Dieses Protokoll beschreibt die Schritte, die zur Vorbereitung von Libraries mit eindeutigen molekularen Identifikatoren (UMIs) erforderlich sind. Es unterstützt eine Vielzahl von Input-Typen, einschließlich kleiner DNA-Fragmente, wie zellfreie DNA (cfDNA) und genomische DNA mit hohem Molekulargewicht (gDNA). Der Workflow generiert amplifizierte, indizierte Libraries mit UMI-Tags für das nachgelagerte Target Enrichment und die Zielsequenzierung auf Illumina NGS-Systemen. Zu den Produkten, die für diesen Arbeitsablauf erforderlich sind, gehören das Twist Library Preparation Kit mit Amp Mix, die mechanische Fragmentierung und das Twist UMI Adapter System (mit Twist UMI Adaptern und Twist Unique Dual Indexed (UDI) Primern). Dieses Protokoll zur Libraryvorbereitung ist für die Verwendung mit Twist Target Enrichment Kits optimiert und sollte nur mit den angegebenen Reagenzien oder deren Äquivalenten durchgeführt werden.

Dieses Twist Library Preparation Kit enthält die Reagenzien, die zur Vorbereitung genomischer DNA-Libraries (gDNA) unter Verwendung enzymatischer gDNA-Fragmentierung und der eindeutigen molekularen Identifikatoren (UMI) erforderlich sind. Das Twist UMI Adapter System besteht aus Twist UMI Adaptern und Twist Unique Dual Indexed (UDI) Primern. In diesem Handbuch werden die Schritte zum Generieren der amplifizierten, indizierten Libraries mit UMI-Tags für das nachgelagerte Target Enrichment und die Zielsequenzierung auf Illumina NGS-Systemen beschrieben. Dieses Protokoll zur Libraryvorbereitung ist für die Verwendung mit Twist Target Enrichment Kits optimiert und sollte nur mit den angegebenen Reagenzien oder deren Äquivalenten durchgeführt werden.

TWT: EF 2.0 Fragmentierung-Mastermix-Herstellung und Zugabe zur Probe