Genotipado: cambio de matrices a secuencias en crianza de ganado vacuno

Este póster presenta un estudio de 28 000 terneras en el que el genotipado hizo la transición de matrices a secuencias con Curio Genomics y Twist Bioscience. El estudio demuestra la viabilidad y la precisión del uso de la captura de preparación de bibliotecas autonormalizadoras de HTP de Twist y la captura de datos multiplex para buscar regiones de genoma que anteriormente se habían capturado con matrices de 70 000 ejemplares bovinos. Los resultados muestran una concordancia superior al 99 % entre los datos de las matrices y los de las secuencias objetivo, lo que aporta la certeza necesaria para afrontar el cambio de enfoque y mejorar la eficiencia en el programa de cría.

Puntos de aprendizaje clave:

  • Gracias a sus altas tasas de concordancia, el genotipado con secuencias presenta una alternativa viable y precisa a los métodos tradicionales que utilizan matrices.

  • Un mínimo de 30 nanogramos de aporte de ADN garantiza suficiente cobertura (20x+) y precisión de genotipado (99 %+) en secuencias de búsqueda.

  • La plataforma CURIO de análisis de datos de agrigenómica permite realizar de manera simultánea la visualización y la comparación de los resultados de genotipado obtenidos con micromatrices y con secuenciación de última generación (NGS).

Este póster presenta un estudio de 28 000 terneras en el que el genotipado hizo la transición de matrices a secuencias con Curio Genomics y Twist Bioscience. El estudio demuestra la viabilidad y la precisión del uso de la captura de preparación de bibliotecas autonormalizadoras de HTP de Twist y la captura de datos multiplex para buscar regiones de genoma que anteriormente se habían capturado con matrices de 70 000 ejemplares bovinos. Los resultados muestran una concordancia superior al 99 % entre los datos de las matrices y los de las secuencias objetivo, lo que aporta la certeza necesaria para afrontar el cambio de enfoque y mejorar la eficiencia en el programa de cría.

Puntos de aprendizaje clave:

  • Gracias a sus altas tasas de concordancia, el genotipado con secuencias presenta una alternativa viable y precisa a los métodos tradicionales que utilizan matrices.

  • Un mínimo de 30 nanogramos de aporte de ADN garantiza suficiente cobertura (20x+) y precisión de genotipado (99 %+) en secuencias de búsqueda.

  • La plataforma CURIO de análisis de datos de agrigenómica permite realizar de manera simultánea la visualización y la comparación de los resultados de genotipado obtenidos con micromatrices y con secuenciación de última generación (NGS).

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