NGS Methylation Detection Systems

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Das Twist NGS Methylation Detection System liefert eine robuste, durchgängige Probenvorbereitungslösung zur Identifizierung methylierter Regionen im menschlichen Genom. Dieser Workflow nutzt einen einzigartigen enzymatischen Prozess von New England Biolabs®, der die DNA viel weniger beschädigt, und das Twist Custom Methylation Panel-Design.

Unabhängig davon, ob Sie nun die zelluläre Differenzierung untersuchen oder Flüssigbiopsien auf Krebs untersuchen, das System bietet die effizienteste Methylierungsdetektion, die es gibt.

Eine End-to-End-Lösung

Modernste enzymatische Umwandlung von unmethylierten Cytosinen
Einheitliches Capture mit leistungsstarken benutzerdefinierten Twist-Sonden
Verbesserung von On-Target-Raten mit optimierten Reagenzien

Innovative Libraryvorbereitung

Bessere Ergebnisse von höherer Library-Komplexität und verbessertem GC-Ausgleich
Ermittelt 15 % mehr CpGs als Bisulfit-Konvertierung
Weniger Probenschäden befähigen herausforderndes Proben-Input
Einfache Integration des Workflows in bestehende Methylation Sequencing-Pipelines

Optimierte Hybridisierung-Reagenzien

Anpassung des Hybridisierung-Zeitpunkts, ohne Leistungseinbußen
Verbesserte On-Target-Raten mit Methylation Enhancer
Hybridisierung in weniger als 4 Stunden

Hocheffiziente Custom Panels*

Ausgefeiltes Design, genaue Synthese und detaillierte QK maximieren die Capture-Konformität und Reproduzierbarkeit
Gleichzeitige Erfassung von Sense-, Antisense-, methylierter und unmethylierter DNA
Herausragende Leistung über alle Panel-Größen, Zielregionen und Multiplexing-Anforderungen hinweg
Einfaches Hinzufügen bzw. Verbesserung von Panel-Inhalt

*separat verkauft

Ausschöpfung der Komplexität der Methylierung

Sprechen Sie mit einem Twist-Produktmanager und einem NEB Application Scientist und lassen Sie sich von ihnen einen Überblick über den NEB-to-Twist-Workflow verschaffen. Erfahren Sie mehr über die enzymatische Umwandlung, die Vorteile des Designansatzes der Pre-Capture-Konvertierungssonde von Twist und die Anwendbarkeit des Workflows auf klinisch relevante Probentypen.

Tools zur Verbesserung der Methylation Sequencing-Effizienz in epigenetischen Studien

Erfahren Sie mehr über den neuen Methylation Sequencing-Workflow von Twist Bioscience, der in Zusammenarbeit mit New England Biolabs entwickelt wurde. Erfahren Sie, wie dieser zu mehr Sicherheit bei der Suche nach methylierten Basen führt.

NEBNext® EM-seq™ Kit für Twist Targeted Methylation Sequencing

In Zusammenarbeit mit New England Biolabs (NEB) bietet Twist Bioscience einen neuen Methylation Sequencing-Workflow an, der die Qualität der Bibliotheken verbessert und die schädliche Bisulfit-Behandlung während der Vorbereitung überflüssig macht.

Der Workflow umfasst die enzymatische Umwandlung von unmethylierten Cytosinen (siehe Abbildung), um Stellen von Methyl-Cytosin (5mC) und Hydroxymethyl-Cytosin (5hmC) zu identifizieren.

Die enzymatische Umwandlung produziert mehr intakte Libraries mit besserer Repräsentation und erreicht letztendlich eine empfindlichere Ermittlung von Methylierung. Das System zur Libraryvorbereitung ist angemessen für die Gesamtgenomsequenzierung und die nachgelagerte Anreicherung mit Twist Methylation Panels.

Die EM-seq-Umwandlung umfasst eine Reihe enzymatischer Schritte zur Umwandlung von unmethylierten Cytosinen zu Uracilen. Das Endergebnis entspricht dem einer herkömmlichen Bisulfit-Konvertierung, wobei EM-seq mit existierenden Analyse-Pipelines kompatibel sind, die Bismark und bwa-meth verwenden.

Twist Fast Hybridization System und Custom Methylation Panels

Das Fast Hybridization and Wash Kit von Twist bietet optimale Performance and maximale Flexibilität. Reagenzien und Schritte können optimiert werden, um nachgelagerte Sequenzierungsmetriken zu verfeinern und die praktische Arbeitszeit und Pipettenanwendung zu reduzieren.

Twist Custom Methylation Panels wurden mit einem ausgefeilten Algorithmus entwickelt und erfassen Ziele mit hervorragender Effizienz über eine Reihe von Zielgrößen. Zusammen garantieren diese Komponenten überlegene Hybrid Capture von benutzerdefinierten Regionen von Interesse.

Twist Methylation Enhancer

Off-Target Capture kommt bei zielgerichteten Methylation Sequencing-Workflows oft vor, da die Konvertierungsprozesse die Sequenzkomplexität der Probe während der Libraryvorbereitung reduzieren.

Um die Erfassung von Post-Konvertierungsproben zu maximieren, umfasst das Twist NGS Methylation Detection System einen proprietären Blocker, der speziell für die Ermittlung von Methylierung entwickelt wurde. Dieser Blocker wird Methylation Enhancer genannt und reduziert das Off-Target Capture um bis zu 50 Prozent.

Hochempfindliche Ermittlung von differenziert methylierten Regionen

Die Methylierungsstufen variieren erheblich im menschlichen Genom und differenziert methylierte Regionen (DMRs) können verwendet werden, um bestimmte Krebsarten zu identifizieren.

Um die Auswirkungen der Methylierungsstufen auf die Leistung des Twist NGS Methylation Detection System zu testen, werden Libraries mit verschiedenen Methylierungsstufen (0–100 % Methylierung) durch die Kombination von hypo- und hypermethylierter genomischer DNA in definierten Verhältnissen generiert. Diese Analyse zeigte minimale Auswirkungen der Methylierungsstufen auf die finalen Sequenzierungsmetriken.

Das Twist NGS Methylation Detection System erfasst auch hypo- und hypermethylierte Regionen mit hoher Empfindlichkeit.