提高 CNV 检测率

外显子组测序是分析基因组蛋白质编码区的强大工具,覆盖人类基因组中约 1%–2% 的碱基。虽然这使得基因分析比全基因组测序更有效,但却遗漏了大的基因间区域--这可能会给检测拷贝数变异 (CNV) 带来挑战。

CNV 在许多遗传疾病中起着至关重要的作用,但标准外显子组测序缺乏均匀分布的探针来可靠地对其进行识别。

Twist CNV 骨架加标组合旨在通过向基因组中添加间隔规则的探针来改进 CNV 检测能力。提供三种分辨率级别 ——100 kb、50 kb 和 25 kb,这些检测组合可让研究人员根据自身具体需求精细调整CNV分析。

将 CNV 骨架加标组合整合到您的外显子组工作流程中非常简单,只需将其与您的外显子组组合混合,并遵循 Twist 的标准靶向富集方案即可。

主要优势

微调 CNV 分辨率

  • 可选择 100 kb(低分辨率)、50 kb(中分辨率)或 25 kb(高分辨率)。
  • 探针战略性地排列在基因间区域,以加强 CNV 检测能力。
  • 轻松添加到外显子组组合中,改进全外显子组测序。

与 Twist 外显子组解决方案无缝整合

  • 专为搭配 Twist Exome 2.0 + 全面加标组合而设计。
  • 提供 2 次反应(16 个样本)和 12 次反应(96 个样本)两种规格

选择所需的 CNV 分辨率

CNV 骨架加标组合: 25 kb 50 kb 100 kb
组合设计大小 (Mb) 8.32 3.33 1.39
SNV 和 INDEL 已检出 265138 207765 181956
所有 CNV 均已检出 472 446 411
小于 50 kb 的 CNV 被称为 417 385 361
平均靶向覆盖度 150 171 161

Table 1 Description

表 1. Twist CNV 骨架内标检测组合示例数据。采用已知含有拷贝数变异(CNV)的高度特征化样本集(1)和由 12 名健康个体组成的基线样本集,在 Illumina NovaSeq 6000 平台上以 2×150 bp 读长进行测序。测定了每个组合添加到 Twist 外显子组 2.0 plus 全面加标中后,在每个探针密度下被检出的 SNV、INDEL 和 CNV 的平均数量和测序深度。CNV 检出是通过市售软件解决方案进行的 (2)


(1)Coriell Institute 的 CNVPANEL01 - 人类 CNV 参考组合。
(2)eVai 平台(辅助工作流程),enGenome 软件。

TTwist CNV Backbone Spike-in Panels
外显子组 2.0 产品说明书

外显子组 2.0 互动技术说明
Twist CNV Backbone Spike-in Panel .bed 文件

采用酶切片段化和 Twist 通用接头系统的文库制备 EF 2.0
TTwist Target Enrichment Standard Hybridization v2 Protocol

利用 Twist CNV 骨架加标组合和外显子组进行细胞遗传学研究
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