概述 数据 群体遗传学 农业基因组学 订购 资源
概述

超高通量测序的简化工作流程

Twist 的 FlexPrepTM UHT 文库制备试剂盒为群体研究、农业基因组学和其他超高通量应用提供了传统基于微阵列技术的新一代测序替代方案。通过将 Twist 的 Normalization by LigationTM (NBL) 技术与酶切片段化相结合,试剂盒可对各种 DNA 起始量进行内置的样本归一化处理,从而降低了典型样本处理步骤的成本和复杂性。早期的样本条形码可将 12 个独立样本汇集到一个反应中,从而简化工作流程,提高效率。

探索 Twist 的超高通量测序方法

一体化
Normalization by Ligation (NBL)
消除前期归一化
无需进行中间定量
使用多种起始量(30 ng 至 300 ng)处理样本批次
尽早汇集样本可节约成本
尽早汇集样本可节约成本
连接反应后,将 96 个样本集中到 8 个试管中
上游反应体积微型化
减少下游消耗品
超高容量混样建库
专为超高容量混样建库而设计
利用超高通量标签功能,消除每个流动槽通道的混样建库限制
利用现有实验室设置将容量提高 12 倍*
每个靶向富集反应可支持 96 个样本

仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。
*基于 8 与 96 孔工作流程

即刻体验 FlexPrep,最低仅需 $20

利用 Twist 服务实验室为您的下一个项目生成数据。

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FlexPrep UHT 产品说明书

查看我们最高通量文库制备试剂盒的产品规格及相关数据。

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FlexPrep 用于群体基因组学研究

了解 FlexPrep 如何实现高通量人类基因分型,以及其与基因芯片相比的情况。

下载应用程序说明

 

用于农业基因组学的 FlexPrep

在我们的应用说明中,您可以了解 Twist 捕获 panel 与 FlexPrep 相结合的方案,与 70k 牛基因芯片相比有何特点。

下载应用程序说明

 

 

准备好开始了吗? 

 

获取报价    请与我们联系  

 

 

常见问题解答

什么是 Normalization by Ligation?
有哪些样本类型和物种演示数据可供下载?
对于 DNA 起始材料和数量有什么建议?
对于 DNA 质量有什么建议?
我可以一次制备少于 192 个样本吗?

超高通量测序的简化工作流程

Twist 的 FlexPrepTM UHT 文库制备试剂盒为群体研究、农业基因组学和其他超高通量应用提供了传统基于微阵列技术的新一代测序替代方案。通过将 Twist 的 Normalization by LigationTM (NBL) 技术与酶切片段化相结合,试剂盒可对各种 DNA 起始量进行内置的样本归一化处理,从而降低了典型样本处理步骤的成本和复杂性。早期的样本条形码可将 12 个独立样本汇集到一个反应中,从而简化工作流程,提高效率。

探索 Twist 的超高通量测序方法

一体化
Normalization by Ligation (NBL)
消除前期归一化
无需进行中间定量
使用多种起始量(30 ng 至 300 ng)处理样本批次
尽早汇集样本可节约成本
尽早汇集样本可节约成本
连接反应后,将 96 个样本集中到 8 个试管中
上游反应体积微型化
减少下游消耗品
超高容量混样建库
专为超高容量混样建库而设计
利用超高通量标签功能,消除每个流动槽通道的混样建库限制
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仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。
*基于 8 与 96 孔工作流程

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有哪些样本类型和物种演示数据可供下载?
对于 DNA 起始材料和数量有什么建议?
对于 DNA 质量有什么建议?
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数据
综合归一化消除步骤

Twist FlexPrepTM UHT 文库制备试剂盒采用了一种新的 Normalization by LigationTM 方法,无需进行
前期和中期样本定量,简化了您的测序工作流程。

说明
简化工作流程

在一个孔中为一个样本制备片段化和连接反应。在连接过程中使用的接头包含嵌入条形码,允许将所有 12 个孔合并为 96 孔板的一排。单个池通过 PCR 添加标签 (UDI) 制备,由此进行池级拆分。通过在一个试剂盒的单次测序运行中运行多达 1,152 个样本,可充分提高测序通量。这一效率的提高还可转化为节省成本和耗材。

图
使用 FlexPrep UHT* 的标准化产量

输入不同 DNA 质量的新一代测序读数深度归一化。每个文库识别的总测序片段计数的百分比是在按双端唯一标签和嵌入条形码拆分后计算的。完全归一化后的平均值估计为 1.04% (100/96)。

图
目标区域的可调覆盖度*

FlexPrep UHT 生成的高复杂度文库在靶向富集后具有均一覆盖度。FlexPrep 与 Twist 定制组合相结合,支持以可调覆盖深度测序 SNP、k-mer、结构变异和其他基因组目标区域。对富集材料进行测序后,将数据截取至平均 75x 的覆盖度。报告了 Picard 的关键靶向富集指标。

在文库制备中使用 96-plex
30 ng 至 300 ng gDNA 起始量进行靶向富集
在 75x 原始靶标覆盖度下的指标
平均 +/- 标准差
选定碱基
平均靶向覆盖度
嵌合体
Fold 80 碱基罚分
覆盖度为 10X 的碱基
覆盖度为 20X 的碱基
覆盖度为 0X 的碱基
79.22% +/- 0.54%
32.74 +/- 4.78
1.31% +/- 0.38%
1.416 +/- 0.044
96.06% +/- 0.94%
85.41% +/- 6.36%
0.43% +/- 0.04%

*使用的方法:在 Illumina NextSeq 550 上测序之前,使用 Twist FlexPrep UHT 文库制备试剂盒和 FlexPrep 靶向富集实验方案(用一个定制的 800kb 组合进行 96-plex 富集),用人类基因组 DNA (gDNA) (NA12878) 制备 96 个文库。在各个混合文库中,使用 30 ng 至 300 ng 的可变起始量生成了 8 个混合文库,每个混合文库包含 12 个样本。**标准试剂盒基于依次使用酶切片段化、连接和 PCR 的工作流程  ***所有图表、数字和图基于 2024 年 9 月的 Twist 内部数据。仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。

综合归一化消除步骤

Twist FlexPrepTM UHT 文库制备试剂盒采用了一种新的 Normalization by LigationTM 方法,无需进行
前期和中期样本定量,简化了您的测序工作流程。

说明
简化工作流程

在一个孔中为一个样本制备片段化和连接反应。在连接过程中使用的接头包含嵌入条形码,允许将所有 12 个孔合并为 96 孔板的一排。单个池通过 PCR 添加标签 (UDI) 制备,由此进行池级拆分。通过在一个试剂盒的单次测序运行中运行多达 1,152 个样本,可充分提高测序通量。这一效率的提高还可转化为节省成本和耗材。

图
使用 FlexPrep UHT* 的标准化产量

输入不同 DNA 质量的新一代测序读数深度归一化。每个文库识别的总测序片段计数的百分比是在按双端唯一标签和嵌入条形码拆分后计算的。完全归一化后的平均值估计为 1.04% (100/96)。

图
目标区域的可调覆盖度*

FlexPrep UHT 生成的高复杂度文库在靶向富集后具有均一覆盖度。FlexPrep 与 Twist 定制组合相结合,支持以可调覆盖深度测序 SNP、k-mer、结构变异和其他基因组目标区域。对富集材料进行测序后,将数据截取至平均 75x 的覆盖度。报告了 Picard 的关键靶向富集指标。

在文库制备中使用 96-plex
30 ng 至 300 ng gDNA 起始量进行靶向富集
在 75x 原始靶标覆盖度下的指标
平均 +/- 标准差
选定碱基
平均靶向覆盖度
嵌合体
Fold 80 碱基罚分
覆盖度为 10X 的碱基
覆盖度为 20X 的碱基
覆盖度为 0X 的碱基
79.22% +/- 0.54%
32.74 +/- 4.78
1.31% +/- 0.38%
1.416 +/- 0.044
96.06% +/- 0.94%
85.41% +/- 6.36%
0.43% +/- 0.04%

*使用的方法:在 Illumina NextSeq 550 上测序之前,使用 Twist FlexPrep UHT 文库制备试剂盒和 FlexPrep 靶向富集实验方案(用一个定制的 800kb 组合进行 96-plex 富集),用人类基因组 DNA (gDNA) (NA12878) 制备 96 个文库。在各个混合文库中,使用 30 ng 至 300 ng 的可变起始量生成了 8 个混合文库,每个混合文库包含 12 个样本。**标准试剂盒基于依次使用酶切片段化、连接和 PCR 的工作流程  ***所有图表、数字和图基于 2024 年 9 月的 Twist 内部数据。仅供研究使用。不适用于任何诊断或临床程序。

群体基因组学

用于人类群体基因组学的 FlexPrep

凭借其高效且成本效益高的处理大型队列的能力,FlexPrep 旨在满足全基因组关联研究(GWAS)、遗传多样性研究及其他高通量基因组学项目的独特需求。

尽管很多 PopGen 项目都已采用了 NGS 技术,但 FlexPrep 等新工具可以尽量提高当今测序平台的通量,降低每个数据点的成本。

新一代测序与传统变异筛选研究平台的优势对比

  搭配 FlexPrep 的新一代测序 标准 NGS
通量 一次可对 1,152 个样本进行测序;支持 96-plex 富集 利用有限的多重富集,每个孔通常可处理一个文库
工作流程复杂度 连接反应归一化,支持 30-300 ng 量级 DNA 输入 - 无需归一化 更多前期和中间步骤,包括定量、归一化
耗材使用量 样本混合使吸头和试剂使用量降低 12 倍 吸头和试剂使用量增加,造成浪费量和成本增加

测序

Element Biosciences

通过运用 Trinity Freestyle™ 杂交试剂盒,FlexPrep 最大限度地提升了 Element 测序仪的通量能力。该工作流程将 FlexPrep 简易工作流程节省的时间与测序仪上 Trinity 富集化学技术实现的免操作时间相结合。

靶向富集

Twist 基因分型组合(人) - 600k:

靶向富集

Twist 基因分型组合 - 人 600k 实现与阵列数据的高度一致性。将所有数据(测序或阵列)插补至 Gencove 6.1 版插补参比组合后获得的全基因组非参比一致性 (NRC)。

分析

Gencove

为简化人类群体基因组学研究,Twist 与 Gencove 开展了合作。将 FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit 与 Gencove 的填补流程相结合,能够在降低测序覆盖度的情况下实现高置信度的变异检测,同时最大化效率和通量,让您能够以极高的准确性从基因分型数据中获得有价值的见解,且降低测序成本。

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凭借其高效且成本效益高的处理大型队列的能力,FlexPrep 旨在满足全基因组关联研究(GWAS)、遗传多样性研究及其他高通量基因组学项目的独特需求。

尽管很多 PopGen 项目都已采用了 NGS 技术,但 FlexPrep 等新工具可以尽量提高当今测序平台的通量,降低每个数据点的成本。

新一代测序与传统变异筛选研究平台的优势对比

  搭配 FlexPrep 的新一代测序 标准 NGS
通量 一次可对 1,152 个样本进行测序;支持 96-plex 富集 利用有限的多重富集,每个孔通常可处理一个文库
工作流程复杂度 连接反应归一化,支持 30-300 ng 量级 DNA 输入 - 无需归一化 更多前期和中间步骤,包括定量、归一化
耗材使用量 样本混合使吸头和试剂使用量降低 12 倍 吸头和试剂使用量增加,造成浪费量和成本增加

测序

Element Biosciences

通过运用 Trinity Freestyle™ 杂交试剂盒,FlexPrep 最大限度地提升了 Element 测序仪的通量能力。该工作流程将 FlexPrep 简易工作流程节省的时间与测序仪上 Trinity 富集化学技术实现的免操作时间相结合。

靶向富集

Twist 基因分型组合(人) - 600k:

靶向富集

Twist 基因分型组合 - 人 600k 实现与阵列数据的高度一致性。将所有数据(测序或阵列)插补至 Gencove 6.1 版插补参比组合后获得的全基因组非参比一致性 (NRC)。

分析

Gencove

为简化人类群体基因组学研究,Twist 与 Gencove 开展了合作。将 FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit 与 Gencove 的填补流程相结合,能够在降低测序覆盖度的情况下实现高置信度的变异检测,同时最大化效率和通量,让您能够以极高的准确性从基因分型数据中获得有价值的见解,且降低测序成本。

群体基因组学
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FlexPrep 用于群体基因组学研究

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农业基因组学

用于农业基因组学的 FlexPrep

与传统上用于农业基因组学研究的基因芯片相比,FlexPrep 凭借其低成本、内容灵活性和高通量能力,可通过单一平台实现基因分型、标志物发现与精细定位。与标准文库制备相比,跨样本类型的自标准化等工作流程的改进,使 FlexPrep 能够应对精准育种基因组选择和亲权鉴定等大型农业基因组学项目。

农业基因组学中 NGS 与传统平台的优势对比

  搭配 FlexPrep 的新一代测序 基因芯片
数据完整性  在全基因组或选定区域实现全面、碱基对分辨率分析 仅限于预先选定的变异体;不适合用于新型变异体的检测
内容定制 采用快速 TAT,可轻松定制组合产品——针对任何基因、区域或物种 内容为固定或半定制;任何更改均需重新设计并重新制造
成本和产量 由于多重基因编辑技术(每次运行可处理多达 1152 个样本),大规模操作时每个样本的成本更低 成本在大型项目或涉及多个物种时难以有效控制

 

Twist Workflow for Agrigenomics

Extraction

Twist DNA Purification Kit

The Twist DNA Purification Kit module streamlines sample prep by taking even challenging, “dirty” samples directly into FlexPrep library preparation. Built on an innovative single-wash extraction chemistry, the kit eliminates the traditional bind–wash–elute cycle—reducing hands-on time, consumable use, and workflow complexity.

Sold as a bundled workflow with FlexPrep, the Twist FlexPrep UHT Pure Ag DNA LP Kit simplifies DNA extraction without compromising quality.

Extraction

测序

Element Biosciences

通过运用 Trinity Freestyle™ 杂交试剂盒,FlexPrep 最大限度地提升了 Element 测序仪的通量能力。该工作流程将 FlexPrep 简易工作流程节省的时间与 Trinity 技术实现的测序仪上富集功能所提供的免操作时间相结合。

分析

Curio Genomics

Scale your agrigenomics research with FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit for low-pass sequencing and Curio Genomics for streamlined analysis. 借助 Curio Genomics 平台,Twist 灵活的文库制备无缝集成,提供高通量处理和高效填充,从而能够在大量群体中实现经济高效的基因分型。

 

curio genomics

Gencove

将 FlexPrep™ UHT Library Preparation Kit 与 Gencove 的填补流程相结合,能够在降低测序覆盖度的情况下实现高置信度的变异检测,同时最大化效率和通量,让您能够以极高的准确性从基因分型数据中获得有价值的见解,且降低测序成本。

Gencove

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FlexPrep UHT Pure Ag DNA LP Kit

Streamline sample prep and tackle dirty samples with a seamless extraction and library prep workflow.

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与传统上用于农业基因组学研究的基因芯片相比,FlexPrep 凭借其低成本、内容灵活性和高通量能力,可通过单一平台实现基因分型、标志物发现与精细定位。与标准文库制备相比,跨样本类型的自标准化等工作流程的改进,使 FlexPrep 能够应对精准育种基因组选择和亲权鉴定等大型农业基因组学项目。

农业基因组学中 NGS 与传统平台的优势对比

  搭配 FlexPrep 的新一代测序 基因芯片
数据完整性  在全基因组或选定区域实现全面、碱基对分辨率分析 仅限于预先选定的变异体;不适合用于新型变异体的检测
内容定制 采用快速 TAT,可轻松定制组合产品——针对任何基因、区域或物种 内容为固定或半定制;任何更改均需重新设计并重新制造
成本和产量 由于多重基因编辑技术(每次运行可处理多达 1152 个样本),大规模操作时每个样本的成本更低 成本在大型项目或涉及多个物种时难以有效控制

 

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Twist DNA Purification Kit

The Twist DNA Purification Kit module streamlines sample prep by taking even challenging, “dirty” samples directly into FlexPrep library preparation. Built on an innovative single-wash extraction chemistry, the kit eliminates the traditional bind–wash–elute cycle—reducing hands-on time, consumable use, and workflow complexity.

Sold as a bundled workflow with FlexPrep, the Twist FlexPrep UHT Pure Ag DNA LP Kit simplifies DNA extraction without compromising quality.

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Curio Genomics

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产品 SKU

109220

Twist FlexPrep™ UHT 文库制备试剂盒,192 个样本

109223

Twist FlexPrep™ UHT LP 和杂交试剂盒,192 个样本

109224

Twist FlexPrep™ UHT 文库制备试剂盒,1152 个样本

109226

Twist FlexPrep™ UHT LP 和杂交试剂盒,1152 个样本

127857

Twist FlexPrep™ UHT Pure Ag DNA LP Kit, 192 Samples

127858

Twist FlexPrep™ UHT Pure Ag DNA LP and Hyb Kit, 192 Samples

127859

Twist FlexPrep™ UHT Pure Ag DNA LP Kit, 1152 Samples

127861

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