Panel del metiloma humano Twist

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El panel del metiloma humano Twist está dirigido a 3 980 000 sitios de CpG mediante 123 Mb de contenido genómico para buscar marcadores de metilación biológicamente pertinentes. El amplio contenido convierte a este panel en una opción ideal para que los investigadores exploren la fracción de metilación en diversas aplicaciones, como la metástasis, el desarrollo humano y la genómica funcional.

El panel se ha optimizado y validado con el fin de utilizarse con el sistema de detección de metilación por NGS Twist para un flujo de trabajo integral con un rendimiento líder del sector. Una eficiencia alta en cuanto a capturas aumenta la sensibilidad de la detección en la huella del epigenoma al tiempo que reduce los costes. El panel es ideal para cribar muestras de cohortes y el descubrimiento de regiones metiladas de forma diferencial.

Eficiencia del flujo de trabajo y diseño

Rendimiento optimizado con un flujo de trabajo integral
Mayor complejidad de las bibliotecas
Flexibilidad en la adición por spike-in de contenido

Mayor cobertura que la micromatriz media

Hasta ~5,9 veces más cobertura de todos los sitios CpG
Mayor cobertura de las bases de islas CpG
Basado en bases de datos de referencia actualizadas

Ventaja sobre las micromatrices

Más activaciones en regiones metiladas de formas diferencial
Mayor cobertura antes y después de los sitios CpG adyacentes

Eficiencia del flujo de trabajo y diseño

A complete solution that produces highly complex and uniform sequencing reads for methylation analysis. The end-to-end protocol achieves this by combining an innovative, enzymatic conversion process, optimized target enrichment workflow, and highly developed panel design process.

Mayor cobertura que la micromatriz media

The Twist Human Methylome contains 3.98M CpG sites through the 123 Mb of genomic content target biologically relevant methylation markers. The panel is highly targeted to capture and detect the most current, annotated, and relevant CpG methylation regions in the genome. 84% (17,915,988) of the CpG islands in the genome are identified through enrichment with this panel. An additional 105,288,339 bases of subsequent shores, shelves, and open sea CpG’s and base pairs are covered. Coverage overlap determined by internal experimental data of coverage, including shadow coverage compared to array coverage data files.

Ventaja sobre las micromatrices medias

Las micromatrices se diseñan con contenido estático que puede dificultar el descubrimiento de nuevos objetivos epigenéticos de interés. Las matrices actualmente disponibles en el mercado también presentan una cobertura limitada del metiloma en el epigenoma, lo que deja una gran proporción de sitios CpG metilados sin medir. El enfoque de enriquecimiento del objetivo del metiloma humano Twist soluciona estas limitaciones con los paneles de captura híbrida que permiten el contenido expandido y la resolución de una única base en la lectura de secuencia entera proporcionada por plataformas de secuenciación de última generación (NGS).

Las micromatrices presentan limitaciones inherentes en los extremos en cuanto a la detección de la metilación atribuidas a mucho ruido de fondo en el extremo bajo y a la saturación de la señal en el extremo alto. Debido al mayor intervalo dinámico proporcionado por la NGS, el panel del metiloma humano Twist puede proporcionar una activación más precisa de las regiones metiladas de forma diferencial (DMR), especialmente en los extremos superior e inferior de la fracción de metilación.

Rendimiento

El panel del metiloma humano Twist está diseñado y optimizado para laboratorios húmedos con el fin de proporcionar una eficiencia de captura híbrida precisa, sensible y de alto rendimiento. The panel achieves a depth of coverage of 90% of bases at 30x coverage with high probe specificities of 95% on-target rates. The panel also achieves a fold 80 of 1.54 providing high uniformity across the target region by decreasing the delta between the peaks and valleys of the base call pile ups. Library complexity was inversely represented by a <4% duplication rate at a high sequencing depth of 150x raw coverage. Las métricas de eficiencia general de captura del panel proporcionan un alto nivel de confianza en la detección en la fracción de metilación con un coste de secuenciación minimizado.