Geringe Verzerrung, hochpräzise Amplifikation, entwickelt für NGS-Workflows.
Twist TrueAmp Polymerase wurde für die NGS-Library-Amplifikation entwickelt und liefert eine gleichmäßige Abdeckung über GC-Extreme, hohe Empfindlichkeit bei geringem Input und automatisierbare Hot-Start-Leistung.
Optimierte Amplifikationstechnologie, um die Komplexität der Library zu bewahren
Viele PCR-Enzyme sind für die Anwendung mit spezifischen Amplicons optimiert (qPCR, Klonierung) und nicht für komplexe NGS-Librarys.
Ein neuer Ansatz mit TrueAmp
Diese speziell entwickelte DNA-Polymerase mit Proofreading-Funktion und hoher Prozessierbarkeit bietet höchste GC-Gleichmäßigkeit, Ausbeute und Genauigkeit für die Library-Amplifikation.
Das Ergebnis
Weniger Verzerrungen bei kurzen, GC-neutralen Molekülen und mehr nutzbare Daten pro Durchlauf.
Wichtigste Merkmale
- 2×-Mastermix in einem einzigen Röhrchen für vereinfachte Einrichtung und weniger Handhabungsfehler
- Geeignet für die Amplifikation vor und nach der Erfassung
- Für Hybridisierungsworkflows am selben Tag oder über Nacht mit Twist TE Kits konzipiert
- Validiert mit Twist Reagenzien für Libraryvorbereitung und Target Enrichment, um durchgängig konsistente Leistung zu gewährleisten
Die Twist cfDNA mit dem TrueAmp Polymerase Library Prep Kit ermöglicht eine robuste Leistung bei geringen Probenmengen.
Geringe Verzerrung, hochpräzise Amplifikation, entwickelt für NGS-Workflows.
Twist TrueAmp Polymerase wurde für die NGS-Library-Amplifikation entwickelt und liefert eine gleichmäßige Abdeckung über GC-Extreme, hohe Empfindlichkeit bei geringem Input und automatisierbare Hot-Start-Leistung.
Die Twist cfDNA mit dem TrueAmp Polymerase Library Prep Kit ermöglicht eine robuste Leistung bei geringen Probenmengen.
Optimierte Amplifikationstechnologie, um die Komplexität der Library zu bewahren
Viele PCR-Enzyme sind für die Anwendung mit spezifischen Amplicons optimiert (qPCR, Klonierung) und nicht für komplexe NGS-Librarys.
Ein neuer Ansatz mit TrueAmp
Diese speziell entwickelte DNA-Polymerase mit Proofreading-Funktion und hoher Prozessierbarkeit bietet höchste GC-Gleichmäßigkeit, Ausbeute und Genauigkeit für die Library-Amplifikation.
Das Ergebnis
Weniger Verzerrungen bei kurzen, GC-neutralen Molekülen und mehr nutzbare Daten pro Durchlauf.
Wichtigste Merkmale
- 2×-Mastermix in einem einzigen Röhrchen für vereinfachte Einrichtung und weniger Handhabungsfehler
- Geeignet für die Amplifikation vor und nach der Erfassung
- Für Hybridisierungsworkflows am selben Tag oder über Nacht mit Twist TE Kits konzipiert
- Validiert mit Twist Reagenzien für Libraryvorbereitung und Target Enrichment, um durchgängig konsistente Leistung zu gewährleisten
TrueAmp gewährleistet eine gleichbleibende Abdeckung, wo es bei anderen zum Dropout kommt, senkt die Sequenzierungskosten und erhält schwierige Zielsequenzen.
Abbildung 1: GC-normalisierte Abdeckung; AT-reiche C. difficile und GC-reiche B. pertussis.
Dank verbesserter Effizienz erreicht TrueAmp die gewünschte Ausbeute in weniger Zyklen, sodass zyklusbedingte Artefakte vermieden werden können. Sie bietet zuverlässige Ergebnisse für Librarys mit geringer Ausbeute, die typisch für die Post-Capture-PCR sind.
Abbildung 2: serielle Verdünnungen von 1 ng bis 100 fg, QK mit Qubit und TapeStation.
Diese speziell entwickelte DNA-Polymerase mit Proofreading-Funktion reduziert C→T-Fehleinbau, die oft durch Cytosin-Desaminierung verursacht werden, und begrenzt den Replikationsschlupf über lange Homopolymere – entscheidend für die Erkennung sensibler Varianten.
Abbildung 3: Substitutionsraten nach Einbau von > 7 Mio. Basen; Homopolymer-Auslesung unter Verwendung von klonalen Plasmiden von Twist.
Magnetische Beads werden häufig zur Reinigung und Größenselektion verwendet, können jedoch die PCR hemmen und die Ausbeute verringern. Wie in Abbildung 4 gezeigt, gewährleistet Twist TrueAmp Polymerase Mix höhere Sequenzierungslesezahlen als andere Polymerasen bei steigenden Bead-Konzentrationen (6,25–50 μl). Diese hohe Bead-Toleranz vereinfacht Arbeitsabläufe, reduziert Nacharbeit und gewährleistet eine konstante Datenqualität.
Abbildung 4. Toleranz gegenüber paramagnetischen Beads während der PCR. PCR-Reaktionen wurden mit 6,25 μl, 12,5 μl, 25 μl und 50 μl MyOne T1 Beads, M270 Beads (Invitrogen) und Twist DNA-Aufreinigungs-Beads versetzt. Die Reaktionsausbeuten wurden nach der Entfernung der Beads aufgereinigt und mit dem Qubit dsDNA Broad Range Assay quantifiziert.
TrueAmp gewährleistet eine gleichbleibende Abdeckung, wo es bei anderen zum Dropout kommt, senkt die Sequenzierungskosten und erhält schwierige Zielsequenzen.
Abbildung 1: GC-normalisierte Abdeckung; AT-reiche C. difficile und GC-reiche B. pertussis.
Dank verbesserter Effizienz erreicht TrueAmp die gewünschte Ausbeute in weniger Zyklen, sodass zyklusbedingte Artefakte vermieden werden können. Sie bietet zuverlässige Ergebnisse für Librarys mit geringer Ausbeute, die typisch für die Post-Capture-PCR sind.
Abbildung 2: serielle Verdünnungen von 1 ng bis 100 fg, QK mit Qubit und TapeStation.
Diese speziell entwickelte DNA-Polymerase mit Proofreading-Funktion reduziert C→T-Fehleinbau, die oft durch Cytosin-Desaminierung verursacht werden, und begrenzt den Replikationsschlupf über lange Homopolymere – entscheidend für die Erkennung sensibler Varianten.
Abbildung 3: Substitutionsraten nach Einbau von > 7 Mio. Basen; Homopolymer-Auslesung unter Verwendung von klonalen Plasmiden von Twist.
Magnetische Beads werden häufig zur Reinigung und Größenselektion verwendet, können jedoch die PCR hemmen und die Ausbeute verringern. Wie in Abbildung 4 gezeigt, gewährleistet Twist TrueAmp Polymerase Mix höhere Sequenzierungslesezahlen als andere Polymerasen bei steigenden Bead-Konzentrationen (6,25–50 μl). Diese hohe Bead-Toleranz vereinfacht Arbeitsabläufe, reduziert Nacharbeit und gewährleistet eine konstante Datenqualität.
Abbildung 4. Toleranz gegenüber paramagnetischen Beads während der PCR. PCR-Reaktionen wurden mit 6,25 μl, 12,5 μl, 25 μl und 50 μl MyOne T1 Beads, M270 Beads (Invitrogen) und Twist DNA-Aufreinigungs-Beads versetzt. Die Reaktionsausbeuten wurden nach der Entfernung der Beads aufgereinigt und mit dem Qubit dsDNA Broad Range Assay quantifiziert.
Die Flüssigbiopsie ermöglicht eine minimal-invasive Detektion von Biomarkern, z. B. in cfDNA und RNA, Blut, Plasma oder Urin. In Kombination mit NGS ermöglicht die Technologie hochsensible Einblicke in den Krankheitsverlauf aus begrenzten, fragmentierten Proben.
Fortschritte bei der Libraryvorbereitung erweitern die Möglichkeiten zum Nachweis von Biomarkern. TrueAmp Polymerase sorgt für eine robuste Ausbeute, eine verzerrungsarme Amplifikation sowie hohe Genauigkeit bei geringen cfDNA-Eingaben und trägt so dazu bei, die nutzbaren Daten für diese Workflows zu maximieren.
Erfahren Sie mehr über die Vorteile der cfDNA-Libraryvorbereitung mit TrueAmp Polymerase für die Flüssigbiopsie-Forschung mit geringen Probenmengen.
Die Flüssigbiopsie ermöglicht eine minimal-invasive Detektion von Biomarkern, z. B. in cfDNA und RNA, Blut, Plasma oder Urin. In Kombination mit NGS ermöglicht die Technologie hochsensible Einblicke in den Krankheitsverlauf aus begrenzten, fragmentierten Proben.
Fortschritte bei der Libraryvorbereitung erweitern die Möglichkeiten zum Nachweis von Biomarkern. TrueAmp Polymerase sorgt für eine robuste Ausbeute, eine verzerrungsarme Amplifikation sowie hohe Genauigkeit bei geringen cfDNA-Eingaben und trägt so dazu bei, die nutzbaren Daten für diese Workflows zu maximieren.
Erfahren Sie mehr über die Vorteile der cfDNA-Libraryvorbereitung mit TrueAmp Polymerase für die Flüssigbiopsie-Forschung mit geringen Probenmengen.
Produktblatt
Protokoll
