Twist Bioscience HQ
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South San Francisco, CA 94080, USA
Wir haben versucht, die Herausforderungen von gezieltem Methylation Sequencing zu bewältigen. Dazu nutzten wir die hochwertige Oligonukleotidsynthese von Twist, die Capture-Lösungen und die datengesteuerten Methoden, die Panels mit sehr hoher Einheitlichkeit ermöglichten. Unter Verwendung des neu entwickelten methylierungsspezifischen Basislinien-Designalgorithmus von Twist und des gezielten Methylation Sequencing-Protokolls konnten wir Hochleistungsmetriken für Panels unterschiedlicher Größe demonstrieren. Mit den resultierenden Daten und Antworten haben wir optimierte Standarddesignfunktionen mit unterschiedlichen Stringenzstufen implementiert. Während Arrays bei der Methylierungsdetektion immer noch weit verbreitet sind, bieten hochwertige Target Enrichment-Panels eine attraktive Alternative zu statischen Array-Designs zur Erforschung dynamischer und zellspezifischer Methylierungsziele oder schlecht verstandener Ziele, die in schwer definierbaren nicht-codierenden Regionen bei Einzelbasenpaar-Auflösung vorzufinden sind.
