Virus nuevos no cubiertos
Virus nuevos no cubiertos
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INFORMACIÓN GENERAL DATOS ANÁLISIS DE DATOS PEDIDOS Y ESPECIFICACIONES RECURSOS
INFORMACIÓN GENERAL

Descubra nuevas especies virales

La emergencia pandémica del SARS-CoV-2 ha destacado la necesidad de mejores herramientas para detectar y vigilar nuevos patógenos virales.

El panel completo viral para investigación de Twist ofrece una solución completa de enriquecimiento del objetivo que permite a los investigadores identificar y caracterizar rápidamente virus nuevos y altamente evolucionados en diversos tipos de muestras.

Detección
Detección completa de nuevas especies virales
Más de 1 millón de sondas únicas dirigidas a 3153 genomas virales
Captura de virus ADNmc, ADNbc, ARNbc y ARNmc
Descubrimiento de virus
Descubrimiento de variantes nuevas
El diseño de panel completo abarca patógenos virales humanos y no humanos
Las largas sondas permiten una tolerancia alta de no concordancia para el descubrimiento de variantes nuevas
Cribado
Solución completa de cribado de virus
Análisis directo con One Codex
Generación rápida de informes de datos y figuras listas para publicación
DETECTE ESPECIES VIRALES NUEVAS Y EVOLUCIONADAS

El panel completo viral para investigación de Twist cubre las secuencias de referencia de 3153 virus, incluidas 15 488 cepas diferentes. Algunos ejemplos de virus que pueden detectarse son:

Adenovirus

Coronavirus

Herpesvirus

Gripe A y B

Norovirus

Papilomavirus

Parvovirus

Picornavirus

Poxvirus

Retrovirus

Rabdovirus
 

Vea todas las familias aquí

Descubra nuevas especies virales

La emergencia pandémica del SARS-CoV-2 ha destacado la necesidad de mejores herramientas para detectar y vigilar nuevos patógenos virales.

El panel completo viral para investigación de Twist ofrece una solución completa de enriquecimiento del objetivo que permite a los investigadores identificar y caracterizar rápidamente virus nuevos y altamente evolucionados en diversos tipos de muestras.

Detección
Detección completa de nuevas especies virales
Más de 1 millón de sondas únicas dirigidas a 3153 genomas virales
Captura de virus ADNmc, ADNbc, ARNbc y ARNmc
Descubrimiento de virus
Descubrimiento de variantes nuevas
El diseño de panel completo abarca patógenos virales humanos y no humanos
Las largas sondas permiten una tolerancia alta de no concordancia para el descubrimiento de variantes nuevas
Cribado
Solución completa de cribado de virus
Análisis directo con One Codex
Generación rápida de informes de datos y figuras listas para publicación
DETECTE ESPECIES VIRALES NUEVAS Y EVOLUCIONADAS

El panel completo viral para investigación de Twist cubre las secuencias de referencia de 3153 virus, incluidas 15 488 cepas diferentes. Algunos ejemplos de virus que pueden detectarse son:

Adenovirus

Coronavirus

Herpesvirus

Gripe A y B

Norovirus

Papilomavirus

Parvovirus

Picornavirus

Poxvirus

Retrovirus

Rabdovirus
 

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DATOS
Detección completa de virus nuevos

Hemos extraído secuencias de referencia de las bases de datos RefSeq, FluDB y VIPR para diseñar el 1 052 421 de sondas únicas que conforman el panel completo viral para investigación de Twist. 

El panel abarca ampliamente cada familia viral que contenga al menos un virus que se sepa que afecta a los humanos, incluidos los adenovirus, coronavirus, flavivirus, norovirus, virus de la gripe, etc. 

Además de los virus infecciosos que afectan a los humanos, el panel también abarca virus animales (por ejemplo, coronavirus del murciélago). Esto permite el descubrimiento de especies virales nuevas con independencia de su origen.

Su gran amplitud permite al panel completo viral para investigación de Twist detectar cepas virales nuevas y evolucionadas, incluidas las relacionadas con un brote en junio de 2020 de la gripe H1N1 entre trabajadores del sector porcino.

Detección completa de virus nuevos
Detecte secuencias virales altamente divergentes

La selección natural de las glucoproteínas de la hemaglutinina (HA) de la gripe y de la espícula del coronavirus en animales han facilitado la transmisión zoonótica del SARS-CoV-2 y la gripe H1N1 a los humanos. 

Aquí, mostramos que el panel completo viral para investigación de Twist puede utilizarse para detectar correctamente estas secuencias de difícil captura, lo que incluye la región de la espícula del recientemente descubierto coronavirus (RoBat-CoV GCCDC1 Singapore) y un segmento de HA aislada de un brote de junio de 2020 de gripe H1N1 entre trabajadores del sector porcino. 

Nuestro panel proporcionó una cobertura >99,8 % de cada secuencia a una profundidad de al menos 1x.
 

Detecte secuencias virales altamente divergentes
Enriquecimiento de nuevos virus

Definimos la sensibilidad de no correspondencia del panel completo viral para investigación de Twist generando una serie de segmentos de HA con niveles definidos de variaciones de secuencias que varían del 5 % al 30 % con respecto a un segmento de HA de tipo salvaje.

La captura total se alcanzó con una cobertura 1x en muestras con una variación de secuencias de hasta el 10 %. Juntos, estos datos demostraron que el panel completo viral para investigación de Twist puede capturar secuencias virales muy evolucionadas. 

Enriquecimiento de nuevos virus
Detección múltiple de diversos virus

El panel completo viral para investigación de Twist permite la detección múltiple de virus, lo que facilita aplicaciones metagenómicas en diferentes tipos de muestras. 

En un análisis de coinfección, el panel capturó correctamente cuatro tipos de virus diferentes (astrovirus-ARNmc, virus BK-ADNbc, bocavirus-ADNmc y picobirnavirus-ARNbc) introducidos en ARN humano con tan solo 1,2 millones de lecturas.   
 

Detección múltiple de diversos virus
Detección completa de virus nuevos

Hemos extraído secuencias de referencia de las bases de datos RefSeq, FluDB y VIPR para diseñar el 1 052 421 de sondas únicas que conforman el panel completo viral para investigación de Twist. 

El panel abarca ampliamente cada familia viral que contenga al menos un virus que se sepa que afecta a los humanos, incluidos los adenovirus, coronavirus, flavivirus, norovirus, virus de la gripe, etc. 

Además de los virus infecciosos que afectan a los humanos, el panel también abarca virus animales (por ejemplo, coronavirus del murciélago). Esto permite el descubrimiento de especies virales nuevas con independencia de su origen.

Su gran amplitud permite al panel completo viral para investigación de Twist detectar cepas virales nuevas y evolucionadas, incluidas las relacionadas con un brote en junio de 2020 de la gripe H1N1 entre trabajadores del sector porcino.

Detección completa de virus nuevos
Detecte secuencias virales altamente divergentes

La selección natural de las glucoproteínas de la hemaglutinina (HA) de la gripe y de la espícula del coronavirus en animales han facilitado la transmisión zoonótica del SARS-CoV-2 y la gripe H1N1 a los humanos. 

Aquí, mostramos que el panel completo viral para investigación de Twist puede utilizarse para detectar correctamente estas secuencias de difícil captura, lo que incluye la región de la espícula del recientemente descubierto coronavirus (RoBat-CoV GCCDC1 Singapore) y un segmento de HA aislada de un brote de junio de 2020 de gripe H1N1 entre trabajadores del sector porcino. 

Nuestro panel proporcionó una cobertura >99,8 % de cada secuencia a una profundidad de al menos 1x.
 

Detecte secuencias virales altamente divergentes
Enriquecimiento de nuevos virus

Definimos la sensibilidad de no correspondencia del panel completo viral para investigación de Twist generando una serie de segmentos de HA con niveles definidos de variaciones de secuencias que varían del 5 % al 30 % con respecto a un segmento de HA de tipo salvaje.

La captura total se alcanzó con una cobertura 1x en muestras con una variación de secuencias de hasta el 10 %. Juntos, estos datos demostraron que el panel completo viral para investigación de Twist puede capturar secuencias virales muy evolucionadas. 

Enriquecimiento de nuevos virus
Detección múltiple de diversos virus

El panel completo viral para investigación de Twist permite la detección múltiple de virus, lo que facilita aplicaciones metagenómicas en diferentes tipos de muestras. 

En un análisis de coinfección, el panel capturó correctamente cuatro tipos de virus diferentes (astrovirus-ARNmc, virus BK-ADNbc, bocavirus-ADNmc y picobirnavirus-ARNbc) introducidos en ARN humano con tan solo 1,2 millones de lecturas.   
 

Detección múltiple de diversos virus
Análisis de datos
Análisis con One Codex

El panel completo viral para investigación de Twist incluye el acceso a la herramienta de análisis web One Codex. Además de proporcionar asistencia al análisis, esta herramienta basada en la nube permite a los usuarios documentar sus esfuerzos destinados al descubrimiento de nuevos virus con informes imprimibles y figuras listas para su publicación. 

One Codex simplifica el análisis de los datos de las secuencias obtenidos mediante el panel completo viral para investigación de Twist. Tras cargar los datos de las secuencias mediante una interfaz sencilla de arrastrar y colocar, los usuarios pueden generar un informe con los detalles del descubrimiento del nuevo virus en minutos. Los usuarios también pueden personalizar el flujo de trabajo bioinformático con sus propios umbrales de detección e interpretaciones. 

La adquisición del panel completo viral para investigación de Twist incluye todo lo necesario para empezar a analizar sus resultados con One Codex, incluido un código de cupón e instrucciones detalladas. Obtenga más información sobre esta plataforma optimizada de análisis microbiano en onecodex.com
 

Análisis con One Codex
Análisis con One Codex

El panel completo viral para investigación de Twist incluye el acceso a la herramienta de análisis web One Codex. Además de proporcionar asistencia al análisis, esta herramienta basada en la nube permite a los usuarios documentar sus esfuerzos destinados al descubrimiento de nuevos virus con informes imprimibles y figuras listas para su publicación. 

One Codex simplifica el análisis de los datos de las secuencias obtenidos mediante el panel completo viral para investigación de Twist. Tras cargar los datos de las secuencias mediante una interfaz sencilla de arrastrar y colocar, los usuarios pueden generar un informe con los detalles del descubrimiento del nuevo virus en minutos. Los usuarios también pueden personalizar el flujo de trabajo bioinformático con sus propios umbrales de detección e interpretaciones. 

La adquisición del panel completo viral para investigación de Twist incluye todo lo necesario para empezar a analizar sus resultados con One Codex, incluido un código de cupón e instrucciones detalladas. Obtenga más información sobre esta plataforma optimizada de análisis microbiano en onecodex.com
 

Análisis con One Codex
PEDIDOS Y ESPECIFICACIONES
CÓDIGOS DE REFERENCIA DE LOS PRODUCTOS

103545

Panel completo viral para investigación de Twist con el software One Codex, 2 reacciones, kit

103547

Panel completo viral para investigación de Twist con el software One Codex, 12 reacciones, kit

103458

Panel completo viral para investigación de Twist con el software One Codex, 96 reacciones, kit
ESPECIFICACIONES

Paso de flujo de trabajo

Enriquecimiento del objetivo

Formato

ADNbc

Tamaño de panel

36,8 Mb

Contenido

Secuencias virales

Bases de datos de diseño

FluDB, RefSeq, VIPRdb

Almacenamiento

Almacenar a de -5 a -30 °C
CÓDIGOS DE REFERENCIA DE LOS PRODUCTOS

103545

Panel completo viral para investigación de Twist con el software One Codex, 2 reacciones, kit

103547

Panel completo viral para investigación de Twist con el software One Codex, 12 reacciones, kit

103458

Panel completo viral para investigación de Twist con el software One Codex, 96 reacciones, kit
ESPECIFICACIONES

Paso de flujo de trabajo

Enriquecimiento del objetivo

Formato

ADNbc

Tamaño de panel

36,8 Mb

Contenido

Secuencias virales

Bases de datos de diseño

FluDB, RefSeq, VIPRdb

Almacenamiento

Almacenar a de -5 a -30 °C
RECURSOS