Metilación

Lo siguientes pueden modificarse para optimizar una captura híbrida:

• Tiempo de hibridación: empezar con 2 horas según se recomienda y modificar a entre 30 minutos y 4 horas.
• Temperatura del amortiguador 1 de lavado rápido: empezar con 65 °C y ajustar a entre 63-66 °C

El rendimiento final esperado de las bibliotecas es de 50-75 ng/ul. Este rendimiento dependerá de la calidad del suministro inicial.

El kit incluye ADN pUC19 con islas CpG metiladas y ADN lambda no metilado. Estos controles pueden utilizarse para determinar la eficiencia de la conversión enzimática durante la preparación de bibliotecas.

NOTA: Los controles internos no deben incluirse en el flujo de trabajo de captura a menos que se añadan sondas específicas de los controles al panel de enriquecimiento.

Consulte la tabla: 

Se recomienda un mínimo de 10-20 ng de ADN de alta calidad y un máximo de 200 ng.

Sí, se admite la multiplexación hasta un 8 plex. Recomendamos usar 200 ng de biblioteca para un único plex y 1500 ng (o 187,5 ng cada uno) para una captura de 8 plex.

No hay detrimento en ninguna métrica de selección híbrida al usar este reactivo. Reduce los casos fuera de diana de forma variable en función de las regiones objetivo del panel de metilación personalizado y los estados de metilación del ADN genómico suministrado. También puede reducir en un 50 % los casos fuera de diana en algunos paneles personalizados.

Twist solo admite la fragmentación mecánica para esta aplicación durante la creación de las bibliotecas para la conversión de metilación.

De 200 a 300 pb

No. La captura híbrida debe realizarse con el sistema de hibridación rápida Twist.

De 350 a 450 pb

Lo siguientes pueden modificarse para optimizar una captura híbrida:

• Tiempo de hibridación: empezar con 2 horas según se recomienda y modificar a entre 30 minutos y 4 horas.
• Temperatura del amortiguador 1 de lavado rápido: empezar con 65 °C y ajustar a entre 63-66 °C

El rendimiento final esperado de las bibliotecas es de 50-75 ng/ul. Este rendimiento dependerá de la calidad del suministro inicial.

El kit incluye ADN pUC19 con islas CpG metiladas y ADN lambda no metilado. Estos controles pueden utilizarse para determinar la eficiencia de la conversión enzimática durante la preparación de bibliotecas.

NOTA: Los controles internos no deben incluirse en el flujo de trabajo de captura a menos que se añadan sondas específicas de los controles al panel de enriquecimiento.

Consulte la tabla: 

Se recomienda un mínimo de 10-20 ng de ADN de alta calidad y un máximo de 200 ng.

Sí, se admite la multiplexación hasta un 8 plex. Recomendamos usar 200 ng de biblioteca para un único plex y 1500 ng (o 187,5 ng cada uno) para una captura de 8 plex.

No hay detrimento en ninguna métrica de selección híbrida al usar este reactivo. Reduce los casos fuera de diana de forma variable en función de las regiones objetivo del panel de metilación personalizado y los estados de metilación del ADN genómico suministrado. También puede reducir en un 50 % los casos fuera de diana en algunos paneles personalizados.

Twist solo admite la fragmentación mecánica para esta aplicación durante la creación de las bibliotecas para la conversión de metilación.

De 200 a 300 pb

No. La captura híbrida debe realizarse con el sistema de hibridación rápida Twist.

De 350 a 450 pb