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SARS-CoV-2, ein einzelsträngiges RNA-Virus, ist die Ursache für die Coronavirus-Pandemie 2019/2020. Reverse Transcription PCR (RT-PCR) ist eine schnelle Methode zum Nachweis von COVID-19-Fällen unter Verwendung von Primern zur Amplifikation von relevanten Regionen des SARS-CoV-2-Virus. Es besteht jedoch auch Bedarf an hochempfindlichen Tests, mit denen das gesamte Virusgenom einschließlich etwaiger Mutationen charakterisiert werden kann, um die Ausbreitung und Entwicklung des Virus im Laufe der Zeit zu überwachen. Um diesem Bedarf gerecht zu werden, haben wir ein Capture-Panel entwickelt, das Sonden enthält, die auf das vollständige SARS-CoV-2-Referenzgenom (MN908947.3) abzielen. In diesem Anwendungshinweis demonstrieren wir den Nachweis von nur 10 Kopien viralen Materials mit einer mehr als 100.000-fachen Anreicherung, einer Abdeckung von mehr als 99,9 % des Genoms bei 1X oder mehr nach Anreicherung und die Identifizierung von Mutationen in der SARS-CoV-2 Kontrolle MN908947.3.
