Est-il possible d’avoir une seule plaque d’échantillons dans une série de séquençage ?

Oui. Dans ce cas, l’index de 6 nucléotides Illumina small RNA TruSeq i7, qui identifie la plaque, ne doit pas être lu. Soit vous n’effectuez pas de lecture d’indexation, soit vous utilisez l’option « --use-bases-mask » pour ignorer la lecture d’indexation 6nt. Cela devrait permettre d’obtenir un seul ensemble de FASTQ pour l’ensemble du cycle de séquençage. Consultez le guide de démux pour plus d’informations.

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