Les infections par de nouvelles espèces et souches virales font peser une menace grave et récurrente sur la santé publique dans le monde. Répondre à ces menaces dépend essentiellement de la capacité à identifier l’agent viral et à développer des tests pour ce dernier, ce qui représente un défi majeur du fait des régions de séquence diverses et évoluant rapidement des virus humains. Le problème est encore aggravé par de nouvelles infections provenant de virus animaux pouvant avoir peu de similitudes de séquence avec les espèces infectieuses connues pour les humains. En théorie, les méthodes de séquençage de nouvelle génération (NGS) peuvent détecter des agents viraux entièrement nouveaux. Leur application est cependant limitée par la contamination provenant des lectures d’hôtes, ce qui nécessite une portée de séquençage importante pour obtenir une couverture complète de la matrice virale. Nous décrivons ici le Twist Comprehensive Viral Research Panel, une solution d’enrichissement ciblé basé sur hybridation capable de détecter des souches de virus hautement divergentes. Nos résultats montrent que le Twist Comprehensive Viral Research Panel est une solution polyvalente pour la découverte et la surveillance de nouveaux virus.