Lien entre les génotypes de caractère végétal et les phénotypes grâce au skim sequencing du génome entier

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Présenté par
Jason Johns
Jason Johns
PhD Candidate, UC Santa Barbara

Abordés dans ce webinaire
Des cartes génétiques de grande qualité peuvent être élaborées de manière efficace par skim sequencing du génome entier.
Les cartes génétiques et l’analyse des loci QTL peuvent être utilisées pour identifier les régions génomiques responsables des phénotypes
Grâce à la méthode Twist de préparation de la banque, les marqueurs génétiques de criblage sont efficaces et rentables dans de nombreux échantillons

One of the primary applications of genomics is to connect genotype to phenotype. Linkage mapping utilizes recombination to identify regions of the genome that code for traits of interest. Our lab has used the cost-effective high-throughput Twist 96-Plex Library Prep (Riptide) kit in multiple crosses to perform whole-genome skim sequencing and create high-quality genetic maps. These genetic maps have been used to identify regions of the genome and, using quantitative trait locus (QTL) analysis, specific candidate genes responsible for various plant traits. I will demonstrate our process from raw genomic DNA to a genetic map and QTL. This process can be applied to and adapted for any diploid system.

 

* Les résultats présentés sont ceux de l’institution dans laquelle ils ont été obtenus et peuvent ne pas refléter les résultats réalisables dans d’autres institutions.

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