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在此,我们试图利用 Twist 的高质量寡核苷酸合成、捕获解决方案和数据驱动的方法解决靶向甲基化测序的困难,获得了高均一性的靶向探针组合。我们使用 Twist 新开发的甲基化特异性基线设计算法和靶向甲基化测序方案,展示了各种大小组合的高效指标。我们使用获得的数据和反馈,实施了具有不同严谨度的更优的默认设计能力。虽然芯片仍广泛用于甲基化检测,但对于一些甲基化靶标的检测,包括探索动态和细胞特异性甲基化靶标,以及探索发生在不甚了解的非编码区、意义不明的单碱基对甲基化靶标,高质量靶向富集组合相对于固定的芯片设计提供了一种具有吸引力的替代检测方式。
本应用指南中涵盖
分析组合特性和大小对捕获效率和测序质量的影响
采用 Twist 适应性组合设计算法调整组合的性能
低甲基化和高甲基化对捕获性能的影响
Twist 靶向甲基化测序与其他检测的相容性
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