TrueAmp Library
Preparation Kit

Hohe Ausbeute und Abdeckung auch bei anspruchsvollsten Proben

Twist TrueAmp Library Prep liefert höhere Ausbeuten vor der Anreicherung, konsistente Librarygrößen und eine stärkere mittlere Target-Abdeckung aus geringem Input und degradierter FFPE-DNA. Diese Verbesserungen reduzieren den Bedarf an übermäßigen PCR-Zyklen, erhalten die Librarykomplexität und erhöhen die Zuverlässigkeit der Sequenzierungsergebnisse bei anspruchsvollen Proben.

Abbildung 1. Leistungsvergleich von angereicherten Librarys mit degradierten FFPE-Proben mit geringem Input (DIN <2,2) zwischen dem TrueAmp Library Preparation Kit und dem Kit eines Mitbewerbers zeigt die optimale Lösung für anspruchsvolle Probenanwendungen. (A) Das Twist TrueAmp Library Preparation Kit erzeugt eine überlegene Pre-Capture-Ausbeute, ein Indikator für hohe Effizienz in Libraryerstellung und Amplifikation. (B) Das Twist TrueAmp Library Preparation Kit zeigt eine höhere Librarykomplexität im Vergleich zu Kits des Mitbewerbers. Dies ermöglicht eine größere Anzahl einzigartiger DNA-Moleküle, die in der Library sequenziert werden können, und reduziert so die Sequenzierungskosten. (C) Erreicht eine höhere Abdeckung.

Homogene Abdeckung mit weniger verpassten Zielregionen

Twist TrueAmp Library Prep liefert eine verbesserte Abdeckungshomogenität und weniger Bereiche mit null Abdeckung. Reduzierte Zielausfälle erhöhen die Sicherheit, dass kritische Regionen konsistent sequenziert werden.

Abbildung 2. Leistungsvergleich von angereicherten Librarys mit degradierten FFPE-Proben mit geringem Input (DIN <2,2) zwischen dem TrueAmp Library Preparation Kit und dem Kit eines Mitbewerbers zeigt die optimale Lösung für anspruchsvolle Probenanwendungen. (A) Liefert eine hervorragende Abdeckungshomogenität, gemessen an einer niedrigeren Fold-80 Base Penalty. (B) Reduzierte Regionen ohne Abdeckung, gemessen am prozentualen Anteil von Zielen ohne Abdeckung.

Verbesserte Abdeckung über GC-Extreme hinweg

Der Twist TrueAmp Polymerase Mix liefert eine homogenere Abdeckung in GC-reichen und GC-armen Regionen und behält die Leistung auch bei erhöhten PCR-Zyklen bei.

Abbildung 3. Normalisierte GC-Bias-Kurve mit verbesserter Abdeckung durch die Twist TrueAmp Polymerase. Librarys wurden mit dem Twist TrueAmp Library Preparation Kit hergestellt und mit unterschiedlichen Polymerasen und Zykluszahlen amplifiziert.

Oberes Panel: Diagramme der normalisierten Abdeckung in Abhängigkeit vom GC-Gehalt zum Vergleich der Polymerasen bei 3 PCR-Zyklen.


Unteres Panel: Diagramme der normalisierten Abdeckung in Abhängigkeit vom GC-Gehalt zum Vergleich der Polymerasen bei 16 PCR-Zyklen.

Für konsistente Ergebnisse über unterschiedliche Inputs und Workflows entwickelt

Twist TrueAmp Library Preparation Kits liefern konsistente DNA-Libraryfragmentgrößen über ein breites Spektrum an Proben-Inputs hinweg, ermöglichen gemischte Input-Workflows und gewährleisten gleichzeitig eine homogene Abdeckung sowie reproduzierbare Ergebnisse in großem Maßstab.

Abbildung 4. Zuverlässige Librarygröße mit dem Twist TrueAmp Library Prep Kit, selbst bei extrem geringen Input-Mengen.

500 ng, 100 ng, 50 ng, 10 ng, 1 ng und 0,1 ng (gDNA) wurden bei 32 °C unterschiedlich lange fragmentiert. Zur Amplifikation wurden jeweils 3, 5, 6, 8, 10 bzw. 14 PCR-Zyklen eingesetzt. Die Proben wurden in Duplikaten durchgeführt.

A: Elektropherogramme von NGS-Librarys, die mit dem Twist TrueAmp Library Preparation Kit erzeugt wurden.


B: Konzentration der Librarys nach der Amplifikation bei unterschiedlichen DNA-Inputs.

Kontrollierte Insert-Größen für anpassbare Leistung

Twist TrueAmp Library Preparation Kit liefert reproduzierbare DNA-Libraryfragmentgrößen über einen breiten Bereich von Input-Mengen und sorgt so für zuverlässige Sequenzierungsergebnisse und nachgelagerte Analysen.

Abbildung 5. Anpassbarkeit des Twist TrueAmp Library Prep Kits.

A: Fünf Elektropherogramme von NGS-Librarys, die mit unterschiedlichen Fragmentierungszeiten erzeugt wurden. 50 ng hochwertige gDNA wurden bei 32 °C unterschiedlich lange fragmentiert. Zur Amplifikation wurden 6 PCR-Zyklen verwendet.

B: Median der Insert-Größe in Abhängigkeit von der Zeit. 50 ng hochwertige gDNA wurden bei 32 °C unterschiedlich lange fragmentiert. Die Amplifikation erfolgte mit 6 PCR-Zyklen. Die Proben wurden mit dem Twist Exome 2.0 Panel erfasst.