Procédez-vous à la fragmentation du fond dérivé du donneur ?
Non, il s’agit d’un processus artificiel.
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Contrôles synthétiques
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- De quoi est constitué votre ADN acellulaire résiduel ?
- L’approvisionnement en ADN acellulaire résiduel est-il limité ?
- L’ADN acellulaire résiduel provient-il d’un pool mixte de donneurs ?
- S’agit-il d’oligonucléotides de contrôle, d’ARN, et si oui quels en sont les composants ?
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- Procédez-vous à la fragmentation du fond dérivé du donneur ?
- Existe-t-il un risque de biais introduit pour l’expansion de l’ADN acellulaire ?
- Comment élaborez-vous la liste d’ADN acellulaire/de variants ?
- Quelle est la structure des 3’ et 5’ ?
- Quel paramètre WGS et WES permet de qualifier le matériel d’ADN acellulaire et de contrôler la qualité de l’ADN acellulaire Twist ?
- Les mutations dans les normes ont-elles également été confirmées par NGS, ainsi qu’avec la PCR numérique indiquée dans le document ?
- Comment savons-nous que nous sommes très proches de l’ADN acellulaire résiduel naturel ?
- Quel est le tampon d’entrée et de dilution recommandé ?
- Vous ne parvenez pas à trouver des indels ou d’autres variants difficiles à détecter ?
- Quels réactifs (par exemple, préparation de banque) utilisez-vous pour le flux de travail de la biopsie liquide ?
- Recommandez-vous de regrouper ce contrôle avec l’échantillon du patient après la préparation de la banque, ou avant le NGS ?
- Les clients de capture hybride et amplicon ont-ils des besoins différents ?
- Le variant (COSM214499) est toujours élevé en 0 % dans les résultats CQ NGS. Pourquoi ?
- Pour le CQ NGS, utilisez-vous la séquence de capture cible pour les 458 variants ou une séquence du génome entier ?
