Optimisation des codons

We have moved beyond simple codon frequency tables. Our new algorithm prioritizes biological expression by focusing on:

• mRNA Stability
• Secondary Structure
• Ribosome Processivity

We have decoupled manufacturability parameters from the core optimization to focus primarily on protein expression. However, if the algorithm cannot find a manufacturable solution, it will automatically attempt to fix localized regions of extreme complexity. We do this while minimizing any impact on the expression profile.

Important: While we optimize for the best possible DNA composition, please remember that protein expression is multifactorial; DNA sequence is just one of many variables influencing your final yield.

À l’heure actuelle, nous ne sommes pas en mesure de synthétiser des gènes évalués comme étant Impossibles. Plusieurs facteurs font que notre algorithme évalue un gène comme étant Impossible et les paramètres particuliers sont spécifiques à la séquence du gène. Notre algorithme exclusif a été développé en utilisant l’apprentissage machine. Outre l’apprentissage machine, notre algorithme tient compte des facteurs suivants :

• Pourcentage de GC entre 25 et 65 %
• Longueur max. d’homopolymère < 10
• Faible homologie

Une combinaison unique de ce qui précède aboutit à une évaluation de la séquence de gènes spécifique comme étant Impossible.

Twist supports over 150 organisms, including most frequently used organisms such as E. coli, human, CHO, mouse and yeast.

We have moved beyond simple codon frequency tables. Our new algorithm prioritizes biological expression by focusing on:

• mRNA Stability
• Secondary Structure
• Ribosome Processivity

We have decoupled manufacturability parameters from the core optimization to focus primarily on protein expression. However, if the algorithm cannot find a manufacturable solution, it will automatically attempt to fix localized regions of extreme complexity. We do this while minimizing any impact on the expression profile.

Important: While we optimize for the best possible DNA composition, please remember that protein expression is multifactorial; DNA sequence is just one of many variables influencing your final yield.

À l’heure actuelle, nous ne sommes pas en mesure de synthétiser des gènes évalués comme étant Impossibles. Plusieurs facteurs font que notre algorithme évalue un gène comme étant Impossible et les paramètres particuliers sont spécifiques à la séquence du gène. Notre algorithme exclusif a été développé en utilisant l’apprentissage machine. Outre l’apprentissage machine, notre algorithme tient compte des facteurs suivants :

• Pourcentage de GC entre 25 et 65 %
• Longueur max. d’homopolymère < 10
• Faible homologie

Une combinaison unique de ce qui précède aboutit à une évaluation de la séquence de gènes spécifique comme étant Impossible.

Twist supports over 150 organisms, including most frequently used organisms such as E. coli, human, CHO, mouse and yeast.