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Twist Bioscience HQ
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South San Francisco, CA 94080
用于 SARS-CoV-2 检测和表征的 NGS 靶向捕获
使用 Twist SARS-CoV-2 研究组合的靶向富集功能可检测病毒并分析整个病毒基因组的突变情况
SARS-CoV-2（一种单链 RNA 病毒）是造成 2019/2020 年冠状病毒疫情的病原体。逆转录 PCR (RT-PCR) 是一种利用引物扩增 SARS-CoV-2 病毒的目标区域来检测 COVID-19 病例的快速方法。然而，还需要进行高灵敏度检测，以便能够表征包括突变在内的整个病毒基因组，从而监测病毒随时间推移的传播和进化。为了满足这一需求，我们设计了一个捕获组合，其中包含靶向完整 SARS-CoV-2 (MN908947.3) 参考基因组的探针。在本应用说明中，我们展示了对低至 10 个拷贝数病毒样本的检测，其富集倍数大于 100,000，富集后病毒基因组 99.9% 以上的区域具有 1X 及以上的覆盖；并鉴定了在 SARS-CoV-2 质控品 MN908947.3 中的突变。
本应用指南中涵盖
Twist SARS-CoV-2 研究组合的设计
SARS-CoV-2 基因组捕获效率分析
使用 Twist SARS-CoV-2 研究组合检测病毒突变
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