Die DNA-Methylierung ist ein wichtiges epigenetisches Signal, das die Kontrolle der Genexpression unterstützt. Sie wird bei Krebserkrankungen oft fehlreguliert und ist daher zu einem wichtigen Marker in der onkologischen Forschung geworden. Die meisten gegenwärtigen Methoden zum Methylierungsnachweis beinhalten eine unterschiedliche Umwandlung von Basen (z. B. C zu T und meC zu C) während der Libraryvorbereitung. Diese Methoden können Batch-Effekte haben, die schwer zu kontrollieren sind, und daher könnten Forscher von einer Reihe bekannter Standards profitieren, die zur Kalibrierung von Methylierungsexperimenten verwendet werden können. Twist hat genau zu diesem Zweck eine Reihe von Methylierungskontrollen entwickelt. Unsere Kontrollen können Proben zugesetzt werden, um Methylierungsmessungen zu kalibrieren. Durch die Verwendung eines Satzes von 48 orthogonalen Sequenzen mit unterschiedlichen Sequenzen, Anzahlen von CpG-Stellen und Methylierungsniveaus können Forscher die Umwandlungseffizienz quantitativ bewerten.

Erfahren Sie mehr über die Capture-Sequenzierung mit dem RNA Exome Panel von Twist mit einer neuartigen Designstrategie.

Diagnostische Assays von Krebs in zellfreier Form (cfDNA) erfordern zuverlässige Referenzstandards zur Beurteilung der Assay-Zuverlässigkeit und -Sensitivität. Hier beschreiben wir eine Erweiterung des Twist Pan-Krebs-Referenzstandards mit einer neuartigen Kopienzahlvariante (CNV) eines gemeinsamen Krebsmachers ERBB2. Dieses Poster veranschaulicht die Zuverlässigkeit des ERBB2-CNV-Spikes und die Herausforderungen, die mit der CNV-Assay-Entwicklung einhergehen, wobei die zuverlässigsten Ergebnisse aus den proportionalen Beiträgen der Spender-ERBB2-Reads zu dem von HG38 entworfenen CNV-Spike-In stammen.