基因
寡核苷酸池
新一代测序 (NGS)
基因突变文库
抗体
IVDR 解决方案
海报
Twist Bioscience HQ
681 Gateway Blvd
South San Francisco, CA 94080
通过 UMI 和靶向富集快速、高灵敏度检测致癌变异体
ESHG 2022 海报展示
背景/目的：
早期检测可以显著改善许多癌症的临床结果，但目前许多最好的筛查方法都需要侵入性程序。一种前景广阔的替代方法是从血浆中进行无细胞 DNA (cfDNA) 的液体活检。由于肿瘤通常向循环中释放相对大量的 DNA，因此可以通过识别 cfDNA 中的致癌变异体来检测癌症。这一过程通常需要极其深入的测序，并且在许多情况下受到新一代测序 (NGS) 准确性的限制。
方法：
克服这一限制的一种方法就是使用的唯一分子标识符 (UMI)，即在制备 NGS 文库之前唯一标记每个输入 DNA 分子的短序列。这种方法可以通过标记 DNA 分子的每条原始链来进一步改进，这种技术被称为双测序，可以纠正早期 PCR 错误和/或单链 DNA 损伤事件。本文我们描述了一个新的文库制备系统，该系统结合了短的离散 UMI 序列，最大程度地增大测序距离，从而纠正错误。
结果：
结果该系统能够决定 NGS 文库的转换效率。我们使用Twist cfDNA 泛癌症参考标准模拟健康背景下的低比例肿瘤 DNA，证明了对各种致癌取代、缺失突变和结构变体的高度敏感性。我们使用未经修饰的人 cfDNA 证实了基线错误率，并在合成生物学应用中使用该系统测定了突变频率。
结论：
总之，本研究证实了 UMI 在 NGS 各种应用中的实用性。
