Mehrere zielgerichtete CRISPR-Libraries aus einem einzigen Oligo-Pool

Das funktionelle genetische Screening unter Verwendung des CRISPR/Cas9-Systems ist ein leistungsfähiges Instrument zur Interrogation der Genfunktion in großem Maßstab. Der Zugang zu und die Implementierung dieser Technologie werden jedoch durch vorhandene vordefinierte CRISPR-sgRNA-Libraries eingeschränkt. Hier wurde ein einzelner Twist Oligo Pool in Kombination mit Custom Library Multiplexed Cloning (CLUE; crispr-clue.de), einem benutzerfreundlichen Bioinformatik- und Wet-Lab-Workflow, verwendet, um zahlreiche hochwertige, benutzerdefinierte sgRNA-Libraries zu generieren. Die außergewöhnliche Genauigkeit von Twist Oligo Pools bewahrt die einheitliche Darstellung von sgRNAs in den resultierenden CLUE-Libraries ohne Library-übergreifende Kontamination und erfüllt die strengen Anforderungen für den Erfolg bei CRISPR-Analyseanwendungen.


Inhalt dieses Anwendungshinweises
Wie CLUE verwendet werden kann, um mehrere zielgerichtete Guide-Libraries zu entwerfen
Wie die Qualität der Twist Library den Erfolg beim Demultiplexen sicherstellt
Eine gezielte CRISPRi-Analyse mit 100 Guides, die aus einem größeren Pool demultiplext wurden
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