Detecte patógenos respiratorios humanos comunes con una sola prueba

Compiladas de la base de datos de GenBank, las 41 047 sondas de este panel permitirán a los investigadores separar los síntomas de la COVID-19 de los de otras enfermedades respiratorias, tanto relacionadas con la gripe como no relacionados. El panel respiratorio Twist permite el enriquecimiento de estas secuencias virales para la secuenciación de última generación (NGS) de alta resolución. Esto permite una detección de alta sensibilidad de tan solo 100 copias de material viral con un enriquecimiento superior a 5000x incluso en muestras complejas y una cobertura >99,9 % del genoma a un postenriquecimiento 1X o mayor.

Detección de estándares virales de diferentes familias virales

Each Twist Synthetic Viral Control was spiked into 50 ng of human carrier RNA at 1,000,000 copies prior to cDNA synthesis. Para cada estándar, mostramos el porcentaje de lecturas virales en el objetivo, el enriquecimiento con respecto a la entrada, la cobertura media del genoma, el porcentaje de bases con una cobertura de al menos 30x y la longitud de la plantilla. Los genomas virales se ordenan por longitud del molde (del más pequeño al más grande) entre todos los segmentos de genoma. En la mayoría de los casos, se determinó que más del 70 % de las lecturas provenían de genomas virales de estas bibliotecas, que representaban al menos un enriquecimiento 2500x con respecto al contenido agregado.

Multiplexado para un mayor rendimiento y un menor coste

Una comparación del porcentaje de lecturas virales en el objetivo capturadas mediante los controles virales sintéticos Twist a diferentes títulos virales mediante una reacción de hibridación multiplexada y monoplexada. El primer gráfico muestra comparaciones utilizando una reacción de hibridación multiplexada y monoplexada con 1 000 000 de copias por biblioteca, mientras que el segundo gráfico muestra una comparación similar con 100, 10 000 y 1 000 000 copias por biblioteca. Todos los controles virales se capturaron con el flujo de trabajo de enriquecimiento del objetivo Twist estándar y el panel de investigación de virus respiratorios Twist. Estos datos demuestran que una captura 8-plexada proporciona un enriquecimiento eficiente comparable a una captura monoplexada cuando se utiliza el panel de investigación de virus respiratorios Twist.