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Descubrimiento de pares parálogos letales sintéticos en el genoma humano
Descubrimiento de pares parálogos letales sintéticos en el genoma humano
Presentado por
Phoebe Parrish
Estudiante de posgrado, Centro de Investigación contra el Cáncer Fred Hutchinson
RECORDED AT Writing the Future of Drug Discovery
Cubierto en este seminario web
Cómo los fenotipos de bloqueo único de genes pueden enmascararse por la redundancia entre los genes relacionados
Desarrollo de pgPEN, un enfoque de bloqueo doble y único de CRISPR-Cas9 agrupados dirigido a más de 2000 parálogos humanos
Resultados que determinan que el 12 % de los parálogos humanos presentan letalidad sintética en al menos un contexto
CRISPR screens have accelerated the discovery of important cancer vulnerabilities. However, single gene knockout phenotypes can be masked by redundancy among related genes. To address this issue we developed pgPEN, a pooled CRISPR-Cas9 single and double knockout approach targeting over 2,000 human paralogs. We applied pgPEN to two cell lines and discovered that 12% of human paralogs exhibit synthetic lethality in at least one context. We recovered known synthetic lethal paralogs MEK1/MEK2, important drug targets CDK4/CDK6, and other synthetic lethal pairs including CCNL1/CCNL2. These findings nominate drug targets to help expand targeted therapy options for cancer.
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