Methylierte UMI-Adapter
- Wie sieht die Adapterstruktur der methylierten UMIs aus?
- Wie viele Basen haben die UMI-Sequenzen?
- Sind die UMI-Sequenzen verfügbar?
- Sind die methylierten UMIs mit NEB EM-seq kompatibel?
- Haben Sie eine Anleitung für die Verarbeitung von Sequenzierungsdaten, die mit den methylierten UMIs erzeugt wurden?
- Sind methylierte UMIs sowohl mit gDNA als auch cfDNA kompatibel?
Libraryvorbereitung
- Bietet Twist Kits für die Libraryvorbereitung an, die eine enzymatische Fragmentierung verwenden?
- Bietet Twist Kits für die Libraryvorbereitung an, die eine mechanische Fragmentierung verwenden?
- Wie ist das Verhältnis von Adapter zu DNA-Fragmenten im Ligationsschritt?
- Welche Größe wird für DNA-Fragmente empfohlen, wenn ich eine nicht von Twist bereitgestellte Methode für die Libraryvorbereitung verwende?
- Welche vollständigen Kit-Konfigurationen für die NGS-Libraryvorbereitung und -Anreicherung bietet Twist an?
- Kann ich mit den Twist Kits Libraries für die Sequenzierung des gesamten Genoms erstellen?
- Sind Twist Adapter mit Fragmentierungsmethoden auf enzymatischer und mechanischer Basis kompatibel?
- Können einzelne Komponenten der Anreicherungskits separat erworben werden?
Methylierung
- Welche Fragmentierungsmethode kann ich in diesem Workflow verwenden?
- Was ist die empfohlene Fragmentgröße?
- Was ist die endgültige Library-Größe?
- Was ist meine erwartete endgültige Library-Ausbeute?
- Gibt es interne Kontrollen, um die Methylierungskonversion zu testen?
- Was ist die minimale/maximale DNA-Eingabe für die Libraryvorbereitung?
- Kann ich den Standard-Hybridisierungs-Workflow zur Anreicherung verwenden?
- Kann ich Libraries im Capture multiplexen? Wenn ja, welche Librarymenge wird benötigt?
- Welche Modifizierungen am Protokoll können vorgenommen werden, um die Hybrid-Capture-Verfahren zu optimieren?
- Was ist die empfohlene Anzahl von Amplifikationszyklen nach dem Capture-Verfahren?
- Soll ich den Methylierungs-Enhancer verwenden?
Target Enrichment
- Gibt es eine maximale Menge an DNA, die ich in die Hybridisierung einbringen kann? Kann ich mehr als 1.500 ng DNA hinzufügen?
- Was sind die Sequenzen der Post-Capture-Amplifikationsprimer im NGS-Kit?
- Wie hoch ist die Konzentration der in der PCR nach der Anreicherung verwendeten Amplifikationsprimer?
- Kann ich Twist Universal Blockers mit anderen Adaptern verwenden?
Allgemeines
Twist 96-Plex LP-Kit
- Welche Größen haben die Kits?
- Gibt es zusätzliche Verbrauchsmaterialien und Instrumente, die der Kunde bereitstellen muss?
- Wie kann ich ein Kit bestellen?
- Kann ich die einzelnen Komponenten des Kits bestellen?
- Welche Protokolle gibt es?
- Wie lange ist dieses Kit haltbar?
- Welchen Sequenzer sollte ich mit diesem Kit verwenden?
- Ist es möglich, weniger als 96 Proben auf einmal vorzubereiten?
- Wie lauten die Empfehlungen für den DNA-Input, die Qualität und die Quantität?
- Sind mit dem Kit einzigartige Doppelindizes erhältlich?
- Haben Sie Empfehlungen für Ladekonzentrationen?
- Wie passt sich das Kit an Proben mit unterschiedlichem GC-Gehalt an?
- Was empfehlen Sie als Demux-Tool?
- Welche Sequenzen sollten wir für das Adapter-Trimming von 96-Plex-Librarys verwenden?
- Können 96-Plex-Librarys für die Sequenzierung mit dual indizierten Librarys gepoolt werden?
- Ist es möglich, bei einem Sequenzierungslauf nur eine Platte mit Proben zu verwenden?
- Gibt es Überlegungen zur Verwendung strukturierter Flowcells?
Twist cfDNA LP und Hyb Mix Kit
Produktkonfiguration
- What are the kit configurations of the cfDNA Library Preparation Kit?
- Welche Transport- und Lagerbedingungen gelten für das cfDNA Library Preparation Kit?
- Wie lange ist das cfDNA Library Preparation Kit haltbar?
- Können Gefrier-/Auftauzyklen beim cfDNA Library Preparation Kit ein Problem darstellen?
- Was ist nicht im cfDNA Library Preparation Kit enthalten?
Proben-Input
- Welche Menge an DNA-Input unterstützt das cfDNA Library Preparation Kit?
- Wie ermittle ich die erforderliche DNA-Menge?
- Empfiehlt sich für die Input-cDNA vor der Libraryvorbereitung eine Qualitätsprüfung?
- Kann ich bei sehr niedrigen DNA-Konzentrationen das Volumen der Input-DNA steigern?
- Kann ich mit diesem Kit Proben-DNA verwenden, bei der es sich nicht um cfDNA handelt?
- Kann ich bei DNA aus FFPE-Proben nur 1–20 ng verwenden?
Libraryvorbereitung
- Welche Vorteile bietet das cfDNA Library Preparation Kit im Vergleich zu anderen Kits?
- Wie lange dauert der Aufbau einer Library mithilfe des cfDNA Library Preparation Kits?
- Welche Arten von Sequenzierungslibrarys unterstützt das cfDNA Library Preparation Kit?
- Unterstützt das cfDNA Library Preparation Kit eindeutige molekulare Identifikatoren (UMIs)?
- Was ist, wenn ich die UMIs für das cfDNA Library Preparation Kit nicht benötige? Kann ich UDI-Adapter verwenden?
- Kann ich nach der Ligation den empfohlenen SPRI-Faktor von 0,9× anpassen?
- Warum treten in meiner cfDNA-Library-Amplifikation größere Spitzen auf?
Hybridisierung
- What plexity does the cfDNA Target Enrichment Kits?
- Wie ermittle ich die Library-Masse für das Target-Capture?
- Wie haben Sie diesen Library-Input mit dem Faktor 80× für das Target-Capture abgeleitet, und muss ich mich daran halten?
- Wie viel Masse kann ich bei einem Singleplex Target Enrichment zugeben?
- Was geschieht, wenn mehr als 12,8 μg Input-Masse für das Capture zugegeben werden?
- Wie richte ich ein 8-plex Target Enrichment mit Librarys aus verschiedenen Probenmasse-Inputs ein?
- Was empfiehlt sich bei Librarys aus Probenmasse-Inputs von über 20 ng?
