Las infecciones por nuevas especies y cepas virales representan una amenaza grave y recurrente para la salud pública mundial. Responder a estas amenazas depende fundamentalmente de la capacidad para identificar y desarrollar pruebas para el agente viral, lo cual es un desafío significativo dado el espacio de la secuencia diverso y en rápida evolución de los virus humanos. El problema se ve agravado por las nuevas infecciones adquiridas a partir de virus animales, que pueden tener pocas similitudes de secuencia con cualquier especie infecciosa humana conocida. En teoría, los enfoques de secuenciación de última generación (NGS) pueden detectar agentes virales completamente nuevos. Sin embargo, su aplicación está limitada por la contaminación de las lecturas del huésped, lo que requiere una profundidad de secuenciación significativa para obtener una cobertura completa sobre la plantilla viral. Aquí, describimos el panel completo viral para investigación de Twist, una solución de enriquecimiento del objetivo basada en la hibridación capaz de detectar cepas virales altamente divergentes. Nuestros resultados destacan el panel completo viral para investigación de Twist como una solución versátil para el descubrimiento y la vigilancia de nuevos virus.