Rendimiento diseñado para flujos de trabajo de ADNlc fiables y escalables
Genere bibliotecas de alta calidad a partir de entradas de ADNlc complejas con un flujo de trabajo optimizado que ofrece alta conversión y sensibilidad para la detección de variantes raras. Diseñado para muestras de baja entrada y fragmentadas, el kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist le ayuda a descubrir información crítica con confianza y eficiencia.
Maximice la detección de variantes infrecuentes
La alta tasa de conversión detecta con fiabilidad las variantes infrecuentes (≤0,1 % VAF) Bibliotecas de alta cobertura compatibles con flujos de trabajo de secuenciación dobles compatibles con el sistema de adaptadores de UMI Twist
Optimice el flujo de trabajo de las muestras valiosas
Rendimiento robusto, incluso con una entrada de muestras baja (<1 ng) Bibliotecas listas para secuencias en 2 horas.
Amplificación sin sesgo
Ofrece una cobertura uniforme en el 5 %–95 % de GC, lo que preserva la visibilidad de regiones genómicas difíciles y objetivos difíciles de capturar. Alto rendimiento constante de bibliotecas complejas, incluso a ≤100 pg de entrada de ADN. Detecte variantes con confianza a través de una mayor fidelidad y un menor deslizamiento de homopolímeros.
Rendimiento diseñado para flujos de trabajo de ADNlc fiables y escalables
Genere bibliotecas de alta calidad a partir de entradas de ADNlc complejas con un flujo de trabajo optimizado que ofrece alta conversión y sensibilidad para la detección de variantes raras. Diseñado para muestras de baja entrada y fragmentadas, el kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist le ayuda a descubrir información crítica con confianza y eficiencia.
Maximice la detección de variantes infrecuentes
La alta tasa de conversión detecta con fiabilidad las variantes infrecuentes (≤0,1 % VAF) Bibliotecas de alta cobertura compatibles con flujos de trabajo de secuenciación dobles compatibles con el sistema de adaptadores de UMI Twist
Optimice el flujo de trabajo de las muestras valiosas
Rendimiento robusto, incluso con una entrada de muestras baja (<1 ng) Bibliotecas listas para secuencias en 2 horas.
Amplificación sin sesgo
Ofrece una cobertura uniforme en el 5 %–95 % de GC, lo que preserva la visibilidad de regiones genómicas difíciles y objetivos difíciles de capturar. Alto rendimiento constante de bibliotecas complejas, incluso a ≤100 pg de entrada de ADN. Detecte variantes con confianza a través de una mayor fidelidad y un menor deslizamiento de homopolímeros.
Datos del producto
Figura 1. Tasas de error de sustitución de base comparables con y sin amplificación TrueAmp. El kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist se utilizó para generar bibliotecas con el estándar de referencia pantumoral para ADNlc Twist v2 como material de entrada. Los adaptadores de índice doble único (UDI) de longitud completa Twist se utilizaron durante la ligadura para la condición sin PCR y los adaptadores universales Twist, durante la ligadura para la condición de PCR. La condición de PCR se amplificó utilizando 6 ciclos con mezcla de polimerasa TrueAmp Twist y cebadores de UDI. Las bibliotecas se agruparon, secuenciaron y analizaron. Se observan tasas de error comparables entre las bibliotecas sin PCR y TrueAmp.
Figura 2. El kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist permite rendimientos de biblioteca de ADNlc más altos. Tras la generación de bibliotecas, las muestras se diluyeron en 20 μl de agua y 1 μl se cuantificó con Qubit™ dsDNA Broad Range Kit.
Figura 3. El kit de mezcla de hibridación y preparación de bibliotecas de ADNlc Twist permite la detección sensible y precisa de variables al 0,25 % VAF. Las bibliotecas se capturaron monoplexadas con un panel oncológico personalizado de 50 kb dirigido a los sitios de variantes de 217 SNP en el material estándar pantumoral. Las variantes ausentes se calculan sumando los sitios con menos de 1 familia de variantes y dividiendo el resultado entre el número de sitios de variantes detectables totales.
Figura 4. El kit de mezcla de hibridación y preparación de bibliotecas de ADNlc Twist proporciona una mayor complejidad con y sin deduplicación de UMI.
Figura 5. El kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist permite rendimientos de biblioteca de ADNlc más altos con muestras de ADNlc nativo. Tras la generación de bibliotecas, las muestras se diluyeron en 20 μl de agua y 1 μl se cuantificó con Qubit™ dsDNA Broad Range Kit.
Flujo de trabajo del kit de preparación de bibliotecas de ADNlc con mezcla de polimerasa TrueAmp
El flujo de trabajo de ADNlc aprovecha el equilibrio de GC diseñado por ingeniería y la amplificación de alta fidelidad. Este diseño ofrece un alto rendimiento de amplificación a la vez que minimiza los errores introducidos por PCR que pueden comprometer la detección de variantes de baja frecuencia.
El resultado son bibliotecas uniformes y de alta calidad en un flujo de trabajo rápido de 2 horas. El control de arranque en caliente basado en aptámeros proporciona estabilidad a temperatura ambiente para la configuración automatizada, mientras que la mezcla maestra de tubo único 2× agiliza los flujos de trabajo de WGS y de enriquecimiento del objetivo.
Datos del producto
Figura 1. Tasas de error de sustitución de base comparables con y sin amplificación TrueAmp. El kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist se utilizó para generar bibliotecas con el estándar de referencia pantumoral para ADNlc Twist v2 como material de entrada. Los adaptadores de índice doble único (UDI) de longitud completa Twist se utilizaron durante la ligadura para la condición sin PCR y los adaptadores universales Twist, durante la ligadura para la condición de PCR. La condición de PCR se amplificó utilizando 6 ciclos con mezcla de polimerasa TrueAmp Twist y cebadores de UDI. Las bibliotecas se agruparon, secuenciaron y analizaron. Se observan tasas de error comparables entre las bibliotecas sin PCR y TrueAmp.
Figura 2. El kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist permite rendimientos de biblioteca de ADNlc más altos. Tras la generación de bibliotecas, las muestras se diluyeron en 20 μl de agua y 1 μl se cuantificó con Qubit™ dsDNA Broad Range Kit.
Figura 3. El kit de mezcla de hibridación y preparación de bibliotecas de ADNlc Twist permite la detección sensible y precisa de variables al 0,25 % VAF. Las bibliotecas se capturaron monoplexadas con un panel oncológico personalizado de 50 kb dirigido a los sitios de variantes de 217 SNP en el material estándar pantumoral. Las variantes ausentes se calculan sumando los sitios con menos de 1 familia de variantes y dividiendo el resultado entre el número de sitios de variantes detectables totales.
Figura 4. El kit de mezcla de hibridación y preparación de bibliotecas de ADNlc Twist proporciona una mayor complejidad con y sin deduplicación de UMI.
Figura 5. El kit de preparación de bibliotecas de ADNlc Twist permite rendimientos de biblioteca de ADNlc más altos con muestras de ADNlc nativo. Tras la generación de bibliotecas, las muestras se diluyeron en 20 μl de agua y 1 μl se cuantificó con Qubit™ dsDNA Broad Range Kit.
Flujo de trabajo del kit de preparación de bibliotecas de ADNlc con mezcla de polimerasa TrueAmp
El flujo de trabajo de ADNlc aprovecha el equilibrio de GC diseñado por ingeniería y la amplificación de alta fidelidad. Este diseño ofrece un alto rendimiento de amplificación a la vez que minimiza los errores introducidos por PCR que pueden comprometer la detección de variantes de baja frecuencia.
El resultado son bibliotecas uniformes y de alta calidad en un flujo de trabajo rápido de 2 horas. El control de arranque en caliente basado en aptámeros proporciona estabilidad a temperatura ambiente para la configuración automatizada, mientras que la mezcla maestra de tubo único 2× agiliza los flujos de trabajo de WGS y de enriquecimiento del objetivo.
Recursos destacados
Ficha del producto
Protocolo
Nota técnica
Recursos destacados
Flujos de trabajo y aplicaciones relacionados
Los flujos de trabajo de enriquecimiento del objetivo con Twist ofrecen una cobertura escalable, de bajo sesgo y gran uniformidad en regiones genómicas grandes y complejas, lo que permite un descubrimiento más amplio, una mayor sensibilidad y una mayor flexibilidad que los métodos basados en amplicones o matrices.
Twist ofrece varias herramientas para la investigación con biopsias líquidas y la determinación temprana de cánceres.
Flujos de trabajo y aplicaciones relacionados
Los flujos de trabajo de enriquecimiento del objetivo con Twist ofrecen una cobertura escalable, de bajo sesgo y gran uniformidad en regiones genómicas grandes y complejas, lo que permite un descubrimiento más amplio, una mayor sensibilidad y una mayor flexibilidad que los métodos basados en amplicones o matrices.
Twist ofrece varias herramientas para la investigación con biopsias líquidas y la determinación temprana de cánceres.
