Kontrollen zur Erkennung der Methylierungslevel-Quantifizierung im Twist Targeted Methylation Sequencing-Workflow

Die DNA-Methylierung ist ein wichtiges epigenetisches Signal, das die Kontrolle der Genexpression unterstützt. Sie wird bei Krebserkrankungen oft fehlreguliert und ist daher zu einem wichtigen Marker in der onkologischen Forschung geworden. Die meisten gegenwärtigen Methoden zum Methylierungsnachweis beinhalten eine unterschiedliche Umwandlung von Basen (z. B. C zu T und meC zu C) während der Libraryvorbereitung. Diese Methoden können Batch-Effekte haben, die schwer zu kontrollieren sind, und daher könnten Forscher von einer Reihe bekannter Standards profitieren, die zur Kalibrierung von Methylierungsexperimenten verwendet werden können.

Twist hat genau zu diesem Zweck eine Reihe von Methylierungskontrollen entwickelt. Unsere Kontrollen können Proben zugesetzt werden, um Methylierungsmessungen zu kalibrieren. Durch die Verwendung eines Satzes von 48 orthogonalen Sequenzen mit unterschiedlichen Sequenzen, Anzahlen von CpG-Stellen und Methylierungsniveaus können Forscher die Umwandlungseffizienz quantitativ bewerten.


In diesem Poster behandelt
Twist Methylierungskontrolldesign
Kalibrierung und Qualitätskontrolle
Leistung der Methylierungskontrolle
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