Performance technique pour des flux de travail d’ADNlc fiables et évolutifs
Générez des banques de haute qualité à partir d’entrées cfDNA complexes avec un flux de travail rationalisé qui offre une conversion et une sensibilité élevées pour la détection de variants rares. Conçu pour les échantillons à faible entrée et fragmentés, le kit de préparation de banque cfDNA de Twist vous aide à découvrir des informations cruciales en toute confiance et efficacité.
Optimiser la détection des variants rares
Le taux de conversion élevé assure la détection fiable de variants rares (fréquence allélique de variants ≤ 0,1 %). Banques à forte couverture compatibles avec les flux de travail de séquençage duplex pris en charge par le système d’adaptateur UMI de Twist
Rationaliser le flux de travail des échantillons précieux
Performances robustes, même avec une faible entrée d’échantillon (< 1 ng) Banques prêtes à séquencer en 2 heures.
Amplification sans biais
Offre une couverture cohérente sur 5 % à 95 % des GC, préservant la visibilité des régions génomiques difficiles et des cibles difficiles à saisir. Rendements élevés constants provenant de banques complexes, même à une entrée d’ADN ≤ 100 pg. Détecter les variantes en toute confiance grâce à une meilleure fidélité et une réduction du glissement de l’homopolymère
Performance technique pour des flux de travail d’ADNlc fiables et évolutifs
Générez des banques de haute qualité à partir d’entrées cfDNA complexes avec un flux de travail rationalisé qui offre une conversion et une sensibilité élevées pour la détection de variants rares. Conçu pour les échantillons à faible entrée et fragmentés, le kit de préparation de banque cfDNA de Twist vous aide à découvrir des informations cruciales en toute confiance et efficacité.
Optimiser la détection des variants rares
Le taux de conversion élevé assure la détection fiable de variants rares (fréquence allélique de variants ≤ 0,1 %). Banques à forte couverture compatibles avec les flux de travail de séquençage duplex pris en charge par le système d’adaptateur UMI de Twist
Rationaliser le flux de travail des échantillons précieux
Performances robustes, même avec une faible entrée d’échantillon (< 1 ng) Banques prêtes à séquencer en 2 heures.
Amplification sans biais
Offre une couverture cohérente sur 5 % à 95 % des GC, préservant la visibilité des régions génomiques difficiles et des cibles difficiles à saisir. Rendements élevés constants provenant de banques complexes, même à une entrée d’ADN ≤ 100 pg. Détecter les variantes en toute confiance grâce à une meilleure fidélité et une réduction du glissement de l’homopolymère
Données produit
Figure 1. Taux d’erreurs de substitution de base comparables avec et sans amplification TrueAmp. Le kit de préparation de banque d’ADNlc de Twist a été utilisé pour générer des banques avec le modèle de référence d’ADNlc Pan-Cancer v2 de Twist comme matériau d’entrée. Des adaptateurs pleine longueur unique à index double (UDI) de Twist ont été utilisés pendant la ligature pour la condition sans PCR et des adaptateurs universels de Twist ont été utilisés pendant la ligature pour la condition PCR. La condition PCR a été amplifiée à l’aide de 6 cycles avec le mélange de polymérase TrueAmp de Twist et les amorces UDI. Les banques ont été regroupées, séquencées et analysées. Des taux d’erreur comparables sont observés entre les banques sans PCR et TrueAmp.
Figure 2.Le kit de préparation de banque cfDNA Twist produit des banques d’ADN libre circulant à un rendement plus élevé. Après la génération de banques, les échantillons ont été élués dans 20 μL d’eau et 1 µL a été quantifié grâce au Qubit™ dsDNA Broad Range Kit.
Figure 3.Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation assurent une détection sensible et précise des variants avec une fréquence allélique de variants de 0,25 %. Les banques ont été créées en uniplexe avec un panel oncologique personnalisé de 50 kb ciblant 217 sites de variant SNP dans le matériel standard Pan-Cancer. Les variants manqués sont calculés en additionnant les sites avec moins d’1 famille de variants divisés par le total des sites de variants détectables.
Figure 4.Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation offrent une plus grande complexité avec et sans déduplication UMI.
Figure 5.Le kit de préparation de banque cfDNA Twist produit des banques d’ADN libre circulant à un rendement plus élevé avec des échantillons d’ADN acellulaire natif. Après la génération de banques, les échantillons ont été élués dans 20 μL d’eau et 1 µL a été quantifié grâce au Qubit™ dsDNA Broad Range Kit.
Flux de travail du kit de préparation de banque cfDNA avec mélange de polymérase TrueAmp
Le flux de travail d’ADNlc exploite l’équilibre GC technique et l’amplification haute fidélité. Cette conception offre un rendement d’amplification élevé tout en minimisant les erreurs introduites par PCR susceptibles de compromettre la détection des variants à basse fréquence.
Il en résulte des banques uniformes et de haute qualité dans un flux de travail rapide de 2 heures. Le contrôle de démarrage à chaud basé sur aptamère offre une stabilité à température ambiante pour une configuration automatisée, tandis que le mélange maître à tube unique 2× rationalise les flux de travail de WGS et d’enrichissement ciblé.
Données produit
Figure 1. Taux d’erreurs de substitution de base comparables avec et sans amplification TrueAmp. Le kit de préparation de banque d’ADNlc de Twist a été utilisé pour générer des banques avec le modèle de référence d’ADNlc Pan-Cancer v2 de Twist comme matériau d’entrée. Des adaptateurs pleine longueur unique à index double (UDI) de Twist ont été utilisés pendant la ligature pour la condition sans PCR et des adaptateurs universels de Twist ont été utilisés pendant la ligature pour la condition PCR. La condition PCR a été amplifiée à l’aide de 6 cycles avec le mélange de polymérase TrueAmp de Twist et les amorces UDI. Les banques ont été regroupées, séquencées et analysées. Des taux d’erreur comparables sont observés entre les banques sans PCR et TrueAmp.
Figure 2.Le kit de préparation de banque cfDNA Twist produit des banques d’ADN libre circulant à un rendement plus élevé. Après la génération de banques, les échantillons ont été élués dans 20 μL d’eau et 1 µL a été quantifié grâce au Qubit™ dsDNA Broad Range Kit.
Figure 3.Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation assurent une détection sensible et précise des variants avec une fréquence allélique de variants de 0,25 %. Les banques ont été créées en uniplexe avec un panel oncologique personnalisé de 50 kb ciblant 217 sites de variant SNP dans le matériel standard Pan-Cancer. Les variants manqués sont calculés en additionnant les sites avec moins d’1 famille de variants divisés par le total des sites de variants détectables.
Figure 4.Le kit de préparation de banque cfDNA Twist et le kit de mélange pour hybridation offrent une plus grande complexité avec et sans déduplication UMI.
Figure 5.Le kit de préparation de banque cfDNA Twist produit des banques d’ADN libre circulant à un rendement plus élevé avec des échantillons d’ADN acellulaire natif. Après la génération de banques, les échantillons ont été élués dans 20 μL d’eau et 1 µL a été quantifié grâce au Qubit™ dsDNA Broad Range Kit.
Flux de travail du kit de préparation de banque cfDNA avec mélange de polymérase TrueAmp
Le flux de travail d’ADNlc exploite l’équilibre GC technique et l’amplification haute fidélité. Cette conception offre un rendement d’amplification élevé tout en minimisant les erreurs introduites par PCR susceptibles de compromettre la détection des variants à basse fréquence.
Il en résulte des banques uniformes et de haute qualité dans un flux de travail rapide de 2 heures. Le contrôle de démarrage à chaud basé sur aptamère offre une stabilité à température ambiante pour une configuration automatisée, tandis que le mélange maître à tube unique 2× rationalise les flux de travail de WGS et d’enrichissement ciblé.
Ressources mises en évidence
Fiche produit
Protocole
Note technique
Ressources mises en évidence
Flux de travail et applications connexes
Les flux de travail d’enrichissement ciblé avec Twist offrent une couverture évolutive, à faible biais et hautement uniforme dans les grandes régions génomiques complexes, permettant une découverte plus large, une sensibilité plus élevée et une plus grande flexibilité que les méthodes basées sur amplicon ou sur matrice.
Twist propose plusieurs outils pour soutenir la recherche par biopsies liquides et la caractérisation précoce du cancer.
Flux de travail et applications connexes
Les flux de travail d’enrichissement ciblé avec Twist offrent une couverture évolutive, à faible biais et hautement uniforme dans les grandes régions génomiques complexes, permettant une découverte plus large, une sensibilité plus élevée et une plus grande flexibilité que les méthodes basées sur amplicon ou sur matrice.
Twist propose plusieurs outils pour soutenir la recherche par biopsies liquides et la caractérisation précoce du cancer.
