Matériel de référence synthétique de haute sensibilité pour le développement d'analyses de biopsie liquide et le contrôle du processus
Le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 est un outil complet créé pour aider les chercheurs à développer et à contrôler la qualité des variants cliniquement pertinents pour le développement d'analyses par NGS. En outre, les chercheurs peuvent utiliser ces modèles de référence pour définir deux paramètres analytiques essentiels : la limite de détection (LoD) et la limite de blanc (LoB) pour leurs analyses. Composé d’ADN acellulaire (cfDNA) résiduel de type sauvage (WT) provenant d'une lignée cellulaire et d'oligonucléotides synthétiques porteurs d'allèles mutants, ce matériel de référence offre la précision et la sensibilité nécessaires à la recherche sur le développement d'analyses de biopsie liquide.
Large couverture des variants
Le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 offre un large éventail de variants de l'ADN tumoral circulant (ctDNA). Ces variants reflètent de manière très proche la taille et la distribution des fragments d’ADN acellulaire (cfDNA), ce qui en fait un outil indispensable pour simuler avec précision des scénarios du monde réel. Il comprend des variants imprimés synthétiquement, notamment des variants d’un seul nucléotide (SNV), des insertions-suppressions (INDEL) et des variants structurels (SV).
Sites à variants complets
Avec plus de 400 sites de variants couvrant 84 gènes, y compris des variants cliniquement pertinents sélectionnés dans la littérature, ce modèle de référence favorise une approche complète de l'analyse de l’ADN acellulaire (cfDNA). Il permet aux chercheurs de détecter un large éventail de variations génétiques associées au cancer.
Renforcer la mise en place de la LdD et de la LdB
Le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 est méticuleusement conçu pour vous aider à déterminer la limite de détection analytique (LoD) et la limite de blanc (LoB) de vos analyses. Cette capacité critique peut vous permettre de définir les niveaux détectables les plus bas des variants cibles et d'établir une base de référence pour la sensibilité de l'analyse.
Faible taux d'erreur résiduel
Les analyses comparatives démontrent que le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 présente un taux d'erreur nettement inférieur à celui de son prédécesseur (v1) et à celui d'autres produits concurrents.
Compatibilité et polyvalence
Le modèle de référence d'ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 s'intègre parfaitement à la suite de systèmes d'enrichissement ciblé et de panels de capture personnalisés de Twist. L’ensemble du modèle de référence d'ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 se compose de 7 tubes individuels contenant 300 ng par tube de chacune des 7 différentes VAF : 0 % (WT), 0,1 %, 0,25 %, 0,5 %, 1 %, 2 %, 5 %. Twist offre également chaque VAF individuelle dans une configuration plus petite à 600 ng et plus grande à 3 ng.
*Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Ne pas utiliser dans les procédures diagnostiques ou cliniques.
Matériel de référence synthétique de haute sensibilité pour le développement d'analyses de biopsie liquide et le contrôle du processus
Le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 est un outil complet créé pour aider les chercheurs à développer et à contrôler la qualité des variants cliniquement pertinents pour le développement d'analyses par NGS. En outre, les chercheurs peuvent utiliser ces modèles de référence pour définir deux paramètres analytiques essentiels : la limite de détection (LoD) et la limite de blanc (LoB) pour leurs analyses. Composé d’ADN acellulaire (cfDNA) résiduel de type sauvage (WT) provenant d'une lignée cellulaire et d'oligonucléotides synthétiques porteurs d'allèles mutants, ce matériel de référence offre la précision et la sensibilité nécessaires à la recherche sur le développement d'analyses de biopsie liquide.
Large couverture des variants
Le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 offre un large éventail de variants de l'ADN tumoral circulant (ctDNA). Ces variants reflètent de manière très proche la taille et la distribution des fragments d’ADN acellulaire (cfDNA), ce qui en fait un outil indispensable pour simuler avec précision des scénarios du monde réel. Il comprend des variants imprimés synthétiquement, notamment des variants d’un seul nucléotide (SNV), des insertions-suppressions (INDEL) et des variants structurels (SV).
Sites à variants complets
Avec plus de 400 sites de variants couvrant 84 gènes, y compris des variants cliniquement pertinents sélectionnés dans la littérature, ce modèle de référence favorise une approche complète de l'analyse de l’ADN acellulaire (cfDNA). Il permet aux chercheurs de détecter un large éventail de variations génétiques associées au cancer.
Renforcer la mise en place de la LdD et de la LdB
Le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 est méticuleusement conçu pour vous aider à déterminer la limite de détection analytique (LoD) et la limite de blanc (LoB) de vos analyses. Cette capacité critique peut vous permettre de définir les niveaux détectables les plus bas des variants cibles et d'établir une base de référence pour la sensibilité de l'analyse.
Faible taux d'erreur résiduel
Les analyses comparatives démontrent que le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 présente un taux d'erreur nettement inférieur à celui de son prédécesseur (v1) et à celui d'autres produits concurrents.
Compatibilité et polyvalence
Le modèle de référence d'ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 s'intègre parfaitement à la suite de systèmes d'enrichissement ciblé et de panels de capture personnalisés de Twist. L’ensemble du modèle de référence d'ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer Twist v2 se compose de 7 tubes individuels contenant 300 ng par tube de chacune des 7 différentes VAF : 0 % (WT), 0,1 %, 0,25 %, 0,5 %, 1 %, 2 %, 5 %. Twist offre également chaque VAF individuelle dans une configuration plus petite à 600 ng et plus grande à 3 ng.
*Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Ne pas utiliser dans les procédures diagnostiques ou cliniques.
Analyse des fragments d'ADN du modèle de référence Twist cfDNA Pan-cancer Twist v2, ADN acellulaire (cfDNA) natif et modèles de référence concurrents égalisés pour la hauteur maximale des pics. La distribution de taille des modèles Twist est similaire à celle de l'ADN acellulaire natif, avec notamment un pic mononucléosomique et un pic dinucléosomique proéminents.
Les molécules d'ADN d’un variant s'étendent sur le locus génomique du variant (ligne pointillée violette avec étoile) avec un chevauchement important, offrant une couverture élevée, une diversité de fragments et une diversité de localisation du site du variant par rapport aux extrémités de la molécule d'ADN.
L'analyse des taux de mutation résiduelle est définie comme le taux de variants non germinaux détectés dans les lectures consensuelles duplex à partir d'un échantillon WT enrichi en cibles, et a été réalisée sur le modèle d'ADN acellulaire Twist v2, d'ADN cellulaire natif, un modèle d'ADN concurrent et le modèle d'ADN acellulaire Twist v1. Le taux d'erreur résiduelle de Pan-Cancer Twist v2 est similaire à celui de l’ADN acellulaire natif et inférieur à celui de la version précédente v1 et des produits concurrents grâce à un processus de production de haute fidélité.
Visualisation de la taille de l'insertion ou de la suppression des INDELs inclus dans les modèles de référence via un histogramme aux barres d’une largeur de 1, où les nombres négatifs correspondent à des suppressions et les nombres positifs à des insertions. Les SNV ne sont pas représentés. Les INDEL inclus représentent un large éventail de tailles, ce qui permet une analyse étendue des performances de détection des INDEL. Les INDEL vont de la suppression de 30 pb à l'insertion de 15 pb.
Fréquence moyenne des allèles variants (VAF) détectés par NGS dans les différentes VAF des modèles de référence (représentée sur une échelle logarithmique). Les modèles de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer ont été capturés à l'aide d'un panel personnalisé ciblant 215 variants d’un seul nucléotide (SNV) présents dans les modèles et séquencés à 80 000 fois la couverture brute avant la déduplication UMI. Les VAF moyennes détectées par NGS reflètent étroitement les VAF prévues pour tous les niveaux testés, ce qui facilite l'évaluation comparative des analyses.
Analyse des fragments d'ADN du modèle de référence Twist cfDNA Pan-cancer Twist v2, ADN acellulaire (cfDNA) natif et modèles de référence concurrents égalisés pour la hauteur maximale des pics. La distribution de taille des modèles Twist est similaire à celle de l'ADN acellulaire natif, avec notamment un pic mononucléosomique et un pic dinucléosomique proéminents.
Les molécules d'ADN d’un variant s'étendent sur le locus génomique du variant (ligne pointillée violette avec étoile) avec un chevauchement important, offrant une couverture élevée, une diversité de fragments et une diversité de localisation du site du variant par rapport aux extrémités de la molécule d'ADN.
L'analyse des taux de mutation résiduelle est définie comme le taux de variants non germinaux détectés dans les lectures consensuelles duplex à partir d'un échantillon WT enrichi en cibles, et a été réalisée sur le modèle d'ADN acellulaire Twist v2, d'ADN cellulaire natif, un modèle d'ADN concurrent et le modèle d'ADN acellulaire Twist v1. Le taux d'erreur résiduelle de Pan-Cancer Twist v2 est similaire à celui de l’ADN acellulaire natif et inférieur à celui de la version précédente v1 et des produits concurrents grâce à un processus de production de haute fidélité.
Visualisation de la taille de l'insertion ou de la suppression des INDELs inclus dans les modèles de référence via un histogramme aux barres d’une largeur de 1, où les nombres négatifs correspondent à des suppressions et les nombres positifs à des insertions. Les SNV ne sont pas représentés. Les INDEL inclus représentent un large éventail de tailles, ce qui permet une analyse étendue des performances de détection des INDEL. Les INDEL vont de la suppression de 30 pb à l'insertion de 15 pb.
Fréquence moyenne des allèles variants (VAF) détectés par NGS dans les différentes VAF des modèles de référence (représentée sur une échelle logarithmique). Les modèles de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-Cancer ont été capturés à l'aide d'un panel personnalisé ciblant 215 variants d’un seul nucléotide (SNV) présents dans les modèles et séquencés à 80 000 fois la couverture brute avant la déduplication UMI. Les VAF moyennes détectées par NGS reflètent étroitement les VAF prévues pour tous les niveaux testés, ce qui facilite l'évaluation comparative des analyses.
107576
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 Ensemble, kit 300 ng107577
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0 % (WT), 3 ug107578
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,1 %, 3 ug107579
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,25 %, 3 ug107580
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,5 %, 3 ug107581
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 1 %, 3 ug107582
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 2 %, 3 ug107583
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 5 %, 3 ug107584
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0%, 600 ng107585
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,1%, 600 ng107586
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,25 %, 600 ng107587
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,5%, 600 ng107588
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 1%, 600 ng107589
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 2%, 600 ng107590
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 5%, 600 ng*Le kit inclut 7 VAF individuellement : 0 % (P), 0,1 %, 0,25 %, 0,5 %, 1 %, 2 %, 5 % à 300 ng pour chaque tube
*Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Ne pas utiliser dans les procédures diagnostiques ou cliniques.
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Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 Ensemble, kit 300 ng107577
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0 % (WT), 3 ug107578
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,1 %, 3 ug107579
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,25 %, 3 ug107580
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,5 %, 3 ug107581
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 1 %, 3 ug107582
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 2 %, 3 ug107583
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 5 %, 3 ug107584
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0%, 600 ng107585
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,1%, 600 ng107586
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,25 %, 600 ng107587
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 0,5%, 600 ng107588
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 1%, 600 ng107589
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 2%, 600 ng107590
Modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2 VAF 5%, 600 ng*Le kit inclut 7 VAF individuellement : 0 % (P), 0,1 %, 0,25 %, 0,5 %, 1 %, 2 %, 5 % à 300 ng pour chaque tube
*Réservé à l’utilisation dans le cadre de la recherche. Ne pas utiliser dans les procédures diagnostiques ou cliniques.
Fichiers de données
Liste des variants du modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist V2 : Au format .VCF et Excel
Article
FAQ sur le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2
Fichiers de données
Liste des variants du modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist V2 : Au format .VCF et Excel
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FAQ sur le modèle de référence d’ADN acellulaire (cfDNA) Pan-cancer Twist v2
