Préparation de banque

Oui, les Twist Library Prep Kits sont adaptés à la création de banques pour le séquençage du génome entier.

Comme la plupart des applications de WGS utilisent des longueurs de lecture importantes (2x151 pour le séquençage du génome entier contre 2x101 ou 2x76 pour le séquençage de l’exome entier), les conditions de fragmentation doivent être modifiées pour tenir compte des longueurs supérieures de fragments.

En ce qui concerne les kits de fragmentation enzymatique, la longueur dépend de trois facteurs : la durée, la température et l'ADN d’entrée.

Pour la fragmentation mécanique, les conditions (durée, puissance, facteur utile et cycles par rafale) doivent être définies de façon à prendre en charge des longueurs de fragments supérieures.

Oui ; outre ses kits pour fragmentation enzymatique, Twist propose aussi les kits de préparation de banque suivants à utiliser avec la fragmentation mécanique :

100875 : Twist Library Preparation Kit, fragmentation mécanique, 16 échantillons (enzymes et tampons inclus)

101280 : Twist Library Preparation Kit, fragmentation mécanique, 16 échantillons (enzymes, tampons et billes de purification inclus)

100876 : Twist Library Preparation Kit, fragmentation mécanique, 96 échantillons (enzymes et tampons inclus)

101281:  Twist Library Preparation Kit, fragmentation mécanique, 96 échantillons (enzymes, tampons et billes de purification inclus)

Remarque relative à la préparation de banque  : vous aurez également besoin d’adaptateurs

101307 : Twist Universal Adapter System, 16 échantillons

101308 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque A

101309 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque B

101310 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque C

101311 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque D

Pour une entrée de 50 ng d’ADN, le rapport entre adaptateur et ADN est d’environ 200:1.

Oui, Twist vend des composants de kits NGS pour permettre une flexibilité maximale. Vous pouvez obtenir la liste complète des composants pouvant être commandés en vous connectant à votre compte Twist. Vous pouvez commander les composants suivants :

 Composants pour préparation de banque      

• PN 100253 – TWIST LIBRARY PREP EF KIT 1, 16 ÉCHANTILLONS    
• PN 100875 – TWIST LIBRARY PREP MF KIT 1, 16 ÉCHANTILLONS   
• PN 100401 – TWIST LIBRARY PREP KIT 2, 16 ÉCHANTILLONS                     
• PN 100572 – TWIST LIBRARY PREP EF KIT 1, 96 ÉCHANTILLONS    
• PN 100876 – TWIST LIBRARY PREP MF KIT 1, 96 ÉCHANTILLONS   
• PN 100573 – TWIST LIBRARY PREP KIT 2, 96 ÉCHANTILLONS                     

Adaptateurs combinatoires        

• PN 100255 – 16 ÉCHANTILLONS 

Adaptateurs uniques à double indice         

• PN 101307 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 16 ÉCHANTILLONS    
• PN 101308 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 ÉCHANTILLONS – PLAQUE A           
• PN 101309 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 ÉCHANTILLONS – PLAQUE B
• PN 101310 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 ÉCHANTILLONS – PLAQUE C
• PN 101311 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 ÉCHANTILLONS – PLAQUE D

Produits de blocage         

• PN 100856 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 2 RÉACTIONS   
• PN 100578 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 12 RÉACTIONS 
• PN 100767 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 96 RÉACTIONS             

*Réactifs d’hybridation         

• PN 101263 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION, 2 RÉACTIONS      
• PN 100930 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION, 12 RÉACTIONS    
• PN 100982 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION, 96 RÉACTIONS    

**Réactifs d’hybridation rapide  

• PN 101260 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION RAPIDE, 2 RÉACTIONS         
• PN 100964 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION RAPIDE, 12 RÉACTIONS       
• PN 100968 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION RAPIDE, 96 RÉACTIONS       

*Tampons de lavage 

• PN 101264 – TAMPONS DE LAVAGE, 2 RÉACTIONS 
• PN 100985 – TAMPONS DE LAVAGE, 12 RÉACTIONS          
• PN 100846 – TAMPONS DE LAVAGE, 96 RÉACTIONS          

*Tampons de lavage rapide      

• PN 101261 – TAMPONS DE LAVAGE RAPIDE, 2 RÉACTIONS    
• PN 100971 – TAMPONS DE LAVAGE RAPIDE, 12 RÉACTIONS  
• PN 100972 – TAMPONS DE LAVAGE RAPIDE, 96 RÉACTIONS  

Billes de purification et de fixation          

• PN 101262 – BILLES DE PURIFICATION ET DE STREPTAVIDINE, 2 RÉACTIONS      
• PN 100983 – BILLES DE PURIFICATION ET DE STREPTAVIDINE, 12 RÉACTIONS    
• PN 100984 – BILLES DE PURIFICATION ET DE STREPTAVIDINE, 96 RÉACTIONS   

*Remarque :  les réactifs d’hybridation standard doivent uniquement être utilisés avec les tampons de lavage standard ; inversement, les réactifs d’hybridation rapide doivent uniquement être utilisés avec les tampons de lavage rapide.  L’association de tampons d’hybridation standard et de tampons de lavage rapide (et inversement) entraînera une mauvaise performance. 

Oui, les adaptateurs de Twist sont compatibles avec les fragments d’ADN produits par fragmentation enzymatique ou mécanique.

Oui ; outre ses kits pour fragmentation mécanique, Twist propose aussi les kits de préparation de banque suivants à utiliser avec la fragmentation enzymatique :

100253 : kit de Préparation de banque Twist, fragmentation enzymatique, 16 échantillons (enzymes et tampons inclus)

101059 : kit de Préparation de banque Twist, fragmentation enzymatique, 16 échantillons (enzymes, tampons et billes de purification inclus)

100572 : kit de Préparation de banque Twist, fragmentation enzymatique, 96 échantillons (enzymes et tampons inclus)

101058 : kit de Préparation de banque Twist, fragmentation enzymatique, 96 échantillons (enzymes, tampons et billes de purification inclu)

Remarque relative à la préparation de banque  : vous aurez également besoin d’adaptateurs

101307 : Twist Universal Adapter System, 16 échantillons

101308 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque A

101309 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque B

101310 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque C

101311 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque D

Twist propose des kits complets* pour la fragmentation enzymatique et pour la fragmentation mécanique. Veuillez noter que ces kits n’incluent pas de panel d’enrichissement :

Fragmentation enzymatique            

• PN 101897 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 16x2 RÉACTIONS          
• PN 101896 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 16x2 RÉACTIONS     
• PN 101901 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI ET STANDARD HYB, 96x12 RÉACTIONS       
• PN 101900 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 96x12 RÉACTIONS    

Fragmentation mécanique        

• PN 101899 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 16x2 RÉACTIONS       
• PN 101898 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 16x2 RÉACTIONS    
• PN 101903 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 96x12 RÉACTIONS     
• PN 101902 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 96x12 RÉACTIONS

* Remarque : vous devez acheter KAPA® HiFi HotStart ReadyMix (Kapa Biosystems®, #KK2601) ou son équivalent pour générer et amplifier des banques.

La taille moyenne de fragment cible recommandée est de 200 bp, ce qui produit une banque d’une taille moyenne d’environ 350 bp. Vous pouvez cependant régler la taille de l’insert en fonction de vos longueurs de lecture du séquençage.  

Oui, les Twist Library Prep Kits sont adaptés à la création de banques pour le séquençage du génome entier.

Comme la plupart des applications de WGS utilisent des longueurs de lecture importantes (2x151 pour le séquençage du génome entier contre 2x101 ou 2x76 pour le séquençage de l’exome entier), les conditions de fragmentation doivent être modifiées pour tenir compte des longueurs supérieures de fragments.

En ce qui concerne les kits de fragmentation enzymatique, la longueur dépend de trois facteurs : la durée, la température et l'ADN d’entrée.

Pour la fragmentation mécanique, les conditions (durée, puissance, facteur utile et cycles par rafale) doivent être définies de façon à prendre en charge des longueurs de fragments supérieures.

Oui ; outre ses kits pour fragmentation enzymatique, Twist propose aussi les kits de préparation de banque suivants à utiliser avec la fragmentation mécanique :

100875 : Twist Library Preparation Kit, fragmentation mécanique, 16 échantillons (enzymes et tampons inclus)

101280 : Twist Library Preparation Kit, fragmentation mécanique, 16 échantillons (enzymes, tampons et billes de purification inclus)

100876 : Twist Library Preparation Kit, fragmentation mécanique, 96 échantillons (enzymes et tampons inclus)

101281:  Twist Library Preparation Kit, fragmentation mécanique, 96 échantillons (enzymes, tampons et billes de purification inclus)

Remarque relative à la préparation de banque  : vous aurez également besoin d’adaptateurs

101307 : Twist Universal Adapter System, 16 échantillons

101308 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque A

101309 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque B

101310 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque C

101311 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque D

Pour une entrée de 50 ng d’ADN, le rapport entre adaptateur et ADN est d’environ 200:1.

Oui, Twist vend des composants de kits NGS pour permettre une flexibilité maximale. Vous pouvez obtenir la liste complète des composants pouvant être commandés en vous connectant à votre compte Twist. Vous pouvez commander les composants suivants :

 Composants pour préparation de banque      

• PN 100253 – TWIST LIBRARY PREP EF KIT 1, 16 ÉCHANTILLONS    
• PN 100875 – TWIST LIBRARY PREP MF KIT 1, 16 ÉCHANTILLONS   
• PN 100401 – TWIST LIBRARY PREP KIT 2, 16 ÉCHANTILLONS                     
• PN 100572 – TWIST LIBRARY PREP EF KIT 1, 96 ÉCHANTILLONS    
• PN 100876 – TWIST LIBRARY PREP MF KIT 1, 96 ÉCHANTILLONS   
• PN 100573 – TWIST LIBRARY PREP KIT 2, 96 ÉCHANTILLONS                     

Adaptateurs combinatoires        

• PN 100255 – 16 ÉCHANTILLONS 

Adaptateurs uniques à double indice         

• PN 101307 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 16 ÉCHANTILLONS    
• PN 101308 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 ÉCHANTILLONS – PLAQUE A           
• PN 101309 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 ÉCHANTILLONS – PLAQUE B
• PN 101310 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 ÉCHANTILLONS – PLAQUE C
• PN 101311 – TWIST UNIVERSAL ADAPTER SYSTEM, 96 ÉCHANTILLONS – PLAQUE D

Produits de blocage         

• PN 100856 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 2 RÉACTIONS   
• PN 100578 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 12 RÉACTIONS 
• PN 100767 – TWIST UNIVERSAL BLOCKERS, 96 RÉACTIONS             

*Réactifs d’hybridation         

• PN 101263 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION, 2 RÉACTIONS      
• PN 100930 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION, 12 RÉACTIONS    
• PN 100982 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION, 96 RÉACTIONS    

**Réactifs d’hybridation rapide  

• PN 101260 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION RAPIDE, 2 RÉACTIONS         
• PN 100964 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION RAPIDE, 12 RÉACTIONS       
• PN 100968 – RÉACTIFS D’HYBRIDATION RAPIDE, 96 RÉACTIONS       

*Tampons de lavage 

• PN 101264 – TAMPONS DE LAVAGE, 2 RÉACTIONS 
• PN 100985 – TAMPONS DE LAVAGE, 12 RÉACTIONS          
• PN 100846 – TAMPONS DE LAVAGE, 96 RÉACTIONS          

*Tampons de lavage rapide      

• PN 101261 – TAMPONS DE LAVAGE RAPIDE, 2 RÉACTIONS    
• PN 100971 – TAMPONS DE LAVAGE RAPIDE, 12 RÉACTIONS  
• PN 100972 – TAMPONS DE LAVAGE RAPIDE, 96 RÉACTIONS  

Billes de purification et de fixation          

• PN 101262 – BILLES DE PURIFICATION ET DE STREPTAVIDINE, 2 RÉACTIONS      
• PN 100983 – BILLES DE PURIFICATION ET DE STREPTAVIDINE, 12 RÉACTIONS    
• PN 100984 – BILLES DE PURIFICATION ET DE STREPTAVIDINE, 96 RÉACTIONS   

*Remarque :  les réactifs d’hybridation standard doivent uniquement être utilisés avec les tampons de lavage standard ; inversement, les réactifs d’hybridation rapide doivent uniquement être utilisés avec les tampons de lavage rapide.  L’association de tampons d’hybridation standard et de tampons de lavage rapide (et inversement) entraînera une mauvaise performance. 

Oui, les adaptateurs de Twist sont compatibles avec les fragments d’ADN produits par fragmentation enzymatique ou mécanique.

Oui ; outre ses kits pour fragmentation mécanique, Twist propose aussi les kits de préparation de banque suivants à utiliser avec la fragmentation enzymatique :

100253 : kit de Préparation de banque Twist, fragmentation enzymatique, 16 échantillons (enzymes et tampons inclus)

101059 : kit de Préparation de banque Twist, fragmentation enzymatique, 16 échantillons (enzymes, tampons et billes de purification inclus)

100572 : kit de Préparation de banque Twist, fragmentation enzymatique, 96 échantillons (enzymes et tampons inclus)

101058 : kit de Préparation de banque Twist, fragmentation enzymatique, 96 échantillons (enzymes, tampons et billes de purification inclu)

Remarque relative à la préparation de banque  : vous aurez également besoin d’adaptateurs

101307 : Twist Universal Adapter System, 16 échantillons

101308 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque A

101309 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque B

101310 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque C

101311 : Twist Universal Adapter System, 96 échantillons - plaque D

Twist propose des kits complets* pour la fragmentation enzymatique et pour la fragmentation mécanique. Veuillez noter que ces kits n’incluent pas de panel d’enrichissement :

Fragmentation enzymatique            

• PN 101897 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 16x2 RÉACTIONS          
• PN 101896 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 16x2 RÉACTIONS     
• PN 101901 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI ET STANDARD HYB, 96x12 RÉACTIONS       
• PN 101900 – TWIST EF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 96x12 RÉACTIONS    

Fragmentation mécanique        

• PN 101899 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 16x2 RÉACTIONS       
• PN 101898 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 16x2 RÉACTIONS    
• PN 101903 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND STANDARD HYB, 96x12 RÉACTIONS     
• PN 101902 – TWIST MF LIBRARY PREP + UDI AND FAST HYB, 96x12 RÉACTIONS

* Remarque : vous devez acheter KAPA® HiFi HotStart ReadyMix (Kapa Biosystems®, #KK2601) ou son équivalent pour générer et amplifier des banques.

La taille moyenne de fragment cible recommandée est de 200 bp, ce qui produit une banque d’une taille moyenne d’environ 350 bp. Vous pouvez cependant régler la taille de l’insert en fonction de vos longueurs de lecture du séquençage.