Codonoptimierung

We have moved beyond simple codon frequency tables. Our new algorithm prioritizes biological expression by focusing on:

• mRNA Stability
• Secondary Structure
• Ribosome Processivity

We have decoupled manufacturability parameters from the core optimization to focus primarily on protein expression. However, if the algorithm cannot find a manufacturable solution, it will automatically attempt to fix localized regions of extreme complexity. We do this while minimizing any impact on the expression profile.

Important: While we optimize for the best possible DNA composition, please remember that protein expression is multifactorial; DNA sequence is just one of many variables influencing your final yield.

Derzeit sind wir nicht in der Lage, Gene zu synthetisieren, die als nicht möglich eingestuft werden. Es gibt mehrere Faktoren, die dazu führen, dass unser Algorithmus ein Gen als nicht möglich einstuft, und die spezifischen Parameter sind für die Gensequenz eindeutig. Unser Algorithmus ist proprietär und wurde mithilfe von maschinellem Lernen entwickelt. Zusätzlich zum maschinellen Lernen berücksichtigt unser Algorithmus die folgenden Faktoren:

• %GC zwischen 25 und 65 %
• maximale Homopolymerlänge < 10
• geringe Homologie

Eine einzigartige Kombination der oben genannten Faktoren reflektiert den spezifischen Gensequenz-Score „Nicht möglich“.

Twist supports over 150 organisms, including most frequently used organisms such as E. coli, human, CHO, mouse and yeast.

We have moved beyond simple codon frequency tables. Our new algorithm prioritizes biological expression by focusing on:

• mRNA Stability
• Secondary Structure
• Ribosome Processivity

We have decoupled manufacturability parameters from the core optimization to focus primarily on protein expression. However, if the algorithm cannot find a manufacturable solution, it will automatically attempt to fix localized regions of extreme complexity. We do this while minimizing any impact on the expression profile.

Important: While we optimize for the best possible DNA composition, please remember that protein expression is multifactorial; DNA sequence is just one of many variables influencing your final yield.

Derzeit sind wir nicht in der Lage, Gene zu synthetisieren, die als nicht möglich eingestuft werden. Es gibt mehrere Faktoren, die dazu führen, dass unser Algorithmus ein Gen als nicht möglich einstuft, und die spezifischen Parameter sind für die Gensequenz eindeutig. Unser Algorithmus ist proprietär und wurde mithilfe von maschinellem Lernen entwickelt. Zusätzlich zum maschinellen Lernen berücksichtigt unser Algorithmus die folgenden Faktoren:

• %GC zwischen 25 und 65 %
• maximale Homopolymerlänge < 10
• geringe Homologie

Eine einzigartige Kombination der oben genannten Faktoren reflektiert den spezifischen Gensequenz-Score „Nicht möglich“.

Twist supports over 150 organisms, including most frequently used organisms such as E. coli, human, CHO, mouse and yeast.