,然后用 QubitTM dsDNA 宽范围试剂盒对 1μL 所得液体进行定量。
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更高的灵敏度,更高的精度
用定制的 50kb 肿瘤学组合(靶向泛癌种标准品中的 217 个 SNP 变异位点)捕获单重文库。变异体遗失的计算方法是将变异体家族少于 1 个的位点总和除以可检测到的变异体位点总数。
改进的双工功能 = 更高的复杂性
利用定制的 50 kb 肿瘤检测组合,以 cfDNA 标准材料中的变异体位点为目标,结合现有或更新的 TE 建议,对文库进行单倍捕获。
使用原生 cfDNA 验证低起始量
文库生成后,用 20 μL 的水对样本进行洗脱,然后用 QubitTM dsDNA 宽检测范围试剂盒对 1 μL 所得液体进行定量。
