Ce protocole détaille les étapes nécessaires pour préparer des banques avec des identifiants moléculaires uniques (UMI). Il prend en charge divers types d’entrée, y compris les petits fragments d’ADN, comme l’ADN sans cellules (cfDNA), et l’ADN génomique de poids moléculaire élevé (gDNA). Le flux de travail génère des banques amplifiées et indexées avec des étiquettes UMI pour l’enrichissement ciblé en aval et le séquençage sur les systèmes de séquençage de nouvelle génération (NGS) d’Illumina. Les produits nécessaires à ce flux de travail comprennent le kit de préparation de banque Twist avec Amp Mix, la fragmentation mécanique et le système d’adaptateurs Twist UMI (comprend les adaptateurs Twist UMI et les amorces Twist Unique Dual Indexed (UDI)). Le protocole de préparation de banque est optimisé en vue d’une utilisation avec les kits d’enrichissement ciblé Twist Target Enrichment Kits et il ne doit être appliqué qu’avec les réactifs spécifiés ou avec leurs équivalents.

Ce kit de préparation de banques Twist fournit les réactifs nécessaires à la préparation de banques d’ADN génomique (ADNg) utilisant une fragmentation d’ADNg enzymatique et des identifiants moléculaires uniques (UMI). Le Twist UMI Adapter system se compose de Twist UMI Adapters et de Twist Unique Dual Indexed (UDI) Primers. Ce manuel explique en détail la procédure utilisée pour produire les banques amplifiées et indexées avec des étiquettes UMI pour l’enrichissement ciblé en aval et le séquençage sur les systèmes de séquençage de nouvelle génération (NGS) d’Illumina. Le protocole de préparation de banque est optimisé en vue d’une utilisation avec les kits d’enrichissement ciblé Twist Target Enrichment Kits et il ne doit être appliqué qu’avec les réactifs spécifiés ou avec leurs équivalents.

TWT : préparation et ajout du mélange maître de fragmentation EF 2.0 à l’échantillon