La biopsie liquide, une technique qui prend de la valeur
Une biopsie liquide est une technique peu invasive permettant de détecter des biomarqueurs (tels que des protéines, de l’ADN tumoral circulant (ADNct) et de l’ARN) à partir de fluides corporels comme le sang, le plasma ou l’urine. Lorsqu’elles sont analysées avec une technologie de séquençage de nouvelle génération (NGS), les biopsies liquides peuvent constituer un moyen particulièrement sensible de détecter le développement de la maladie et de suivre son évolution tout au long du traitement.
Grâce aux progrès réalisés dans la préparation de banques et dans les flux de travail d’enrichissement ciblé, le nombre de biomarqueurs détectables augmente continuellement et ouvre un large champ d’action à la recherche.
La biopsie liquide, une technique qui prend de la valeur
Une biopsie liquide est une technique peu invasive permettant de détecter des biomarqueurs (tels que des protéines, de l’ADN tumoral circulant (ADNct) et de l’ARN) à partir de fluides corporels comme le sang, le plasma ou l’urine. Lorsqu’elles sont analysées avec une technologie de séquençage de nouvelle génération (NGS), les biopsies liquides peuvent constituer un moyen particulièrement sensible de détecter le développement de la maladie et de suivre son évolution tout au long du traitement.
Grâce aux progrès réalisés dans la préparation de banques et dans les flux de travail d’enrichissement ciblé, le nombre de biomarqueurs détectables augmente continuellement et ouvre un large champ d’action à la recherche.
Amélioration de la recherche par biopsie liquide
Les outils de NGS aident les chercheurs à développer des analyses de biopsie liquide toujours plus sensibles et
spécifiques. Examinez quelques études et résultats clés.
Une détection plus précoce
L’ADNct surpasse les examens d’imagerie TEP dans la détection précoce du cancer. Validation analytique de NeXT Personal ®, une analyse personnalisée ultra-sensible de l’ADN tumoral circulant. Oncotarget. 2024
Guider la thérapie adaptative
L’ADNct peut fournir des indications précieuses pour les décisions de traitement. On cfDNA In Hematologic Cancers: A Q&A With Dr. Mark Murakami
Des performances avérées
Les modèles épigénétiques peuvent aider à retracer l’origine de l’ADNct. Sensitive and specific multi-cancer detection and localization using methylation signatures in cell-free DNA. ESMO Annals of Oncology. 2020
Comparaison entre méthodes liquides et méthodes traditionnelles
En plus d’être peu invasives, les biopsies liquides présentent plusieurs avantages par rapport aux méthodes traditionnelles.
Biopsies liquides |
Méthodes classiques |
|
|---|---|---|
| Fréquence d’échantillonnage | Les biopsies liquides sont peu invasives, ce qui permet un échantillonnage fréquent et longitudinal. | La nature invasive des biopsies tissulaires limite le nombre d’échantillons pouvant être prélevés. De même, les examens d’imagerie radiologique peuvent s’avérer coûteux et inconfortables pour les patients. |
| Hétérogénéité | L’ADNct peut provenir de plusieurs compartiments d’une tumeur, ce qui permet d’analyser l’hétérogénéité tumorale. | Les biopsies tissulaires ne capturent qu’un instantané limité de la biologie tumorale et peuvent manquer l’hétérogénéité spatiale et temporelle que de nombreuses tumeurs finissent par développer. |
| Une détection précoce du cancer | L’accessibilité facile de l’ADN acellulaire, ainsi que la capacité à détecter plusieurs types de cancer différents à partir d’une seule analyse, suggèrent que les biopsies liquides peuvent constituer un outil précieux pour le dépistage continu et la détection précoce des tumeurs malignes naissantes. Cependant, la sensibilité et la spécificité varient considérablement selon les types de cancer. | Plusieurs méthodes basées sur l’imagerie et les biomarqueurs se sont avérées efficaces pour détecter certains cancers à un stade précoce. Cependant, beaucoup de ces méthodes sont spécifiques à un organe, ont une validité prédictive variable et peuvent s’avérer extrêmement coûteuses. |
| Test de maladie résiduelle mesurable | Même lorsque peu de cellules cancéreuses survivent au traitement, de l’ADNct peut être libéré dans la circulation. Des analyses NGS sensibles sont capables de le détecter. [ref] | La détection d’une maladie résiduelle par biopsie tissulaire peut nécessiter des procédures invasives et un échantillonnage très précis. Souvent, la limite de détection de l’imagerie radiologique est incapable de détecter une maladie résiduelle avant que les tumeurs ne se reforment. |
| Détection des maladies métastatiques | Une fois libéré par les cellules tumorales, l’ADNct peut être détecté par biopsie liquide où qu’il se trouve. L’analyse des profils de méthylation peut permettre de retracer l’ADNct jusqu’à son tissu d’origine, qu’il s’agisse d’une lésion métastatique ou d’un site primaire. | Les sites courants de métastases peuvent être surveillés par imagerie radiologique, mais la fréquence d’échantillonnage et la sensibilité limitée peuvent retarder la détection de la maladie métastatique. |
| Rapidité | L’utilisation de flux de travail NGS pour détecter l’ADNct peut contribuer à raccourcir les délais d’exécution. | Les laboratoires de pathologie clinique sont souvent configurés pour l’évaluation histopathologique des biopsies tissulaires, mais le traitement et l’analyse des tissus peuvent prendre plus de temps que les méthodes alternatives basées sur le NGS. |
| Voir les offres |
Clinical Validation of MRD Workflow
with IntegraGen
Learn how IntegraGen, an OncoDNA Group company, utilized Twist NGS products
to validate their highly sensitive (LoD of 0.003%) minimal residual disease (MRD) assay.
Amélioration de la recherche par biopsie liquide
Les outils de NGS aident les chercheurs à développer des analyses de biopsie liquide toujours plus sensibles et
spécifiques. Examinez quelques études et résultats clés.
Une détection plus précoce
L’ADNct surpasse les examens d’imagerie TEP dans la détection précoce du cancer. Validation analytique de NeXT Personal ®, une analyse personnalisée ultra-sensible de l’ADN tumoral circulant. Oncotarget. 2024
Guider la thérapie adaptative
L’ADNct peut fournir des indications précieuses pour les décisions de traitement. On cfDNA In Hematologic Cancers: A Q&A With Dr. Mark Murakami
Des performances avérées
Les modèles épigénétiques peuvent aider à retracer l’origine de l’ADNct. Sensitive and specific multi-cancer detection and localization using methylation signatures in cell-free DNA. ESMO Annals of Oncology. 2020
Comparaison entre méthodes liquides et méthodes traditionnelles
En plus d’être peu invasives, les biopsies liquides présentent plusieurs avantages par rapport aux méthodes traditionnelles.
Biopsies liquides |
Méthodes classiques |
|
|---|---|---|
| Fréquence d’échantillonnage | Les biopsies liquides sont peu invasives, ce qui permet un échantillonnage fréquent et longitudinal. | La nature invasive des biopsies tissulaires limite le nombre d’échantillons pouvant être prélevés. De même, les examens d’imagerie radiologique peuvent s’avérer coûteux et inconfortables pour les patients. |
| Hétérogénéité | L’ADNct peut provenir de plusieurs compartiments d’une tumeur, ce qui permet d’analyser l’hétérogénéité tumorale. | Les biopsies tissulaires ne capturent qu’un instantané limité de la biologie tumorale et peuvent manquer l’hétérogénéité spatiale et temporelle que de nombreuses tumeurs finissent par développer. |
| Une détection précoce du cancer | L’accessibilité facile de l’ADN acellulaire, ainsi que la capacité à détecter plusieurs types de cancer différents à partir d’une seule analyse, suggèrent que les biopsies liquides peuvent constituer un outil précieux pour le dépistage continu et la détection précoce des tumeurs malignes naissantes. Cependant, la sensibilité et la spécificité varient considérablement selon les types de cancer. | Plusieurs méthodes basées sur l’imagerie et les biomarqueurs se sont avérées efficaces pour détecter certains cancers à un stade précoce. Cependant, beaucoup de ces méthodes sont spécifiques à un organe, ont une validité prédictive variable et peuvent s’avérer extrêmement coûteuses. |
| Test de maladie résiduelle mesurable | Même lorsque peu de cellules cancéreuses survivent au traitement, de l’ADNct peut être libéré dans la circulation. Des analyses NGS sensibles sont capables de le détecter. [ref] | La détection d’une maladie résiduelle par biopsie tissulaire peut nécessiter des procédures invasives et un échantillonnage très précis. Souvent, la limite de détection de l’imagerie radiologique est incapable de détecter une maladie résiduelle avant que les tumeurs ne se reforment. |
| Détection des maladies métastatiques | Une fois libéré par les cellules tumorales, l’ADNct peut être détecté par biopsie liquide où qu’il se trouve. L’analyse des profils de méthylation peut permettre de retracer l’ADNct jusqu’à son tissu d’origine, qu’il s’agisse d’une lésion métastatique ou d’un site primaire. | Les sites courants de métastases peuvent être surveillés par imagerie radiologique, mais la fréquence d’échantillonnage et la sensibilité limitée peuvent retarder la détection de la maladie métastatique. |
| Rapidité | L’utilisation de flux de travail NGS pour détecter l’ADNct peut contribuer à raccourcir les délais d’exécution. | Les laboratoires de pathologie clinique sont souvent configurés pour l’évaluation histopathologique des biopsies tissulaires, mais le traitement et l’analyse des tissus peuvent prendre plus de temps que les méthodes alternatives basées sur le NGS. |
| Voir les offres |
Clinical Validation of MRD Workflow
with IntegraGen
Learn how IntegraGen, an OncoDNA Group company, utilized Twist NGS products
to validate their highly sensitive (LoD of 0.003%) minimal residual disease (MRD) assay.
Produits Twist pour la recherche avec des biopsies liquides
Une détection précoce du cancer
Twist propose plusieurs outils pour soutenir la recherche par biopsies liquides et la détection précoce
du cancer.
Traitements correspondants
Les produits de séquençage NGS de haute qualité de Twist facilitent la recherche sur l’utilité de l’ADNct pour la prise de décision thérapeutique.
Maladie résiduelle mesurable (MRD)
De la préparation de banque à l’enrichissement ciblé, Twist renforce la recherche sur la MRD
Quel est l’outil approprié pour vous ?
Chaque étude est unique et trouver l’outil adapté à la tâche peut s’avérer difficile.
Ne vous contentez pas d’une solution imparfaite.
Nos experts vous aideront à trouver la meilleure voie à suivre pour que vos recherches aillent de l’avant.
Produits Twist pour la recherche avec des biopsies liquides
Une détection précoce du cancer
Twist propose plusieurs outils pour soutenir la recherche par biopsies liquides et la détection précoce
du cancer.
Traitements correspondants
Les produits de séquençage NGS de haute qualité de Twist facilitent la recherche sur l’utilité de l’ADNct pour la prise de décision thérapeutique.
Maladie résiduelle mesurable (MRD)
De la préparation de banque à l’enrichissement ciblé, Twist renforce la recherche sur la MRD
Quel est l’outil approprié pour vous ?
Chaque étude est unique et trouver l’outil adapté à la tâche peut s’avérer difficile.
Ne vous contentez pas d’une solution imparfaite.
Nos experts vous aideront à trouver la meilleure voie à suivre pour que vos recherches aillent de l’avant.
Ce que les scientifiques ont à dire
ADNct du mélanome uvéal
Détection de la maladie résiduelle minime
Nous avons tenté de détecter des mutations pronostiques pertinentes dans l’ADNlc des patients atteints de mélanome uvéal primaire. Le kit de préparation de banque d’ADNlc Twist s’est avéré rapide et facile à utiliser pour préparer des banques. Le produit final a offert un rendement total (ng) élevé avec une amplification PCR minimale. En combinant cette préparation avec la capture hybride Twist, nous avons observé des niveaux de duplication de séquence faibles et une récupération de consensus duplex élevée sur les régions ciblées. Ce faisant, nous avons pu détecter de l’ADNct à de faibles niveaux dans une grande proportion d’échantillons.
Aaron Beasley, PhD, Centre de santé de précision, École des sciences médicales et de la santé, Université Edith Cowan
Avis de non-responsabilité : Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.
Le flux de travail de Twist nous paraissait très prometteur en raison de sa sensibilité et de sa spécificité élevées dans la maladie résiduelle minime, même à des niveaux très faibles. L’intégration de panels informés sur les tumeurs et de technologies de séquençage avancées en fait une solution robuste pour surveiller la progression de la maladie et soutenir une oncologie de précision. De plus, le côté personnalisable du flux de travail nous permet de l’adapter à des types de cancer spécifiques, avec un délai d’exécution impressionnant pour un panel conçu en deux semaines seulement. Cette efficacité constitue un avantage significatif dans les environnements cliniques et de recherche. Par ailleurs, la possibilité de multiplexer les échantillons offre des avantages de débit significatifs (optimisation du temps, rentabilité et qualité des données préservée).
IntegraGen, filiale du groupe OncoDNA
Avis de non-responsabilité : Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.
Ce que les scientifiques ont à dire
ADNct du mélanome uvéal
Détection de la maladie résiduelle minime
Nous avons tenté de détecter des mutations pronostiques pertinentes dans l’ADNlc des patients atteints de mélanome uvéal primaire. Le kit de préparation de banque d’ADNlc Twist s’est avéré rapide et facile à utiliser pour préparer des banques. Le produit final a offert un rendement total (ng) élevé avec une amplification PCR minimale. En combinant cette préparation avec la capture hybride Twist, nous avons observé des niveaux de duplication de séquence faibles et une récupération de consensus duplex élevée sur les régions ciblées. Ce faisant, nous avons pu détecter de l’ADNct à de faibles niveaux dans une grande proportion d’échantillons.
Aaron Beasley, PhD, Centre de santé de précision, École des sciences médicales et de la santé, Université Edith Cowan
Avis de non-responsabilité : Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.
Le flux de travail de Twist nous paraissait très prometteur en raison de sa sensibilité et de sa spécificité élevées dans la maladie résiduelle minime, même à des niveaux très faibles. L’intégration de panels informés sur les tumeurs et de technologies de séquençage avancées en fait une solution robuste pour surveiller la progression de la maladie et soutenir une oncologie de précision. De plus, le côté personnalisable du flux de travail nous permet de l’adapter à des types de cancer spécifiques, avec un délai d’exécution impressionnant pour un panel conçu en deux semaines seulement. Cette efficacité constitue un avantage significatif dans les environnements cliniques et de recherche. Par ailleurs, la possibilité de multiplexer les échantillons offre des avantages de débit significatifs (optimisation du temps, rentabilité et qualité des données préservée).
IntegraGen, filiale du groupe OncoDNA
Avis de non-responsabilité : Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.
Présentation des ressources
Les produits Twist sont destinés à la recherche uniquement. Les produits présentés ici ne sont pas destinés au diagnostic, à la prévention ou au traitement d’une maladie ou d’une affection. Twist n’assume aucune responsabilité en cas d’utilisation du produit pour des applications auxquelles il n’est pas destiné. Les résultats sont spécifiques à l’institution où ils ont été obtenus. Les résultats présentés sont spécifiques à chaque client et ne doivent pas être interprétés comme une indication des performances dans toutes les institutions.
1. Liao, Hao, and Huiping Li. “Advances in the Detection Technologies and Clinical Applications of Circulating Tumor DNA in Metastatic Breast Cancer.” Cancer management and research vol. 12 3547-3560. 18 May. 2020, doi:10.2147/CMAR.S249041
2. Cirmena, Gabriella et al. “Assessment of Circulating Nucleic Acids in Cancer: From Current Status to Future Perspectives and Potential Clinical Applications.” Cancers vol. 13,14 3460. 10 Jul. 2021, doi:10.3390/cancers13143460
3. Wang, Hai-Yun et al. “Pan-cancer Analysis of Tumor Mutational Burden and Homologous Recombination DNA Damage Repair Using Targeted Next-Generation Sequencing.” Cancer research and treatment vol. 53,4 (2021): 973-982. doi:10.4143/crt.2020.798
4. Noor, Jawad et al. “Advancements and Applications of Liquid Biopsies in Oncology: A Narrative Review.” Cureus vol. 15,7 e42731. 31 Jul. 2023, doi:10.7759/cureus.42731
5. Raez, Luis E et al. “Liquid Biopsy Versus Tissue Biopsy to Determine Front Line Therapy in Metastatic Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC).” Clinical lung cancer vol. 24,2 (2023): 120-129. doi:10.1016/j.cllc.2022.11.007
6. Joshua D. Schiffman et al. Early Detection of Cancer: Past, Present, and Future. Am Soc Clin Oncol Educ Book 35, 57-65(2015). DOI:10.14694/EdBook_AM.2015.35.57
7. Connal, S., Cameron, J.M., Sala, A. et al. Liquid biopsies: the future of cancer early detection. J Transl Med 21, 118 (2023). https://doi.org/10.1186/s12967-023-03960-8
8. Northcott, Josette et al. “Analytical validation of NeXT Personal®, an ultra-sensitive personalized circulating tumor DNA assay.” Oncotarget vol. 15 200-218. 14 Mar. 2024, doi:10.18632/oncotarget.28565
Présentation des ressources
Les produits Twist sont destinés à la recherche uniquement. Les produits présentés ici ne sont pas destinés au diagnostic, à la prévention ou au traitement d’une maladie ou d’une affection. Twist n’assume aucune responsabilité en cas d’utilisation du produit pour des applications auxquelles il n’est pas destiné. Les résultats sont spécifiques à l’institution où ils ont été obtenus. Les résultats présentés sont spécifiques à chaque client et ne doivent pas être interprétés comme une indication des performances dans toutes les institutions.
1. Liao, Hao, and Huiping Li. “Advances in the Detection Technologies and Clinical Applications of Circulating Tumor DNA in Metastatic Breast Cancer.” Cancer management and research vol. 12 3547-3560. 18 May. 2020, doi:10.2147/CMAR.S249041
2. Cirmena, Gabriella et al. “Assessment of Circulating Nucleic Acids in Cancer: From Current Status to Future Perspectives and Potential Clinical Applications.” Cancers vol. 13,14 3460. 10 Jul. 2021, doi:10.3390/cancers13143460
3. Wang, Hai-Yun et al. “Pan-cancer Analysis of Tumor Mutational Burden and Homologous Recombination DNA Damage Repair Using Targeted Next-Generation Sequencing.” Cancer research and treatment vol. 53,4 (2021): 973-982. doi:10.4143/crt.2020.798
4. Noor, Jawad et al. “Advancements and Applications of Liquid Biopsies in Oncology: A Narrative Review.” Cureus vol. 15,7 e42731. 31 Jul. 2023, doi:10.7759/cureus.42731
5. Raez, Luis E et al. “Liquid Biopsy Versus Tissue Biopsy to Determine Front Line Therapy in Metastatic Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC).” Clinical lung cancer vol. 24,2 (2023): 120-129. doi:10.1016/j.cllc.2022.11.007
6. Joshua D. Schiffman et al. Early Detection of Cancer: Past, Present, and Future. Am Soc Clin Oncol Educ Book 35, 57-65(2015). DOI:10.14694/EdBook_AM.2015.35.57
7. Connal, S., Cameron, J.M., Sala, A. et al. Liquid biopsies: the future of cancer early detection. J Transl Med 21, 118 (2023). https://doi.org/10.1186/s12967-023-03960-8
8. Northcott, Josette et al. “Analytical validation of NeXT Personal®, an ultra-sensitive personalized circulating tumor DNA assay.” Oncotarget vol. 15 200-218. 14 Mar. 2024, doi:10.18632/oncotarget.28565
