Le SARS-CoV-2, un virus à ARN à simple brin, est la cause de la pandémie de coronavirus en 2019/2020. La PCR à transcription inverse (RT-PCR) est une méthode permettant de détecter rapidement les cas de COVID-19 en utilisant des amorces pour amplifier les régions d’intérêt à partir du virus du SARS-CoV-2. Cependant, il existe également une demande pour des tests hautement sensibles capables de caractériser l’ensemble du génome viral, y compris les mutations, pour surveiller la propagation virale et l’évolution dans le temps. En réponse à ce besoin, nous avons conçu un panel de capture qui inclut des sondes ciblant le génome de référence du SARS-CoV-2 (MN908947.3) complet. Dans cette note d’application, nous prouvons que la détection est possible avec à peine 10 copies de matériel viral avec un facteur d’enrichissement > 100 000, une couverture du génome > 99,9 % à 1X ou plus après enrichissement, et une identification des mutations dans le contrôle MN908947.3 du SARS-CoV-2.