Leistungsfähige Technologie für zuverlässige, skalierbare cfDNA-Workflows
Generieren Sie hochwertige Bibliotheken aus anspruchsvollen cfDNA-Eingaben mit einem optimierten Workflow, der eine hohe Konversionsrate und Empfindlichkeit für die Detektion seltener Varianten bietet. Das für einen geringen Input und fragmentierte Proben entwickelte Twist cfDNALibrary Preparation Kit hilft Ihnen, kritische Erkenntnisse mit Zuversicht und Effizienz zu gewinnen.
Maximierte Erkennung seltener Varianten
Hohe Konvertierungsrate erkennt zuverlässig seltene Varianten (≤ 0,1 % VAF). Librarys mit hoher Abdeckung, kompatibel mit Duplex-Sequenzierungs-Workflows, die vom Twist UMI-Adaptersystem unterstützt werden.
Optimierter Arbeitsablauf für wertvolle Proben
Robuste Leistung, auch bei geringem Probeninput (<1 ng). Sequenzfertige Bibliotheken in 2 Stunden.
Amplifikation ohne Verzerrungen
Bietet eine gleichmäßige Abdeckung bei 5–95 % GC-Gehalt und bewahrt die Sichtbarkeit von herausfordernden genomischen Regionen und schwer zu erfassenden Zielen. Konsistent hohe Ausbeuten aus komplexen Librarys – selbst bei DNA-Eingaben ≤100 pg. Zuverlässige Identifizierung von Varianten dank verbesserter Genauigkeit und reduziertem Replikationsschlupf
Leistungsfähige Technologie für zuverlässige, skalierbare cfDNA-Workflows
Generieren Sie hochwertige Bibliotheken aus anspruchsvollen cfDNA-Eingaben mit einem optimierten Workflow, der eine hohe Konversionsrate und Empfindlichkeit für die Detektion seltener Varianten bietet. Das für einen geringen Input und fragmentierte Proben entwickelte Twist cfDNALibrary Preparation Kit hilft Ihnen, kritische Erkenntnisse mit Zuversicht und Effizienz zu gewinnen.
Maximierte Erkennung seltener Varianten
Hohe Konvertierungsrate erkennt zuverlässig seltene Varianten (≤ 0,1 % VAF). Librarys mit hoher Abdeckung, kompatibel mit Duplex-Sequenzierungs-Workflows, die vom Twist UMI-Adaptersystem unterstützt werden.
Optimierter Arbeitsablauf für wertvolle Proben
Robuste Leistung, auch bei geringem Probeninput (<1 ng). Sequenzfertige Bibliotheken in 2 Stunden.
Amplifikation ohne Verzerrungen
Bietet eine gleichmäßige Abdeckung bei 5–95 % GC-Gehalt und bewahrt die Sichtbarkeit von herausfordernden genomischen Regionen und schwer zu erfassenden Zielen. Konsistent hohe Ausbeuten aus komplexen Librarys – selbst bei DNA-Eingaben ≤100 pg. Zuverlässige Identifizierung von Varianten dank verbesserter Genauigkeit und reduziertem Replikationsschlupf
Produktdaten
Abbildung 1. Vergleichbarer Basensubstitutions-Fehlerraten mit und ohne TrueAmp-Amplifikation. Das Twist cfDNA Library Preparation Kit wurde verwendet, um Bibliotheken mit Twist cfDNA Pan-Cancer Referenzstandard V2 als Eingabematerial zu generieren. Um PCR-freie Bedingungen zu erzeugen, wurden während der Ligation Twist Full Length Unique Dual Index (UDI) Adapter verwendet. Die Bedingungen mit PCR wurden durch Verwendung von PCR Twist Universal Adaptern während der Ligation hergestellt. Der PCR-Aufbau wurde mit Twist TrueAmp Polymerase Mix und UDI-Primern über 6 Zyklen amplifiziert. Die Librarys wurden gepoolt, sequenziert und analysiert. Zwischen der PCR-freien und der TrueAmp-Library wurden vergleichbare Fehlerraten beobachtet.
Abbildung 2. Twist cfDNA Library Preparation Kit liefert höhere cfDNA-Library-Ausbeuten. Nach der Generierung der Library wurden die Proben in 20 μl Wasser eluiert und 1 μl wurde mit dem Qubit™ dsDNA Broad Range Kit quantifiziert.
Abbildung 3. Das Twist cfDNA Library Preparation und Hyb Mix Kit ermöglicht den empfindlichen und genauen Nachweis von Varianten bis zu 0,25 % VAF. Die Librarys wurden im Single-Plex-Verfahren mit einem benutzerdefinierten 50-kb-Onkologie-Panel erfasst, das auf 217 SNP-Variantenstellen im Pan-Cancer-Standardmaterial abzielte. Verpasste Varianten werden berechnet, indem Stellen mit weniger als 1 Variantenfamilie durch die Gesamtzahl der nachweisbaren Variantenstellen dividiert werden.
Abbildung 4. Twist cfDNA Library Preparation und Hyb Mix Kit bietet eine höhere Komplexität mit und ohne UMI-Deduplizierung.
Abbildung 5. Twist cfDNA Library Preparation Kit liefert höhere cfDNA-Library-Ausbeuten mit nativen cfDNA-Proben. Nach der Generierung der Library wurden die Proben in 20 μl Wasser eluiert und 1 μl wurde mit dem Qubit™ dsDNA Broad Range Kit quantifiziert.
cfDNA Library Prep Kit mit dem TrueAmp Polymerase Mix Workflow
Der cfDNA-Workflow basiert auf optimierter Technologie für GC-Ausgleich und hochpräzise Amplifikation. Dieses Design liefert eine hohe Amplifikationsausbeute und minimiert gleichzeitig durch PCR eingeführte Fehler, die die Erkennung von Varianten mit niedriger Frequenz beeinträchtigen können.
Das Ergebnis sind einheitliche, hochwertige Librarys am Ende eines schnellen, 2-stündigen Workflows. Die Aptamer-basierte Hot-Start-Steuerung gewährleistet Stabilität bei Raumtemperatur für die automatisierte Einrichtung, und der 2×-Mastermix in einem einzigen Röhrchen vereinfacht sowohl WGS- als auch Target Enrichment-Workflows.
Produktdaten
Abbildung 1. Vergleichbarer Basensubstitutions-Fehlerraten mit und ohne TrueAmp-Amplifikation. Das Twist cfDNA Library Preparation Kit wurde verwendet, um Bibliotheken mit Twist cfDNA Pan-Cancer Referenzstandard V2 als Eingabematerial zu generieren. Um PCR-freie Bedingungen zu erzeugen, wurden während der Ligation Twist Full Length Unique Dual Index (UDI) Adapter verwendet. Die Bedingungen mit PCR wurden durch Verwendung von PCR Twist Universal Adaptern während der Ligation hergestellt. Der PCR-Aufbau wurde mit Twist TrueAmp Polymerase Mix und UDI-Primern über 6 Zyklen amplifiziert. Die Librarys wurden gepoolt, sequenziert und analysiert. Zwischen der PCR-freien und der TrueAmp-Library wurden vergleichbare Fehlerraten beobachtet.
Abbildung 2. Twist cfDNA Library Preparation Kit liefert höhere cfDNA-Library-Ausbeuten. Nach der Generierung der Library wurden die Proben in 20 μl Wasser eluiert und 1 μl wurde mit dem Qubit™ dsDNA Broad Range Kit quantifiziert.
Abbildung 3. Das Twist cfDNA Library Preparation und Hyb Mix Kit ermöglicht den empfindlichen und genauen Nachweis von Varianten bis zu 0,25 % VAF. Die Librarys wurden im Single-Plex-Verfahren mit einem benutzerdefinierten 50-kb-Onkologie-Panel erfasst, das auf 217 SNP-Variantenstellen im Pan-Cancer-Standardmaterial abzielte. Verpasste Varianten werden berechnet, indem Stellen mit weniger als 1 Variantenfamilie durch die Gesamtzahl der nachweisbaren Variantenstellen dividiert werden.
Abbildung 4. Twist cfDNA Library Preparation und Hyb Mix Kit bietet eine höhere Komplexität mit und ohne UMI-Deduplizierung.
Abbildung 5. Twist cfDNA Library Preparation Kit liefert höhere cfDNA-Library-Ausbeuten mit nativen cfDNA-Proben. Nach der Generierung der Library wurden die Proben in 20 μl Wasser eluiert und 1 μl wurde mit dem Qubit™ dsDNA Broad Range Kit quantifiziert.
cfDNA Library Prep Kit mit dem TrueAmp Polymerase Mix Workflow
Der cfDNA-Workflow basiert auf optimierter Technologie für GC-Ausgleich und hochpräzise Amplifikation. Dieses Design liefert eine hohe Amplifikationsausbeute und minimiert gleichzeitig durch PCR eingeführte Fehler, die die Erkennung von Varianten mit niedriger Frequenz beeinträchtigen können.
Das Ergebnis sind einheitliche, hochwertige Librarys am Ende eines schnellen, 2-stündigen Workflows. Die Aptamer-basierte Hot-Start-Steuerung gewährleistet Stabilität bei Raumtemperatur für die automatisierte Einrichtung, und der 2×-Mastermix in einem einzigen Röhrchen vereinfacht sowohl WGS- als auch Target Enrichment-Workflows.
Hervorgehobene Ressourcen
Produktblatt
Protokoll
Technischer Hinweis
Hervorgehobene Ressourcen
Verwandte Workflows und Anwendungen
Target Enrichment-Workflows mit Twist liefern eine skalierbare und sehr homogene Abdeckung mit geringer Verzerrung über große und komplexe Gennomregionen und ermöglichen damit eine umfassendere Identifizierung, höhere Empfindlichkeit und größere Flexibilität als amplicon- oder arraybasierte Methoden.
Twist bietet verschiedene Tools zur Unterstützung der Forschung zu Flüssigbiopsien und zur Krebscharakterisierung.
Verwandte Workflows und Anwendungen
Target Enrichment-Workflows mit Twist liefern eine skalierbare und sehr homogene Abdeckung mit geringer Verzerrung über große und komplexe Gennomregionen und ermöglichen damit eine umfassendere Identifizierung, höhere Empfindlichkeit und größere Flexibilität als amplicon- oder arraybasierte Methoden.
Twist bietet verschiedene Tools zur Unterstützung der Forschung zu Flüssigbiopsien und zur Krebscharakterisierung.
