Amplification à faible biais et haute fidélité conçue pour les flux de travail NGS.
Conçue pour l’amplification de banque NGS, la polymérase TrueAmp de Twist offre une couverture uniforme dans les extrêmes GC, une sensibilité élevée à partir d’une faible entrée et des performances de démarrage à chaud prêtes pour l’automatisation.
Amplification conçue pour préserver la complexité de la banque.
De nombreuses enzymes PCR sont optimisées pour les tâches à amplicon unique (qPCR, clonage) plutôt que pour les banques NGS complexes.
TrueAmp modifie l’approche
Une ADN polymérase haute processivité de relecture technique qui offre une uniformité, un rendement et une fidélité GC de premier ordre pour l’amplification de la banque.
Le résultat
Moins de biais vers les molécules courtes neutres en GC et plus de données utilisables par cycle.
Les principales caractéristiques comprennent ce qui suit :
- Un tube unique 2× mélange maître simplifie la configuration et réduit les erreurs de manipulation
- Compatible avec l’amplification pré-capture et post-capture
- Conçu pour les flux de travail d’hybridation le jour même ou du jour au lendemain en plus des kits Twist TE
- Validé avec les réactifs de préparation et d’enrichissement de la banque Twist pour maintenir la cohérence des performances de bout en bout
L’ADNlc de Twist avec le kit de préparation de banque de polymérase TrueAmp permet des performances robustes à partir d’échantillons à faible entrée
Amplification à faible biais et haute fidélité conçue pour les flux de travail NGS.
Conçue pour l’amplification de banque NGS, la polymérase TrueAmp de Twist offre une couverture uniforme dans les extrêmes GC, une sensibilité élevée à partir d’une faible entrée et des performances de démarrage à chaud prêtes pour l’automatisation.
L’ADNlc de Twist avec le kit de préparation de banque de polymérase TrueAmp permet des performances robustes à partir d’échantillons à faible entrée
Amplification conçue pour préserver la complexité de la banque.
De nombreuses enzymes PCR sont optimisées pour les tâches à amplicon unique (qPCR, clonage) plutôt que pour les banques NGS complexes.
TrueAmp modifie l’approche
Une ADN polymérase haute processivité de relecture technique qui offre une uniformité, un rendement et une fidélité GC de premier ordre pour l’amplification de la banque.
Le résultat
Moins de biais vers les molécules courtes neutres en GC et plus de données utilisables par cycle.
Les principales caractéristiques comprennent ce qui suit :
- Un tube unique 2× mélange maître simplifie la configuration et réduit les erreurs de manipulation
- Compatible avec l’amplification pré-capture et post-capture
- Conçu pour les flux de travail d’hybridation le jour même ou du jour au lendemain en plus des kits Twist TE
- Validé avec les réactifs de préparation et d’enrichissement de la banque Twist pour maintenir la cohérence des performances de bout en bout
TrueAmp maintient la couverture là où d'autres arrêtent, améliorant ainsi l'économie du séquençage et préservant les cibles difficiles.
Figure 1 : Couverture normalisée par GC ; C. difficile riche en AT et B. pertussis riche en GC.
Avec une efficacité améliorée, TrueAmp peut atteindre les objectifs de rendement en moins de cycles, limitant ainsi les artefacts induits par le cycle. Il reste robuste pour les banques à faible rendement typiques de la PCR post-capture.
Figure 2 : Dilutions en série de 1 ng à 100 fg, Qubit et TapeStation QC.
Une polymérase de relecture technique réduit les erreurs d’incorporation de C→T souvent causées par la désamination à la cytosine et limite le glissement sur les homopolymères longs, ce qui est essentiel pour la détection des variants sensibles.
Figure 3 : Taux de substitution après > 7 millions d’incorporations de base ; lecture de l’homopolymère à l’aide de plasmides clonaux Twist.
Des billes magnétiques sont largement utilisées pour la purification et la sélection des tailles, mais elles peuvent inhiber la PCR et réduire les rendements. Comme le montre la Figure 4, le mélange de polymérase TrueAmp de Twist maintient des nombres de lectures de séquençage plus élevés que les autres polymérases à travers des concentrations de billes croissantes (6,25–50 μl). Cette forte tolérance aux billes simplifie les flux de travail, réduit les reprises et garantit une qualité de données constante.
Figure 4. Tolérance aux billes paramagnétiques pendant la PCR. Les réactions PCR ont été enrichies avec 6,25 μl, 12,5 μl, 25 μl et 50 μl de billes MyOne T1, de billes M270 (Invitrogen) et de billes de purification d’ADN de Twist. Les réactions ont été purifiées après le retrait des billes et quantifiées grâce à l’analyse Qubit dsDNA Broad Range.
TrueAmp maintient la couverture là où d'autres arrêtent, améliorant ainsi l'économie du séquençage et préservant les cibles difficiles.
Figure 1 : Couverture normalisée par GC ; C. difficile riche en AT et B. pertussis riche en GC.
Avec une efficacité améliorée, TrueAmp peut atteindre les objectifs de rendement en moins de cycles, limitant ainsi les artefacts induits par le cycle. Il reste robuste pour les banques à faible rendement typiques de la PCR post-capture.
Figure 2 : Dilutions en série de 1 ng à 100 fg, Qubit et TapeStation QC.
Une polymérase de relecture technique réduit les erreurs d’incorporation de C→T souvent causées par la désamination à la cytosine et limite le glissement sur les homopolymères longs, ce qui est essentiel pour la détection des variants sensibles.
Figure 3 : Taux de substitution après > 7 millions d’incorporations de base ; lecture de l’homopolymère à l’aide de plasmides clonaux Twist.
Des billes magnétiques sont largement utilisées pour la purification et la sélection des tailles, mais elles peuvent inhiber la PCR et réduire les rendements. Comme le montre la Figure 4, le mélange de polymérase TrueAmp de Twist maintient des nombres de lectures de séquençage plus élevés que les autres polymérases à travers des concentrations de billes croissantes (6,25–50 μl). Cette forte tolérance aux billes simplifie les flux de travail, réduit les reprises et garantit une qualité de données constante.
Figure 4. Tolérance aux billes paramagnétiques pendant la PCR. Les réactions PCR ont été enrichies avec 6,25 μl, 12,5 μl, 25 μl et 50 μl de billes MyOne T1, de billes M270 (Invitrogen) et de billes de purification d’ADN de Twist. Les réactions ont été purifiées après le retrait des billes et quantifiées grâce à l’analyse Qubit dsDNA Broad Range.
La biopsie liquide permet une détection mini-invasive de biomarqueurs, tels que l’ADNlc et l’ARN, dans le sang, le plasma ou l’urine. Associée au NGS, elle fournit des informations extrêmement sensibles sur la progression de la maladie à partir d’échantillons limités et fragmentés.
Les progrès dans la préparation de banque continuent d’accroître les biomarqueurs détectables. La polymérase TrueAmp offre un rendement robuste, une amplification à faible biais et une haute fidélité pour les entrées d’ADNlc à faible entrée, ce qui permet d’optimiser les données utilisables pour ces flux de travail.
En savoir plus sur les avantages de la préparation de banque d’ADNlc avec la polymérase TrueAmp pour la recherche sur les biopsies liquides à faible entrée.
La biopsie liquide permet une détection mini-invasive de biomarqueurs, tels que l’ADNlc et l’ARN, dans le sang, le plasma ou l’urine. Associée au NGS, elle fournit des informations extrêmement sensibles sur la progression de la maladie à partir d’échantillons limités et fragmentés.
Les progrès dans la préparation de banque continuent d’accroître les biomarqueurs détectables. La polymérase TrueAmp offre un rendement robuste, une amplification à faible biais et une haute fidélité pour les entrées d’ADNlc à faible entrée, ce qui permet d’optimiser les données utilisables pour ces flux de travail.
En savoir plus sur les avantages de la préparation de banque d’ADNlc avec la polymérase TrueAmp pour la recherche sur les biopsies liquides à faible entrée.
Fiche produit
Protocole
