Targeted Methylation Sequencing

Herausforderungen beim gezielten Methylation Sequencing können mit Twist Custom Panels und dem gezielten Methylation Sequencing-Protokoll von Twist bewältigt werden

Wir haben versucht, die Herausforderungen von gezieltem Methylation Sequencing zu bewältigen. Dazu nutzten wir die hochwertige Oligonukleotidsynthese von Twist, die Capture-Lösungen und die datengesteuerten Methoden, die Panels mit sehr hoher Einheitlichkeit ermöglichten. Unter Verwendung des neu entwickelten methylierungsspezifischen Basislinien-Designalgorithmus von Twist und des gezielten Methylation Sequencing-Protokolls konnten wir Hochleistungsmetriken für Panels unterschiedlicher Größe demonstrieren. Mit den resultierenden Daten und Antworten haben wir optimierte Standarddesignfunktionen mit unterschiedlichen Stringenzstufen implementiert. Während Arrays bei der Methylierungsdetektion immer noch weit verbreitet sind, bieten hochwertige Target Enrichment-Panels eine attraktive Alternative zu statischen Array-Designs zur Erforschung dynamischer und zellspezifischer Methylierungsziele oder schlecht verstandener Ziele, die in schwer definierbaren nicht-codierenden Regionen bei Einzelbasenpaar-Auflösung vorzufinden sind.


Inhalt dieses Anwendungshinweises
Analyse der Auswirkungen von Panel-Eigenschaften und -Größe auf Capture-Effizienz und Sequenzierungsqualität
Optimieren der Panel-Leistung mit dem adaptiven Panel-Design-Algorithmus von Twist
Auswirkungen von Hypo- und Hyper-Methylierung auf die Capture-Leistung
Kompatibilität von Twist Targeted Methylation Sequencing mit anderen Assays
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