Dickkopf-1 (DKK1) es una proteína endógena conocida por sobreexpresarse en microentornos tumorales. Los estudios anteriores han demostrado el efecto antitumoral de los anticuerpos DKK1 en varios cánceres diferentes. La plataforma de referencia multidisciplinar de Twist Biopharma Solutions integra los enfoques in vitro, in vivo e in silico para el descubrimiento de anticuerpos. En esta campaña, aprovechamos los enfoques in vitro e in vivo de Twist y las bibliotecas de fagos sintéticos de alta diversidad de Twist, así como las estrategias de aprendizaje automático para descubrir potentes anticuerpos anti-DKK1. Se expandieron dos bibliotecas de VHH humanizado sintético mediante la presentación de fagos y los resultados de la expansión de fagos se cribaron mediante ELISA para identificar posibles candidatos. Los resultados de la expansión también se secuenciaron mediante secuenciación de última generación (NGS). Los resultados de la NGS se utilizaron en diferentes modelos de aprendizaje automático para predecir posibles candidatos adicionales. Sequences were reformatted into VHH-Fc, and synthesized and produced with Twist’s high throughput synthesis and production platform.  Resulting antibodies were evaluated for binding on SPR, as well as further downstream characterization and in vivo studies. Asimismo, nuestra plataforma VHH modular nos permitió reformatear rápidamente AcM prometedores a anticuerpos biespecíficos (Acbe).  

Twist Biopharma Solutions se compromete a colaborar con sus socios para desarrollar tratamientos con anticuerpos eficientes a través de nuestras plataformas integradas de descubrimiento de anticuerpos in vitro e in vivo. En esta presentación mostramos que el descubrimiento de anticuerpos biespecíficos anti-4-1BB-nectina-4 (Acbe) mediante nuestra biblioteca de bibliotecas, seguido de la producción de anticuerpos de alto rendimiento (IgGAR), la caracterización de la resonancia de plasmón de superficie (RPS) y los experimentos basados en células. 4-1BB ha ganado una atención significativa como objetivo inmunoterapéutico versátil debido a su expresión extendida y a la capacidad para activar las diversas vías de señalización críticas para respuestas inmunitarias sólidas. Al mismo tiempo, la nectina-4 ha surgido como un objetivo médico de precisión atractivo, ya que está notablemente sobreexpresada en diferentes tumores sólidos, incluidos los cánceres de mama, pulmón y ovario. Nuestros principales candidatos mostraron una eficacia sólida en los experimentos de señalización y los experimentos de activación de células inmunitarias. Estos resultados prometedores indican que estos candidatos merecen una exploración más exhaustiva en investigaciones preclínicas y un posible desarrollo como anticuerpos terapéuticos.

Se han generado varias bibliotecas de anticuerpos sintéticos altamente diversificadas mediante la tecnología de síntesis de ADN precisa de Twist para facilitar el proceso de descubrimiento de anticuerpos. Una de estas “bibliotecas de bibliotecas” incluye la biblioteca scFv estructural, la biblioteca scFv hipermutada por IA y la biblioteca de VHH hCamel Zero. By leveraging these synthetic libraries, a wide range of high-affinity antibody candidates have been identified across multiple protein targets.  In this project, we demonstrate the validation process of constructed synthetic antibody libraries. La presentación de fagos se utilizó para expandir las bibliotecas frente a objetivos proteicos biotinilados y se realizaron experimentos de unión de ELISA para el cribado de candidatos únicos. Un proceso de purificación de proteínas de alto rendimiento permite que los candidatos se reformateen a VHH-Fc o IgG, que luego se caracterizan mediante SPR.