Conçu pour les flux de travail NGS
Conçue pour l’amplification de banque NGS, la polymérase TrueAmp de Twist offre une couverture uniforme dans les extrêmes GC, une sensibilité élevée à partir d’une faible entrée et des performances de démarrage à chaud prêtes pour l’automatisation.
TrueAmp maintient la couverture là où d'autres arrêtent, améliorant ainsi l'économie du séquençage et préservant les cibles difficiles.
Avec une efficacité améliorée, TrueAmp peut atteindre les objectifs de rendement en moins de cycles, limitant ainsi les artefacts induits par le cycle. Il reste robuste pour les banques à faible rendement typiques de la PCR post-capture.
Une polymérase de relecture technique réduit les erreurs d’incorporation de C→T souvent causées par la désamination à la cytosine et limite le glissement sur les homopolymères longs, ce qui est essentiel pour la détection des variants sensibles.
Des billes magnétiques sont largement utilisées pour la purification et la sélection des tailles, mais elles peuvent inhiber la PCR et réduire les rendements.
Figure 1. Couverture normalisée par GC ; C. difficile riche en AT et B. pertussis riche en GC.
Figure 2. Dilutions en série de 1 ng à 100 fg, Qubit et TapeStation QC.
Figure 3. Taux de substitution après > 7 millions d’incorporations de base ; lecture de l’homopolymère à l’aide de plasmides clonaux Twist.
Figure 4. Tolérance aux billes paramagnétiques pendant la PCR. Les réactions PCR ont été enrichies avec 6,25 μl, 12,5 μl, 25 μl et 50 μl de billes MyOne T1, de billes M270 (Invitrogen) et de billes de purification d’ADN de Twist. Les réactions ont été purifiées après le retrait des billes et quantifiées grâce à l’analyse Qubit dsDNA Broad Range.
TrueAmp maintient la couverture là où d'autres arrêtent, améliorant ainsi l'économie du séquençage et préservant les cibles difficiles.
Figure 1. Couverture normalisée par GC ; C. difficile riche en AT et B. pertussis riche en GC.
Avec une efficacité améliorée, TrueAmp peut atteindre les objectifs de rendement en moins de cycles, limitant ainsi les artefacts induits par le cycle. Il reste robuste pour les banques à faible rendement typiques de la PCR post-capture.
Figure 2. Dilutions en série de 1 ng à 100 fg, Qubit et TapeStation QC.
Une polymérase de relecture technique réduit les erreurs d’incorporation de C→T souvent causées par la désamination à la cytosine et limite le glissement sur les homopolymères longs, ce qui est essentiel pour la détection des variants sensibles.
Figure 3. Taux de substitution après > 7 millions d’incorporations de base ; lecture de l’homopolymère à l’aide de plasmides clonaux Twist.
Des billes magnétiques sont largement utilisées pour la purification et la sélection des tailles, mais elles peuvent inhiber la PCR et réduire les rendements.
Figure 4. Tolérance aux billes paramagnétiques pendant la PCR. Les réactions PCR ont été enrichies avec 6,25 μl, 12,5 μl, 25 μl et 50 μl de billes MyOne T1, de billes M270 (Invitrogen) et de billes de purification d’ADN de Twist. Les réactions ont été purifiées après le retrait des billes et quantifiées grâce à l’analyse Qubit dsDNA Broad Range.
De nombreuses enzymes PCR sont optimisées pour les tâches à amplicon unique (qPCR, clonage) plutôt que pour les banques NGS complexes.
TrueAmp modifie l’approche
Une ADN polymérase haute processivité de relecture technique qui offre une uniformité, un rendement et une fidélité GC de premier ordre pour l’amplification de la banque.
Le résultat
Moins de biais vers les molécules courtes neutres en GC et plus de données utilisables par cycle.
Les principales caractéristiques comprennent ce qui suit :
Les kits de préparation de banque de Twist rationalisent la construction de banques d’ADN de haute qualité pour le NGS en combinant les principales étapes de préparation en une réaction efficace unique.
Les panels NGS personnalisés de Twist vous permettent d’aller au-delà des solutions prêtes à l’emploi, vous offrant un contrôle total sur ce que vous séquencez.
Les kits de préparation de banque de Twist rationalisent la construction de banques d’ADN de haute qualité pour le NGS en combinant les principales étapes de préparation en une réaction efficace unique.
Le panel ADN CGP de Twist permet une détection complète des SNV, des indels, des altérations du nombre de copies et des réarrangements génétiques, offrant une large couverture mutationnelle en une seule analyse.
Le panel MRD Rapid 500 de Twist est une solution évolutive d’enrichissement ciblé pour les maladies résiduelles minimes, permettant une large couverture génomique avec des panels allant de 50 à 500 sondes.
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