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Découverte de paires de paralogues létaux synthétiques dans le génome humain
Découverte de paires de paralogues létaux synthétiques dans le génome humain
Présenté par
Phoebe Parrish
Étudiante diplômée, Centre de recherche sur le cancer Fred Hutchinson
RECORDED AT Writing the Future of Drug Discovery
Abordés dans ce webinaire
Comment les phénotypes d’invalidation d'un seul gène peuvent être masqués par la redondance entre des gènes apparentés
Développement de pgPEN, une approche d’invalidation simple et double de CRISPR-Cas9 groupée ciblant plus de 2 000 paralogues humains
Les résultats montrent que 12 % des paralogues humains présentent une létalité synthétique dans au moins un contexte
CRISPR screens have accelerated the discovery of important cancer vulnerabilities. However, single gene knockout phenotypes can be masked by redundancy among related genes. To address this issue we developed pgPEN, a pooled CRISPR-Cas9 single and double knockout approach targeting over 2,000 human paralogs. We applied pgPEN to two cell lines and discovered that 12% of human paralogs exhibit synthetic lethality in at least one context. We recovered known synthetic lethal paralogs MEK1/MEK2, important drug targets CDK4/CDK6, and other synthetic lethal pairs including CCNL1/CCNL2. These findings nominate drug targets to help expand targeted therapy options for cancer.
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