Descubrimiento en el perfilado de la metilación
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INFORMACIÓN GENERAL DATOS PEDIDOS RECURSOS
Descripción general

El panel del metiloma humano Twist está dirigido a 3980 sitios de CpG mediante 123 Mb de contenido genómico para buscar marcadores de metilación biológicamente pertinentes. El amplio contenido convierte a este panel en una opción ideal para que los investigadores exploren la fracción de metilación en diversas aplicaciones, como la metástasis, el desarrollo humano y la genómica funcional. 

El panel se ha optimizado y validado con el fin de utilizarse con el sistema de detección de metilación por NGS Twist para un flujo de trabajo integral con un rendimiento líder del sector. Una eficiencia alta en cuanto a capturas aumenta la sensibilidad de la detección en la huella del epigenoma al tiempo que reduce los costes. El panel es ideal para cribar muestras de cohortes y el descubrimiento de regiones metiladas de forma diferencial. 

 

Eficiencia del flujo de trabajo y diseño
Eficiencia del flujo de trabajo y diseño
Rendimiento optimizado con un flujo de trabajo integral
Mayor complejidad de las bibliotecas
Flexibilidad en la adición por spike-in de contenido
Mayor cobertura que la micromatriz media
Mayor cobertura que la micromatriz media
~4 veces más cobertura de todos los sitios CpG
Mayor cobertura de las bases de islas CpG
Basado en bases de datos de referencia actualizadas
 Ventaja sobre las micromatrices
Ventaja sobre las micromatrices
Más activaciones en regiones metiladas de formas diferencial
Mayor cobertura antes y después de los sitios CpG adyacentes
Eficiencia del flujo de trabajo y diseño

Una solución completa que genera lecturas de secuenciación altamente complejas y uniformes para el análisis de metilación. El protocolo integral lo consigue combinando un proceso de conversión enzimática innovador, un flujo de trabajo de enriquecimiento del objetivo optimizado y un proceso de diseño de paneles muy desarrollado. 
 

Flujo de trabajo

El panel del metiloma humano Twist está dirigido a 3980 sitios de CpG mediante 123 Mb de contenido genómico para buscar marcadores de metilación biológicamente pertinentes. El amplio contenido convierte a este panel en una opción ideal para que los investigadores exploren la fracción de metilación en diversas aplicaciones, como la metástasis, el desarrollo humano y la genómica funcional. 

El panel se ha optimizado y validado con el fin de utilizarse con el sistema de detección de metilación por NGS Twist para un flujo de trabajo integral con un rendimiento líder del sector. Una eficiencia alta en cuanto a capturas aumenta la sensibilidad de la detección en la huella del epigenoma al tiempo que reduce los costes. El panel es ideal para cribar muestras de cohortes y el descubrimiento de regiones metiladas de forma diferencial. 

 

Eficiencia del flujo de trabajo y diseño
Eficiencia del flujo de trabajo y diseño
Rendimiento optimizado con un flujo de trabajo integral
Mayor complejidad de las bibliotecas
Flexibilidad en la adición por spike-in de contenido
Mayor cobertura que la micromatriz media
Mayor cobertura que la micromatriz media
~4 veces más cobertura de todos los sitios CpG
Mayor cobertura de las bases de islas CpG
Basado en bases de datos de referencia actualizadas
 Ventaja sobre las micromatrices
Ventaja sobre las micromatrices
Más activaciones en regiones metiladas de formas diferencial
Mayor cobertura antes y después de los sitios CpG adyacentes
Eficiencia del flujo de trabajo y diseño

Una solución completa que genera lecturas de secuenciación altamente complejas y uniformes para el análisis de metilación. El protocolo integral lo consigue combinando un proceso de conversión enzimática innovador, un flujo de trabajo de enriquecimiento del objetivo optimizado y un proceso de diseño de paneles muy desarrollado. 
 

Flujo de trabajo

Datos
Mayor cobertura que la micromatriz media

El metiloma humano Twist contiene 3980 sitios de CpG mediante los 123 Mb de contenido genómico para buscar marcadores de metilación biológicamente pertinentes. El panel está muy dirigido a capturar y detectar las regiones de metilación de CpG más pertinentes, comentadas y actuales del genoma. El 84 % (17.915.988) de las islas CpG del genoma se identifican mediante el enriquecimiento de este panel. Están cubiertas 105.288.339 bases adicionales de costas, estantes, CpG de mar abierto y pares de bases posteriores.

Mayor cobertura que la micromatriz media
Ventaja sobre las micromatrices medias

Las micromatrices se diseñan con contenido estático que puede dificultar el descubrimiento de nuevos objetivos epigenéticos de interés. Las matrices actualmente disponibles en el mercado también presentan una cobertura limitada del metiloma en el epigenoma, lo que deja una gran proporción de sitios CpG metilados sin medir. El enfoque de enriquecimiento del objetivo del metiloma humano Twist soluciona estas limitaciones con los paneles de captura híbrida que permiten el contenido expandido y la resolución de una única base en la lectura de secuencia entera proporcionada por plataformas de secuenciación de última generación (NGS).

Las micromatrices presentan limitaciones inherentes en los extremos en cuanto a la detección de la metilación atribuidas a mucho ruido de fondo en el extremo bajo y a la saturación de la señal en el extremo alto. Debido al mayor intervalo dinámico proporcionado por la NGS, el panel del metiloma humano Twist puede proporcionar una activación más precisa de las regiones metiladas de forma diferencial (DMR), especialmente en los extremos superior e inferior de la fracción de metilación (figura 4). 

 

Ventaja sobre las micromatrices medias
Rendimiento

El panel del metiloma humano Twist está diseñado y optimizado para laboratorios húmedos con el fin de proporcionar una eficiencia de captura híbrida precisa, sensible y de alto rendimiento. El panel logra una profundidad de cobertura del 90 % de las bases con una cobertura 30 veces superior con especificidades altas de sonda del 95 % de las tasas en el objetivo. El panel también alcanza un fold 80 de 1,54 a la hora de proporcionar una uniformidad alta en la región objetivo al reducir el delta entre picos y valles de las acumulaciones de activaciones de bases. La complejidad de la biblioteca quedó inversamente representada por una tasa de duplicación <4 % a una profundidad de secuenciación alta de 150x cobertura bruta. Las métricas de eficiencia general de captura del panel proporcionan un alto nivel de confianza en la detección en la fracción de metilación con un coste de secuenciación minimizado.

 

Rendimiento
Mayor cobertura que la micromatriz media

El metiloma humano Twist contiene 3980 sitios de CpG mediante los 123 Mb de contenido genómico para buscar marcadores de metilación biológicamente pertinentes. El panel está muy dirigido a capturar y detectar las regiones de metilación de CpG más pertinentes, comentadas y actuales del genoma. El 84 % (17.915.988) de las islas CpG del genoma se identifican mediante el enriquecimiento de este panel. Están cubiertas 105.288.339 bases adicionales de costas, estantes, CpG de mar abierto y pares de bases posteriores.

Mayor cobertura que la micromatriz media
Ventaja sobre las micromatrices medias

Las micromatrices se diseñan con contenido estático que puede dificultar el descubrimiento de nuevos objetivos epigenéticos de interés. Las matrices actualmente disponibles en el mercado también presentan una cobertura limitada del metiloma en el epigenoma, lo que deja una gran proporción de sitios CpG metilados sin medir. El enfoque de enriquecimiento del objetivo del metiloma humano Twist soluciona estas limitaciones con los paneles de captura híbrida que permiten el contenido expandido y la resolución de una única base en la lectura de secuencia entera proporcionada por plataformas de secuenciación de última generación (NGS).

Las micromatrices presentan limitaciones inherentes en los extremos en cuanto a la detección de la metilación atribuidas a mucho ruido de fondo en el extremo bajo y a la saturación de la señal en el extremo alto. Debido al mayor intervalo dinámico proporcionado por la NGS, el panel del metiloma humano Twist puede proporcionar una activación más precisa de las regiones metiladas de forma diferencial (DMR), especialmente en los extremos superior e inferior de la fracción de metilación (figura 4). 

 

Ventaja sobre las micromatrices medias
Rendimiento

El panel del metiloma humano Twist está diseñado y optimizado para laboratorios húmedos con el fin de proporcionar una eficiencia de captura híbrida precisa, sensible y de alto rendimiento. El panel logra una profundidad de cobertura del 90 % de las bases con una cobertura 30 veces superior con especificidades altas de sonda del 95 % de las tasas en el objetivo. El panel también alcanza un fold 80 de 1,54 a la hora de proporcionar una uniformidad alta en la región objetivo al reducir el delta entre picos y valles de las acumulaciones de activaciones de bases. La complejidad de la biblioteca quedó inversamente representada por una tasa de duplicación <4 % a una profundidad de secuenciación alta de 150x cobertura bruta. Las métricas de eficiencia general de captura del panel proporcionan un alto nivel de confianza en la detección en la fracción de metilación con un coste de secuenciación minimizado.

 

Rendimiento
Pedidos
Códigos de referencia de los productos

105517

Panel del metiloma humano Twist, 2 Reacciones

105520

Panel del metiloma humano Twist, 12 Reacciones

105521

Panel del metiloma humano Twist, 96 Reacciones
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