Un enfoque de captura híbrida sin PCR para la detección de expansiones repetidas patógenas

Rebecca Barnard
Presentado por
Dra. Rebecca Barnard
Dra. Rebecca Barnard
Científica de aplicaciones bioinformáticas, gerente, Twist Bioscience

At ASHG 2025, Rebecca Barnard, PhD (Twist Bioscience), presented new data demonstrating how a PCR-free, hybrid-capture sequencing workflow—developed through collaboration between Twist Bioscience and Element Biosciences—enables accurate detection of disease-causing short tandem repeat (STR) expansions. Estas secuencias repetitivas, que se sabe que subyacen tras trastornos como la enfermedad de Huntington, el síndrome del cromosoma X frágil y la distrofia miotónica, han sido históricamente difíciles de resolver debido al sesgo de amplificación, las regiones ricas en GC y el mosaicismo somático. La preparación combinada de la biblioteca de fragmentación enzimática Twist con adaptadores de longitud completa y Avidity Base Chemistry de Element elimina la PCR en el instrumento, mejorando la cobertura de locus complejos densos en GC y manteniendo la estructura original de repetición. Barnard’s results showed clear detection of both normal and pathogenic alleles—including expanded DMPK genotypes (22/84 repeats)—while reducing hands-on time by up to five hours per workflow. La presentación pone de manifiesto cómo esta solución sin PCR Trinity avanza en el análisis de expansión repetida con mayor precisión, velocidad y escalabilidad para aplicaciones de investigación. 

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