Conçu pour les génomes entiers : couverture complète sans biais
Le kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist est conçu pour générer des banques de génomes entiers de haute qualité sans amplification, préservant ainsi la représentation du génome natif. Basé sur la chimie optimisée de fragmentation et de ligature enzymatiques de Twist, le flux de travail offre des tailles d’insert cohérentes, un faible biais de ligature et une couverture uniforme sur l’ensemble du génome, permettant une caractérisation précise des variants.
Réduction de l’abandon lié à l’AT dans le génome
La préparation de banque sans PCR préserve la représentation du génome natif, réduisant
ainsi les abandons liés à l’AT et améliorant la couverture uniforme dans les régions difficiles.
Conçu pour la mise à l’échelle des flux de travail
Performances optimisées grâce aux adaptateurs UDI pleine longueur de Twist, qui prennent en charge le multiplexage de 1 536 échantillons en une seule série.
Maximiser la conversion. Minimiser les biais.
La réduction du biais de ligature et l’amélioration de l’efficacité de conversion préservent la véritable représentation du génome et génèrent des lectures de séquençage plus utilisables à partir de chaque échantillon.
Conçu pour les génomes entiers : couverture complète sans biais
Le kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist est conçu pour générer des banques de génomes entiers de haute qualité sans amplification, préservant ainsi la représentation du génome natif. Basé sur la chimie optimisée de fragmentation et de ligature enzymatiques de Twist, le flux de travail offre des tailles d’insert cohérentes, un faible biais de ligature et une couverture uniforme sur l’ensemble du génome, permettant une caractérisation précise des variants.
Réduction de l’abandon lié à l’AT dans le génome
La préparation de banque sans PCR préserve la représentation du génome natif, réduisant
ainsi les abandons liés à l’AT et améliorant la couverture uniforme dans les régions difficiles.
Conçu pour la mise à l’échelle des flux de travail
Performances optimisées grâce aux adaptateurs UDI pleine longueur de Twist, qui prennent en charge le multiplexage de 1 536 échantillons en une seule série.
Maximiser la conversion. Minimiser les biais.
La réduction du biais de ligature et l’amélioration de l’efficacité de conversion préservent la véritable représentation du génome et génèrent des lectures de séquençage plus utilisables à partir de chaque échantillon.
Données produit
Figure 1. Comparaison du rendement de la banque sans PCR entre les entrées. La concentration finale de la banque (nM) a été mesurée suivant la préparation de banque sans PCR à l’aide des entrées d’ADN indiquées. La préparation de banque WGS sans PCR de Twist a généré des rendements de banque plus élevés que les flux de travail concurrents à des entrées équivalentes et a maintenu de solides performances à des entrées inférieures.
Figure 2.Le kit produit des inserts systématiquement de grande taille sur une large gamme d’échantillons d’ADN. (A) La taille médiane de l’insert est représentée pour 300 ng, 75 ng et 37,5 ng d’entrée d’échantillon d’ADN NA12878. (B) Le pourcentage de chevauchement (qui mesure la quantité de valeurs de séquençage à l’extrémité appariée couvrant les mêmes bases d’ADN) est représenté pour 300 ng, 75 ng et 37,5 ng d’entrée d’échantillon NA12878.
Figure 3.Ajustement du kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist.
A : Cinq électrophérogrammes de banques NGS générés à l’aide de temps de fragmentation différents. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur plusieurs temps à 32 °C.
Figure 4. Le kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist offre une répartition plus homogène de la couverture sur différents contenus de GC. Le kit montre un biais GC réduit, même à des entrées faibles, réduisant ainsi la nécessité d’un séquençage supplémentaire pour obtenir une couverture uniforme et une meilleure détection des variants dans les régions à teneur élevée et faible en GC.
Données produit
Conçu pour préserver le rendement de la banque à faible entrée
La préparation de banque WGS sans PCR de Twist offre des rendements de banque robustes et une taille de banque constante même lorsque l’entrée d’ADN est réduite. La chimie de ligase modifiée favorise une ligature efficace et uniforme, contribuant à maintenir des banques prêtes au séquençage à tous les niveaux d’entrée sans amplification.
Figure 1. Rendement élevé de la banque et taille estimée de la banque. (A) Une faible entrée d’ADN présente un rendement de banque utilisable. (B) La diversité de la banque est maintenue même avec une faible entrée d’ADN. Les banques du kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist ont été préparées à l’aide d’ADN génomique NA12878 à 300 ng, 75 ng et 37,5 ng.
Contrôle fiable de la taille de l’insert entre les entrées
La préparation de banque WGS sans PCR de Twist maintient des tailles d’insert médianes constantes de 300 ng à 37,5 ng d’entrée d’ADN. Un chevauchement de lecture minimal entre les échantillons garantit un séquençage efficace et une couverture fiable de l’ensemble du génome.
Figure 2.Le kit produit des inserts systématiquement de grande taille sur une large gamme d’échantillons d’ADN. (A) La taille médiane de l’insert est représentée pour 300 ng, 75 ng et 37,5 ng d’entrée d’échantillon d’ADN NA12878. (B) Le pourcentage de chevauchement (qui mesure la quantité de valeurs de séquençage à l’extrémité appariée couvrant les mêmes bases d’ADN) est représenté pour 300 ng, 75 ng et 37,5 ng d’entrée d’échantillon NA12878.
Longueurs de fragments contrôlables pour un séquençage plus efficace
Les kits de préparation de banque TrueAmp de Twist permettent un contrôle précis de la taille de l’insert sur une large gamme, permettant aux utilisateurs d’ajuster la préparation de la banque aux exigences spécifiques de leurs flux de travail de séquençage.
Figure 3. Ajustement du kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist.
A : Cinq électrophérogrammes de banques NGS générés à l’aide de temps de fragmentation différents. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur plusieurs temps à 32 °C.
Biais GC minimisé pour une couverture plus uniforme
Sur l’ensemble des entrées d’ADN, la préparation de banque WGS sans PCR de Twist maintient une couverture cohérente du contenu GC.
Figure 4. Le kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist offre une répartition plus homogène de la couverture sur différents contenus de GC. Le kit montre un biais GC réduit, même à des entrées faibles, réduisant ainsi la nécessité d’un séquençage supplémentaire pour obtenir une couverture uniforme et une meilleure détection des variants dans les régions à teneur élevée et faible en GC.
Mode de fonctionnement
Étape 
Fragmentation enzymatique
L’ADN d’échantillon extrait est fragmenté avec précision, produisant des tailles d’insert homogènes et ajustables.
Étape 
Ligature de l’adaptateur
La ligase Twist optimisée permet de maximiser l’efficacité de conversion et de minimiser les biais de ligature.
Données produit
Figure 1. Comparaison du rendement de la banque sans PCR entre les entrées. La concentration finale de la banque (nM) a été mesurée suivant la préparation de banque sans PCR à l’aide des entrées d’ADN indiquées. La préparation de banque WGS sans PCR de Twist a généré des rendements de banque plus élevés que les flux de travail concurrents à des entrées équivalentes et a maintenu de solides performances à des entrées inférieures.
Figure 2.Le kit produit des inserts systématiquement de grande taille sur une large gamme d’échantillons d’ADN. (A) La taille médiane de l’insert est représentée pour 300 ng, 75 ng et 37,5 ng d’entrée d’échantillon d’ADN NA12878. (B) Le pourcentage de chevauchement (qui mesure la quantité de valeurs de séquençage à l’extrémité appariée couvrant les mêmes bases d’ADN) est représenté pour 300 ng, 75 ng et 37,5 ng d’entrée d’échantillon NA12878.
Figure 3.Ajustement du kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist.
A : Cinq électrophérogrammes de banques NGS générés à l’aide de temps de fragmentation différents. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur plusieurs temps à 32 °C.
Figure 4. Le kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist offre une répartition plus homogène de la couverture sur différents contenus de GC. Le kit montre un biais GC réduit, même à des entrées faibles, réduisant ainsi la nécessité d’un séquençage supplémentaire pour obtenir une couverture uniforme et une meilleure détection des variants dans les régions à teneur élevée et faible en GC.
Données produit
Conçu pour préserver le rendement de la banque à faible entrée
La préparation de banque WGS sans PCR de Twist offre des rendements de banque robustes et une taille de banque constante même lorsque l’entrée d’ADN est réduite. La chimie de ligase modifiée favorise une ligature efficace et uniforme, contribuant à maintenir des banques prêtes au séquençage à tous les niveaux d’entrée sans amplification.
Figure 1. Rendement élevé de la banque et taille estimée de la banque. (A) Une faible entrée d’ADN présente un rendement de banque utilisable. (B) La diversité de la banque est maintenue même avec une faible entrée d’ADN. Les banques du kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist ont été préparées à l’aide d’ADN génomique NA12878 à 300 ng, 75 ng et 37,5 ng.
Contrôle fiable de la taille de l’insert entre les entrées
La préparation de banque WGS sans PCR de Twist maintient des tailles d’insert médianes constantes de 300 ng à 37,5 ng d’entrée d’ADN. Un chevauchement de lecture minimal entre les échantillons garantit un séquençage efficace et une couverture fiable de l’ensemble du génome.
Figure 2.Le kit produit des inserts systématiquement de grande taille sur une large gamme d’échantillons d’ADN. (A) La taille médiane de l’insert est représentée pour 300 ng, 75 ng et 37,5 ng d’entrée d’échantillon d’ADN NA12878. (B) Le pourcentage de chevauchement (qui mesure la quantité de valeurs de séquençage à l’extrémité appariée couvrant les mêmes bases d’ADN) est représenté pour 300 ng, 75 ng et 37,5 ng d’entrée d’échantillon NA12878.
Longueurs de fragments contrôlables pour un séquençage plus efficace
Les kits de préparation de banque TrueAmp de Twist permettent un contrôle précis de la taille de l’insert sur une large gamme, permettant aux utilisateurs d’ajuster la préparation de la banque aux exigences spécifiques de leurs flux de travail de séquençage.
Figure 3. Ajustement du kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist.
A : Cinq électrophérogrammes de banques NGS générés à l’aide de temps de fragmentation différents. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur plusieurs temps à 32 °C.
Biais GC minimisé pour une couverture plus uniforme
Sur l’ensemble des entrées d’ADN, la préparation de banque WGS sans PCR de Twist maintient une couverture cohérente du contenu GC.
Figure 4. Le kit de préparation de banque WGS sans PCR de Twist offre une répartition plus homogène de la couverture sur différents contenus de GC. Le kit montre un biais GC réduit, même à des entrées faibles, réduisant ainsi la nécessité d’un séquençage supplémentaire pour obtenir une couverture uniforme et une meilleure détection des variants dans les régions à teneur élevée et faible en GC.
Mode de fonctionnement
Étape
Fragmentation enzymatique
L’ADN d’échantillon extrait est fragmenté avec précision, produisant des tailles d’insert homogènes et ajustables.
Étape
Ligature de l’adaptateur
La ligase Twist optimisée permet de maximiser l’efficacité de conversion et de minimiser les biais de ligature.
Ressources mises en évidence
Fiche produit
Protocole
Ressources mises en évidence
Flux de travail et applications connexes
Twist propose une suite complète de kits de préparation de banque et de produits accessoires, vous permettant d’adapter vos flux de travail WGS à vos besoins uniques.
Flux de travail et applications connexes
Twist propose une suite complète de kits de préparation de banque et de produits accessoires, vous permettant d’adapter vos flux de travail WGS à vos besoins uniques.
