Conçu pour plus : couverture uniforme, rendements plus élevés et caractérisation fiable des variants.
La préparation de banque TrueAmp de Twist produit des banques cohérentes et de haute qualité pour les flux de travail d’enrichissement de cibles pour NGS, en particulier avec les échantillons difficiles à faible entrée. Alimenté par la polymérase TrueAmp de Twist et optimisé pour la fragmentation enzymatique, ce flux de travail offre une efficacité de conversion élevée, un faible biais GC et une couverture équilibrée, permettant une caractérisation précise des variants dans les régions génomiques difficiles.
Uniformité fiable dans les régions génomiques difficiles
L’amélioration de la cohérence de la couverture réduit les abandons liés à l’AT et GC, offrant une meilleure représentation des régions difficiles.
Efficacité de conversion élevée à partir d’échantillons à faible entrée et dégradés
Les rendements élevés de la banque sur les échantillons à faible entrée, FFPE et de qualité variable contribuent à préserver les matériaux précieux en réduisant la nécessité de renouvellements.
Amplification haute fidélité pour une détection fiable des variants
La polymérase TrueAmp de Twist minimise les erreurs induites par l’amplification ainsi que les biais, permettant une détection précise des variants à faible VAF.
Conçu pour plus : couverture uniforme, rendements plus élevés et caractérisation fiable des variants.
La préparation de banque TrueAmp de Twist produit des banques cohérentes et de haute qualité pour les flux de travail d’enrichissement de cibles pour NGS, en particulier avec les échantillons difficiles à faible entrée. Alimenté par la polymérase TrueAmp de Twist et optimisé pour la fragmentation enzymatique, ce flux de travail offre une efficacité de conversion élevée, un faible biais GC et une couverture équilibrée, permettant une caractérisation précise des variants dans les régions génomiques difficiles.
Uniformité fiable dans les régions génomiques difficiles
L’amélioration de la cohérence de la couverture réduit les abandons liés à l’AT et GC, offrant une meilleure représentation des régions difficiles.
Efficacité de conversion élevée à partir d’échantillons à faible entrée et dégradés
Les rendements élevés de la banque sur les échantillons à faible entrée, FFPE et de qualité variable contribuent à préserver les matériaux précieux en réduisant la nécessité de renouvellements.
Amplification haute fidélité pour une détection fiable des variants
La polymérase TrueAmp de Twist minimise les erreurs induites par l’amplification ainsi que les biais, permettant une détection précise des variants à faible VAF.
Données produit
Figure 1. Comparaison des performances des banques enrichies avec des échantillons FFPE dégradés à faible entrée (DIN < 2,2) entre le kit de préparation de banque TrueAmp et le kit K concurrent, démontrant la solution optimale pour les applications d’échantillons difficiles. (A) Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist génère un rendement supérieur de la banque avant capture, indiquant une construction de banque et une efficacité d’amplification élevées. (B) Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist présente une plus grande complexité de banque que les kits concurrents. Cela permet d’obtenir plus de molécules d’ADN uniques séquençables dans la banque, réduisant ainsi les coûts de séquençage. (C) Offre une couverture supérieure.
Figure 2.Comparaison des performances des banques enrichies avec des échantillons FFPE dégradés à faible entrée (DIN < 2,2) entre le kit de préparation de banque TrueAmp et le kit K concurrent, démontrant la solution optimale pour les applications d’échantillons difficiles. (A) Offre une excellente uniformité de la couverture, mesurée par une pénalité de base fold-80 inférieure. (B) Réduction des régions sans couverture, mesurée par le pourcentage de couverture zéro.
Figure 3.Trace de biais GC normalisée montrant une meilleure couverture de la polymérase TrueAmp de Twist. Les banques ont été préparées à l’aide du kit de préparation de banque TrueAmp de Twist et amplifiées avec différents cycles et polymérases.
Panel supérieur : Couverture normalisée par rapport aux tracés de fenêtre GC comparant les polymérases à 3 cycles de PCR.
Panel inférieur : Couverture normalisée par rapport aux tracés de fenêtre GC comparant les polymérases à 16 cycles de PCR.
Figure 4. Taille fiable de la banque avec le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist, même à partir d’entrées ultra-faibles.
500 ng, 100 ng, 50 ng, 10 ng et 1 ng (ADNg) ont été fragmentés à 32 °C. 3, 5, 6, 8, 10 et 14 cycles de PCR ont respectivement été utilisés pour l’amplification. Les échantillons ont été effectués en double exemplaire.
A : Électrophérogrammes des banques NGS générés avec le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist.
B : Concentration des banques après amplification pour diverses entrées d’ADN.
Figure 5. Ajustement du kit de préparation de banque TrueAmp de Twist.
A : Cinq électrophérogrammes de banques NGS générés à l’aide de temps de fragmentation différents. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur plusieurs temps à 32 °C. 6 cycles de PCR ont été utilisés pour l’amplification.
B : Taille médiane de l’insert par rapport au temps. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur divers temps à 32 °C. L’amplification a été réalisée à l’aide de 6 cycles de PCR. Les échantillons ont été capturés à l’aide du panel Exome 2.0 de Twist.
Données produit
Rendement et couverture élevés là où les échantillons sont les plus difficiles
La préparation de banque TrueAmp de Twist offre un rendement de pré-capture plus élevé, des tailles de banques cohérentes et une couverture cible moyenne plus forte à partir d’ADN FFPE dégradé à faible entrée. Ces gains réduisent le besoin de cycles PCR excessifs, préservent la complexité de la banque et augmentent la fiabilité des résultats de séquençage des échantillons difficiles.
Figure 1. Comparaison des performances des banques enrichies avec des échantillons FFPE dégradés à faible entrée (DIN < 2,2) entre le kit de préparation de banque TrueAmp et le kit K concurrent, démontrant la solution optimale pour les applications d’échantillons difficiles. (A) Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist génère un rendement supérieur de la banque avant capture, indiquant une construction de banque et une efficacité d’amplification élevées. (B) Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist présente une plus grande complexité de banque que les kits concurrents. Cela permet d’obtenir plus de molécules d’ADN uniques séquençables dans la banque, réduisant ainsi les coûts de séquençage. (C) Offre une couverture supérieure.
Couverture uniforme avec moins de cibles manquées
La préparation de banque TrueAmp de Twist offre une meilleure uniformité de la couverture et moins de régions non couvertes. La réduction des abandons de cible augmente la confiance dans un séquençage systématique des régions critiques.
Figure 2. Comparaison des performances des banques enrichies avec des échantillons FFPE dégradés à faible entrée (DIN < 2,2) entre le kit de préparation de banque TrueAmp et le kit K concurrent, démontrant la solution optimale pour les applications d’échantillons difficiles.(A) Offre une excellente uniformité de la couverture, mesurée par une pénalité de base multipliée par 80 inférieure. (B) Réduction des régions sans couverture, mesurée par le pourcentage de couverture zéro.
Couverture améliorée dans les environnements GC extrêmes
Le mélange de polymérase TrueAmp de Twist offre une couverture plus uniforme dans les régions à haute et basse teneur en GC, préservant ses performances même avec un cycle PCR accru.
Figure 3. Trace de biais GC normalisée montrant une meilleure couverture de la polymérase TrueAmp de Twist. Les banques ont été préparées à l’aide du kit de préparation de banque TrueAmp de Twist et amplifiées avec différents cycles et polymérases.
Panel supérieur :Couverture normalisée par rapport aux tracés de fenêtre GC comparant les polymérases à 3 cycles de PCR.
Panel inférieur : Couverture normalisée par rapport aux tracés de fenêtre GC comparant les polymérases à 16 cycles de PCR.
Conçu pour assurer la cohérence entre les entrées et les flux de travail
Les kits de préparation de banque TrueAmp de Twist offrent des tailles de fragments de banque d’ADN cohérentes sur une large gamme d’entrées d’échantillons, permettant des flux de travail d’entrée mixtes tout en maintenant une couverture uniforme et des résultats reproductibles à l’échelle.
Figure 4. Taille fiable de la banque avec le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist, même à partir d’entrées ultra-faibles.
500 ng, 100 ng, 50 ng, 10 ng, 1 ng et 0,1 ng (ADNg) ont été fragmentés sur divers temps à 32 °C. 3, 5, 6, 8, 10 et 14 cycles de PCR ont respectivement été utilisés pour l’amplification. Les échantillons ont été effectués en double exemplaire.
A : Électrophérogrammes des banques NGS générés avec le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist.
B : Concentration des banques après amplification pour diverses entrées d’ADN.
Tailles d’insert contrôlées pour des performances réglables
Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist offre des tailles de fragments de banques d’ADN reproductibles sur une large gamme de quantités d’entrées, renforçant la confiance dans les résultats de séquençage et l’analyse en aval.
Figure 5. Ajustement du kit de préparation de banque TrueAmp de Twist.
A : Cinq électrophérogrammes de banques NGS générés à l’aide de temps de fragmentation différents. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur plusieurs temps à 32 °C. 6 cycles de PCR ont été utilisés pour l’amplification.
B : Taille médiane de l’insert par rapport au temps. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur divers temps à 32 °C. L’amplification a été réalisée à l’aide de 6 cycles de PCR. Les échantillons ont été capturés à l’aide du panel Exome 2.0 de Twist.
Mode de fonctionnement
Étape 
Fragmentation enzymatique
L’ADN d’échantillon extrait est fragmenté avec précision, produisant des tailles d’insert homogènes et ajustables.
Étape 
Ligature de l’adaptateur
La ligase Twist optimisée permet de maximiser l’efficacité de conversion et de minimiser les biais de ligature.
Étape 
Amplification par polymérase TrueAmp
L’amplification haute fidélité permet des rendements élevés dans des régions difficiles et augmente la puissance de détection des variants.
Données produit
Figure 1. Comparaison des performances des banques enrichies avec des échantillons FFPE dégradés à faible entrée (DIN < 2,2) entre le kit de préparation de banque TrueAmp et le kit K concurrent, démontrant la solution optimale pour les applications d’échantillons difficiles. (A) Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist génère un rendement supérieur de la banque avant capture, indiquant une construction de banque et une efficacité d’amplification élevées. (B) Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist présente une plus grande complexité de banque que les kits concurrents. Cela permet d’obtenir plus de molécules d’ADN uniques séquençables dans la banque, réduisant ainsi les coûts de séquençage. (C) Offre une couverture supérieure.
Figure 2.Comparaison des performances des banques enrichies avec des échantillons FFPE dégradés à faible entrée (DIN < 2,2) entre le kit de préparation de banque TrueAmp et le kit K concurrent, démontrant la solution optimale pour les applications d’échantillons difficiles. (A) Offre une excellente uniformité de la couverture, mesurée par une pénalité de base fold-80 inférieure. (B) Réduction des régions sans couverture, mesurée par le pourcentage de couverture zéro.
Figure 3.Trace de biais GC normalisée montrant une meilleure couverture de la polymérase TrueAmp de Twist. Les banques ont été préparées à l’aide du kit de préparation de banque TrueAmp de Twist et amplifiées avec différents cycles et polymérases.
Panel supérieur : Couverture normalisée par rapport aux tracés de fenêtre GC comparant les polymérases à 3 cycles de PCR.
Panel inférieur : Couverture normalisée par rapport aux tracés de fenêtre GC comparant les polymérases à 16 cycles de PCR.
Figure 4. Taille fiable de la banque avec le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist, même à partir d’entrées ultra-faibles.
500 ng, 100 ng, 50 ng, 10 ng et 1 ng (ADNg) ont été fragmentés à 32 °C. 3, 5, 6, 8, 10 et 14 cycles de PCR ont respectivement été utilisés pour l’amplification. Les échantillons ont été effectués en double exemplaire.
A : Électrophérogrammes des banques NGS générés avec le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist.
B : Concentration des banques après amplification pour diverses entrées d’ADN.
Figure 5. Ajustement du kit de préparation de banque TrueAmp de Twist.
A : Cinq électrophérogrammes de banques NGS générés à l’aide de temps de fragmentation différents. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur plusieurs temps à 32 °C. 6 cycles de PCR ont été utilisés pour l’amplification.
B : Taille médiane de l’insert par rapport au temps. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur divers temps à 32 °C. L’amplification a été réalisée à l’aide de 6 cycles de PCR. Les échantillons ont été capturés à l’aide du panel Exome 2.0 de Twist.
Données produit
Rendement et couverture élevés là où les échantillons sont les plus difficiles
La préparation de banque TrueAmp de Twist offre un rendement de pré-capture plus élevé, des tailles de banques cohérentes et une couverture cible moyenne plus forte à partir d’ADN FFPE dégradé à faible entrée. Ces gains réduisent le besoin de cycles PCR excessifs, préservent la complexité de la banque et augmentent la fiabilité des résultats de séquençage des échantillons difficiles.
Figure 1. Comparaison des performances des banques enrichies avec des échantillons FFPE dégradés à faible entrée (DIN < 2,2) entre le kit de préparation de banque TrueAmp et le kit K concurrent, démontrant la solution optimale pour les applications d’échantillons difficiles. (A) Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist génère un rendement supérieur de la banque avant capture, indiquant une construction de banque et une efficacité d’amplification élevées. (B) Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist présente une plus grande complexité de banque que les kits concurrents. Cela permet d’obtenir plus de molécules d’ADN uniques séquençables dans la banque, réduisant ainsi les coûts de séquençage. (C) Offre une couverture supérieure.
Couverture uniforme avec moins de cibles manquées
La préparation de banque TrueAmp de Twist offre une meilleure uniformité de la couverture et moins de régions non couvertes. La réduction des abandons de cible augmente la confiance dans un séquençage systématique des régions critiques.
Figure 2. Comparaison des performances des banques enrichies avec des échantillons FFPE dégradés à faible entrée (DIN < 2,2) entre le kit de préparation de banque TrueAmp et le kit K concurrent, démontrant la solution optimale pour les applications d’échantillons difficiles.(A) Offre une excellente uniformité de la couverture, mesurée par une pénalité de base multipliée par 80 inférieure. (B) Réduction des régions sans couverture, mesurée par le pourcentage de couverture zéro.
Couverture améliorée dans les environnements GC extrêmes
Le mélange de polymérase TrueAmp de Twist offre une couverture plus uniforme dans les régions à haute et basse teneur en GC, préservant ses performances même avec un cycle PCR accru.
Figure 3. Trace de biais GC normalisée montrant une meilleure couverture de la polymérase TrueAmp de Twist. Les banques ont été préparées à l’aide du kit de préparation de banque TrueAmp de Twist et amplifiées avec différents cycles et polymérases.
Panel supérieur :Couverture normalisée par rapport aux tracés de fenêtre GC comparant les polymérases à 3 cycles de PCR.
Panel inférieur : Couverture normalisée par rapport aux tracés de fenêtre GC comparant les polymérases à 16 cycles de PCR.
Conçu pour assurer la cohérence entre les entrées et les flux de travail
Les kits de préparation de banque TrueAmp de Twist offrent des tailles de fragments de banque d’ADN cohérentes sur une large gamme d’entrées d’échantillons, permettant des flux de travail d’entrée mixtes tout en maintenant une couverture uniforme et des résultats reproductibles à l’échelle.
Figure 4. Taille fiable de la banque avec le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist, même à partir d’entrées ultra-faibles.
500 ng, 100 ng, 50 ng, 10 ng, 1 ng et 0,1 ng (ADNg) ont été fragmentés sur divers temps à 32 °C. 3, 5, 6, 8, 10 et 14 cycles de PCR ont respectivement été utilisés pour l’amplification. Les échantillons ont été effectués en double exemplaire.
A : Électrophérogrammes des banques NGS générés avec le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist.
B : Concentration des banques après amplification pour diverses entrées d’ADN.
Tailles d’insert contrôlées pour des performances réglables
Le kit de préparation de banque TrueAmp de Twist offre des tailles de fragments de banques d’ADN reproductibles sur une large gamme de quantités d’entrées, renforçant la confiance dans les résultats de séquençage et l’analyse en aval.
Figure 5. Ajustement du kit de préparation de banque TrueAmp de Twist.
A : Cinq électrophérogrammes de banques NGS générés à l’aide de temps de fragmentation différents. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur plusieurs temps à 32 °C. 6 cycles de PCR ont été utilisés pour l’amplification.
B : Taille médiane de l’insert par rapport au temps. 50 ng d’ADNg de haute qualité ont été fragmentés sur divers temps à 32 °C. L’amplification a été réalisée à l’aide de 6 cycles de PCR. Les échantillons ont été capturés à l’aide du panel Exome 2.0 de Twist.
Mode de fonctionnement
Étape
Fragmentation enzymatique
L’ADN d’échantillon extrait est fragmenté avec précision, produisant des tailles d’insert homogènes et ajustables.
Étape
Ligature de l’adaptateur
La ligase Twist optimisée permet de maximiser l’efficacité de conversion et de minimiser les biais de ligature.
Étape
Amplification par polymérase TrueAmp
L’amplification haute fidélité permet des rendements élevés dans des régions difficiles et augmente la puissance de détection des variants.
Ressources mises en évidence
Fiche produit
Protocole
Ressources mises en évidence
Flux de travail et applications connexes
Les flux de travail d’enrichissement ciblé avec Twist offrent une couverture évolutive, à faible biais et hautement uniforme dans les grandes régions génomiques complexes, permettant une découverte plus large, une sensibilité plus élevée et une plus grande flexibilité que les méthodes basées sur amplicon ou sur matrice.
Twist propose plusieurs outils pour soutenir la recherche par biopsies liquides et la caractérisation précoce du cancer.
Flux de travail et applications connexes
Les flux de travail d’enrichissement ciblé avec Twist offrent une couverture évolutive, à faible biais et hautement uniforme dans les grandes régions génomiques complexes, permettant une découverte plus large, une sensibilité plus élevée et une plus grande flexibilité que les méthodes basées sur amplicon ou sur matrice.
Twist propose plusieurs outils pour soutenir la recherche par biopsies liquides et la caractérisation précoce du cancer.
