Optimización del codón

We have moved beyond simple codon frequency tables. Our new algorithm prioritizes biological expression by focusing on:

• mRNA Stability
• Secondary Structure
• Ribosome Processivity

Hemos desacoplado los parámetros de factibilidad de producción de la optimización principal para centrarnos principalmente en la expresión de proteínas. Sin embargo, si el algoritmo no puede encontrar una solución fabricable, intentará automáticamente corregir regiones localizadas de complejidad extrema. Hacemos esto al tiempo que minimizamos cualquier impacto en el perfil de expresión.

Important: Si bien realizamos optimizaciones para lograr la mejor composición de ADN posible, recuerda que la expresión de proteínas es multifactorial; la secuencia de ADN es solo una de las muchas variables que influyen en tu rendimiento final.

Actualmente, no podemos sintetizar genes que son calificados como imposibles. Hay varios factores que hacen que nuestro algoritmo califique un gen como imposible y los parámetros específicos son exclusivos de la secuencia del gen. Nuestro algoritmo está patentado y se ha desarrollado mediante aprendizaje automático. Además del aprendizaje automático, nuestro algoritmo tiene en cuenta los siguientes factores:

• %GC 25-65 %
• Longitud máxima del homopolímero < 10
• Baja homología

Una combinación única de lo anterior es un reflejo de la puntuación de secuencia genética específica de imposible.

Twist supports over 150 organisms, including most frequently used organisms such as E. coli, human, CHO, mouse and yeast.