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Kits de secuenciación de última generación (NGS)
General
Preparación de bibliotecas
- ¿Los adaptadores Twist son compatibles con los métodos de fragmentación enzimática y mecánica?
- ¿Puedo usar los kits de Twist para crear bibliotecas para la secuenciación del genoma completo?
- ¿Puede adquirir componentes individuales de los kits de enriquecimiento por separado?
- ¿Ofrece Twist kits de preparación de bibliotecas que utilicen fragmentación enzimática?
- ¿Ofrece Twist kits de preparación de bibliotecas que utilicen fragmentación mecánica?
- Si utilizo un método de preparación de bibliotecas que no sea de Twist, ¿cuál es el tamaño recomendado de las inserciones de ADN?
- ¿Qué configuraciones de kits completos para la preparación y el enriquecimiento de bibliotecas de secuenciación de última generación (NGS) ofrece Twist?
- ¿Cuál es la relación entre el adaptador y los fragmentos de ADN en el paso de ligadura?
Adaptadores de UMI metilados
- ¿Son los UMI metilados compatibles con ADNg así como con ADNlc?
- ¿Son los UMI metilados compatibles con NEB EM-seq?
- ¿Están disponibles las secuencias de UMI?
- ¿Dispone de orientación sobre cómo procesar los datos de secuenciación generados con los UMI metilados?
- ¿Cuántas bases componen las secuencias de UMI?
- ¿Cuál es la estructura de adaptador de los UMI metilados?
Metilación
- ¿Existen controles internos para probar la conversión de metilación?
- ¿Puedo multiplexar bibliotecas en la captura? Si es así, ¿cuál es la cantidad de biblioteca necesaria?
- ¿Puedo utilizar el flujo de trabajo de hibridación estándar para el enriquecimiento?
- ¿Debo usar el potenciador de metilación?
- ¿Cuál es el número recomendado de ciclos de amplificación posteriores a la captura?
- ¿Cuál es el rendimiento final esperado de mi biblioteca?
- ¿Cuál es el tamaño final de la biblioteca?
- ¿Cuál es el mínimo/máximo de entrada de ADN para la preparación de la biblioteca?
- ¿Cuál es el tamaño de inserción recomendado?
- ¿Qué método de fragmentación puedo utilizar en este flujo de trabajo?
- ¿Qué modificaciones se pueden realizar en el protocolo para optimizar la captura híbrida?
Enriquecimiento del objetivo
- ¿Puedo usar los bloqueadores universales Twist con otros adaptadores?
- ¿Existe una cantidad máxima de ADN que puedo poner en la hibridación? ¿Puedo agregar más de 1500 ng de ADN?
- ¿Cuáles son las secuencias de los cebadores de amplificación poscaptura en el kit de secuenciación de última generación (NGS)?
- ¿Cuál es la concentración de los cebadores de amplificación utilizados en la PCR posterior al enriquecimiento?
Kit 96-plex LP Twist
- ¿Hay otros consumibles y herramientas que el cliente deba suministrar?
- ¿Hay aspectos que tener en cuenta en cuanto a usar celdas de flujo con patrones?
- ¿Hay índices duales únicos en el kit?
- ¿Se pueden agregar bibliotecas de 96-plex para la secuenciación con bibliotecas con índices duales?
- ¿Puedo pedir los componentes del kit por separado?
- ¿Tiene recomendaciones para la carga de concentraciones?
- ¿Cómo pido un kit?
- ¿Cómo se adapta el kit a las muestras con contenido de GC variable?
- ¿Es viable preparar menos de 96 muestras de una vez?
- ¿Es posible tener solo una placa de muestras en un ciclo de secuenciación?
- ¿Cuáles son los tamaños de los kits?
- ¿Cuáles son las recomendaciones para calidad, cantidad y entrada de ADN?
- ¿Qué recomienda como herramienta desmultiplexación?
- ¿Cuál es el período de validez de este kit?
- ¿Qué protocolos hay?
- ¿Qué secuenciador debería usar con este kit?
- ¿Qué secuencias debemos usar para el recorte de adaptadores de bibliotecas de 96-plex?
Kit de mezcla de hibridación y preparación de bibliotecas de ADNlc Twist
Twist TrueAmp Library Preparation Kit
- After fragmentation and end repair/dA-tailing, can samples be stored overnight before proceeding to ligation?
- Are freeze–thaw cycles acceptable for the TrueAmp reagents?
- Are there inhibitors that can impact fragmentation efficiency?
- Can I use degraded or FFPE-derived DNA with this kit?
- Can I use plasmids, PCR products or mixed amplicons with this kit?
- Can I use the TrueAmp Library Preparation Kit for bisulfite conversion or EM-seq workflows
- Can I use the TrueAmp Library Preparation Kit for cfDNA Samples?
- Can I use this kit for targeted enrichment workflows?
- Can I use this with automation platforms (Hamilton, etc.)?
- Can you help explain Insert size vs Library/Fragment size?
- Do I need to adjust fragmentation conditions based on DNA input amount?
- Do you offer customizations to the TrueAmp Library Preparation Kit?
- How do I control fragment sizes with the TrueAmp Library Preparation Kit?
- How do I optimize the amount of adapter input for each of those adapters?
- How does input DNA quality impact final insert size?
- How many PCR cycles should I use?
- Is it necessary to vortex the 10X Twist Fragmentation Enzyme Mix before use?
- What adapters and primers are compatible with the TrueAmp Library Preparation Kit?
- What conditions should I start with to achieve ~200–250 bp insert sizes?
- What input amount is recommended for library preparation using the TrueAmp Library Preparation Kit
- What is the shelf life of the TrueAmp Library Preparation Kit?
- What is the variability in fragment length we can expect from manufacturing or operator variability?
- What sample types and library preparation workflows are compatible with the TrueAmp Library Preparation Kit?
- When should I not use the TrueAmp Library Preparation Kit?
- Why are my fragment sizes smaller than expected?
- Why do I see adapter dimers or short fragments in my library?
- Why do I see multiple peaks or unexpectedly large fragments in my library?
- Why is insert size important in library preparation?
- Why is my library yield lower than expected?
Mezcla de polimerasa TrueAmp Twist
- ¿Cómo se compara un "arranque en caliente" basado en un aptámero con los métodos químicos o de anticuerpos para la inactivación enzimática de la PCR?
- ¿Cómo está diseñada la polimerasa TrueAmp Twist para el rendimiento?
- ¿Cuánto menor es la tasa de error en comparación con las polimerasas estándar de alta fidelidad?
- ¿Es la polimerasa TrueAmp Twist compatible con la secuenciación de lectura larga?
- ¿Es esta polimerasa adecuada para uso clínico o solo para investigación?
- ¿Cuáles son las condiciones de envío y almacenamiento de la polimerasa TrueAmp Twist?
- ¿Cuál es la estabilidad y la vida útil de la polimerasa TrueAmp Twist?
