Genere el 99 % de las variantes deseadas
Los cribados de ingeniería de proteínas mediante bibliotecas de variantes de un solo sitio permiten a los investigadores explorar un espacio de la secuencia de la proteína e investigar la relación entre la secuencia y la estructura y la función de la proteína.
La construcción de la biblioteca de variantes de saturación de sitios Twist aprovecha la síntesis de oligonucleótidos masivamente paralela mediante la plataforma de síntesis de ADN basada en silicio patentada de Twist. Las bibliotecas Twist se verifican mediante la secuenciación de última generación (NGS) para confirmar que todas las variantes deseadas estén presentes en las proporciones correctas.
Descubra cómo las bibliotecas de variantes de un solo sitio Twist (SSVL) permiten el interrogatorio del espacio de la secuencia para identificar los residuos clave en la función y la estructura proteica.
Genere el 99 % de las variantes deseadas
Los cribados de ingeniería de proteínas mediante bibliotecas de variantes de un solo sitio permiten a los investigadores explorar un espacio de la secuencia de la proteína e investigar la relación entre la secuencia y la estructura y la función de la proteína.
La construcción de la biblioteca de variantes de saturación de sitios Twist aprovecha la síntesis de oligonucleótidos masivamente paralela mediante la plataforma de síntesis de ADN basada en silicio patentada de Twist. Las bibliotecas Twist se verifican mediante la secuenciación de última generación (NGS) para confirmar que todas las variantes deseadas estén presentes en las proporciones correctas.
Descubra cómo las bibliotecas de variantes de un solo sitio Twist (SSVL) permiten el interrogatorio del espacio de la secuencia para identificar los residuos clave en la función y la estructura proteica.
Al contrario que los métodos tradicionales, las bibliotecas de saturación de sitios eliminan la tendencia de codón y las sustituciones no deseadas, como lo enfoques de NNK y degenerado.
La TRIM ofrece un bajo rendimiento repetitivo, lo que conlleva a un producto con una longitud completa <50 % en una biblioteca típica, mientras que las bibliotecas Twist proporcionan más variantes útiles, lo que aumenta el tamaño efectivo de la biblioteca.
| PCR con tendencia a errores | Degenerado
(NNK/NNS) |
Bibliotecas de variantes de saturación de sitios Twist |
|
|---|---|---|---|
| Elimina el sesgo de la secuencia | No | No | Sí |
| Número de codones disponibles | Desconocido | 32 | Todo 64 |
| Evita motivos no deseados | No | No | Sí |
| Permite la optimización del codón | No | No | Sí |
| Evita codones de detención | No | Sí | Sí |
Las bibliotecas de variantes de saturación de sitios permiten el muestreo eficiente del espacio de la secuencia de una proteína en los análisis de cribado.
Esta figura muestra la distribución observada de aminoácidos en 65 posiciones de la proteína (19 variantes previstas por posición) al utilizar SSVL Twist frente a una PCR con tendencia a errores. Las barras representan una posición de aminoácidos diferente y cada color indica la frecuencia de variantes observada. Todas las variantes estás presentes en las relaciones esperadas en la biblioteca Twist.
Al contrario que los métodos tradicionales, las bibliotecas de saturación de sitios eliminan la tendencia de codón y las sustituciones no deseadas, como lo enfoques de NNK y degenerado.
La TRIM ofrece un bajo rendimiento repetitivo, lo que conlleva a un producto con una longitud completa <50 % en una biblioteca típica, mientras que las bibliotecas Twist proporcionan más variantes útiles, lo que aumenta el tamaño efectivo de la biblioteca.
| PCR con tendencia a errores | Degenerado
(NNK/NNS) |
Bibliotecas de variantes de saturación de sitios Twist |
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|---|---|---|---|
| Elimina el sesgo de la secuencia | No | No | Sí |
| Número de codones disponibles | Desconocido | 32 | Todo 64 |
| Evita motivos no deseados | No | No | Sí |
| Permite la optimización del codón | No | No | Sí |
| Evita codones de detención | No | Sí | Sí |
Las bibliotecas de variantes de saturación de sitios permiten el muestreo eficiente del espacio de la secuencia de una proteína en los análisis de cribado.
Esta figura muestra la distribución observada de aminoácidos en 65 posiciones de la proteína (19 variantes previstas por posición) al utilizar SSVL Twist frente a una PCR con tendencia a errores. Las barras representan una posición de aminoácidos diferente y cada color indica la frecuencia de variantes observada. Todas las variantes estás presentes en las relaciones esperadas en la biblioteca Twist.
Queremos ayudarle a realizar su pedido de bibliotecas de variantes de saturación de sitio. Haga clic en el botón “Get quote” (Obtener presupuesto) anterior, lo que le dirigirá a un breve formulario que deberá cumplimentar y nos pondremos en contacto con usted cuanto antes para ayudarle a realizar el pedido.
Si ya tiene una cuenta en Twist, puede iniciar sesión y empezar a cumplimentar los datos del pedido en línea.
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Póster
La síntesis de precisión de las bibliotecas de variantes permite el interrogatorio profundo del espacio de variantes de un solo sitio
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